前言
新使生物自2023年9月推出國內首款超高分辨率專業翻譯組QEZ-seq?建庫試劑盒以來,收到了大量國內外科研學者的好評及建議,在此詳細介紹我們的產品及特點
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技術背景
全新的翻譯組建庫技術QEZ-seq?源自美國Cornell大學,由美國EzraBio Inc.和中國新使生物科技有限公司合作開發轉化
圖1. 新使生物翻譯組試劑盒
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技術原理
Ribo-seq通過捕獲核糖體保護的mRNA片段進行文庫構建,獲取翻譯事件的足跡信息,對翻譯過程進行研究
圖2. 翻譯組文庫原理
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技術優勢
圖3. 技術對比
1. 適用于多物種樣本
新使生物QEZ-seq? 1.0試劑盒配有專門針對哺乳動物、植物和真菌的裂解液,無需進行復雜的樣品處理,讓每個研究者都能快速上手
2. 無需使用專業設備
不再依賴蔗糖梯度制備儀,超速離心機和核糖體分選儀,讓無經驗的研究者也能快速進行樣本處理
(傳統的Ribo-seq樣品處理步驟復雜,需要有經驗的實驗室及專業的設備支撐)
3. 超快速文庫構建
只需2小時即可完成cDNA文庫構建,至最終產物回收最快只需4-6小時即可完成
(傳統的Ribo-seq建庫周期需要5-7天時間,步驟繁冗復雜)
4. 全程單管反應
文庫構建全程在單個試管內進行,直接添加,簡單易上手,減少被污染的風險
(傳統的Ribo-seq需要不斷切膠回收并更換反應管)
5. 可針對微量細胞
目前穩定最低只需200個細胞量的RNA(以小鼠卵母細胞為例)即可完成cDNA文庫構建,有助于生殖發育學、神經生物學等領域的研究
(傳統的Ribo-seq初始樣品細胞量需要 ≥ 5×106 ~ 1×107)
6. 超高分辨率
A. 5'端剪切精度更高
QEZ-seq? 1.0技術專為翻譯組分析而開發,不同于轉錄組Small RNA-seq建庫方法(圖f),我們的文庫在5'端具有更高的精度,不會受到建庫過程中堿基偏好性的影響(圖h)
圖4. 各類具有代表性的Ribo-seq數據集5'端精度比較
(h圖為我們的技術)
B. 單堿基分辨率更高
QEZ-seq? 1.0技術擁有單堿基的分辨率,三核苷酸周期性≥70%,極大地提高了核糖體印跡的精準度,適用于各種核糖體相關的分析
(傳統的Ribo-seq在分辨率普遍較低,三核苷酸周期性只能達到40%-50%)
圖5. QEZ-seq? 1.0質控
圖6. QEZ-seq? 1.0質控
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實測數據展示
圖7. 全基因組的覆蓋度
圖8. 比對到基因組的read長度分布
圖9. 三核苷酸周期性
圖10. 5' offset
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我們的服務
我們除了提供專業翻譯組試劑盒,同時也為廣大科研客戶提供全套服務項目,流程包括:
1. 樣品處理
只需將樣品快速冷凍,干冰運輸寄給我們,我們負責樣品處理及質檢等后續全部事項
2. 文庫構建
我們的服務包括翻譯組Ribo-seq + 轉錄組RNA-seq
3. 深度測序
我們向客戶保證有效數據量而非單純下機數據量,不用擔心測序量的問題
4. 數據分析
包含10-12項標準化分析,滿足大部分客戶的需求,也可按客戶要求進行個性化定制分析
圖11. 標準化分析項目
圖12. 個性化分析項目
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部分數據展示:
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有任何問題請咨詢:
新使生物官方網站:www.neoribo.com
銷售區域:亞太地區、美國
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