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Cell?|?蘇曉東課題組與合作者揭示AAV與新型受體(AAVR2)結(jié)合的分子機(jī)制

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腺相關(guān)病毒AAV) 作為基因治療的 載體已被 許多國(guó)家 批準(zhǔn)用于治療多種遺傳疾病,包括視網(wǎng)膜色素變性、脊髓性肌萎縮癥、杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良和血友病,并在臨床上取得 了 顯著 的 療效。這些成功案例 是 建立在AAV能夠在 人類的 多種組織中實(shí)現(xiàn)安全且高效轉(zhuǎn)導(dǎo)的基礎(chǔ)上 ,也使得AAV成為目前最為廣泛地應(yīng)用于臨床的人類病毒載體 。

根據(jù)病毒 衣殼 蛋白 的氨基酸序列和 三維 結(jié)構(gòu),AAV被劃分為六個(gè)主要譜系(Clade A–F)。不同血清型展示出獨(dú)特的細(xì)胞/組織嗜性,因此可用于靶向多種組織和疾病類型。其組織選擇性主要由衣殼與宿主蛋白(尤其是細(xì)胞受體)的相互作用所決定。其中,多血清型AAV受體AAVR(KIAA0319L)被證明是大多數(shù)AAV天然或人工血清型轉(zhuǎn)導(dǎo)所必需的關(guān)鍵受體1。 不過(guò),越來(lái)越多 的 研究指出,AAV的組織特異性可能涉及其他受體或輔助因子,并且部分AAV血清型的轉(zhuǎn)導(dǎo)可能完全不依賴 于 AAVR2,3。

2 025 年 7 月 1 4 日,北京大學(xué)的蘇曉東團(tuán)隊(duì)與澳洲悉尼大學(xué)的JohnRasko團(tuán)隊(duì)合作,在Cell雜志上合作發(fā)表了題為An alternate receptor for adeno-associated viruses的文章,報(bào)道了一種此前未知的AAV受體——羧肽酶D(Carboxypeptidase D, CPD),并將其命名為AAVR2。


研究團(tuán)隊(duì)首先設(shè)計(jì)了一個(gè)全基因組 CRISPR/SAM轉(zhuǎn)錄激活文庫(kù),在AAVR敲除 的 細(xì)胞系中 導(dǎo)入文庫(kù),隨后用 AAV8-EGFP進(jìn)行轉(zhuǎn)導(dǎo),通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)富集 感染率高的細(xì)胞,隨后進(jìn)行NGS 測(cè)序分析,成功篩選出CPD基因。 后續(xù)的驗(yàn)證細(xì)胞 實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步表明,AAVR2能夠介導(dǎo)Clade E血清型AAV(包括AAV8、AAVrh10、AAVhu37)及自然來(lái)源的AAV11與AAV12的轉(zhuǎn)導(dǎo),且該過(guò)程不依賴傳統(tǒng)的AAVR受體。

為了理解 AAVR2的 結(jié)構(gòu)與 功能, 研究者們?cè)贖EK 293 細(xì)胞中過(guò)表達(dá)并純化了AAVR 2 蛋白的胞外域全長(zhǎng)以及各種結(jié)構(gòu)域片段,通過(guò)酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(ELISA)和表面等離子共振(SPR)證實(shí), AAVR 2 可以與AAV 8 衣殼直接相互作用,并證明相互作用主要由AAVR 2 的CP 1 結(jié)構(gòu)域介導(dǎo)。實(shí)驗(yàn)表明AAV 8 與AAVR 2 之間的親和力很強(qiáng),能達(dá)到K D =73.8 nM。

隨后,研究者們利用冷凍電鏡(Cryo-EM)解析了AAV 8 和CP 1 結(jié)構(gòu)域的高分辨率復(fù)合物結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示,CP 1 結(jié)合于AAV 8 衣殼的二次對(duì)稱軸區(qū)域,周圍由多個(gè)可變環(huán)結(jié)構(gòu)( VR-loops)環(huán)繞 。在這些VR-loops中,VR-VIII loop發(fā)揮關(guān)鍵作用,結(jié)構(gòu)顯示這一段與CP 1 直接相互作用,并且將AAV 8 的VR-VIII loop嫁接到AAV 2 的衣殼蛋白,可使原本不能通過(guò)AAVR2感染的AAV2獲得AAVR2依賴轉(zhuǎn)導(dǎo)能力,直接證明了該段區(qū)域在受體特異性中的功能決定作用。


總體而言,本研究鑒定了一條新的AAV轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,該通路可不依賴AAVR,具體取決于AAV血清型。這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了深入理解AAV細(xì)胞進(jìn)入機(jī)制分子決定因素的重要性,并展示了通過(guò)受體調(diào)控來(lái)優(yōu)化AAV基因轉(zhuǎn)導(dǎo)策略的潛力。

悉尼大學(xué) John E.J Rasko 教授、 Charles G Bailey 博士以及北京大學(xué)蘇曉東教授為本文的共同通訊作者,悉尼大學(xué)的博士后 Bijay P Dhungel 和北京大學(xué)博士后徐華是本文的共同第一作者。北京大學(xué)生科院冷凍電鏡平臺(tái)王國(guó)鵬老師對(duì)本研究作出了重要貢獻(xiàn)。

https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.06.026

制版人: 十一

參考文獻(xiàn)

1 . Pillay, S., Meyer, N.L., Puschnik, A.S., Davulcu, O., Diep, J., Ishikawa, Y., Jae, L.T., Wosen, J.E., Nagamine, C.M., Chapman, M.S., and Carette, J.E. (2016). An essential receptor for adeno-associated virus infection.Nature530 , 108-112. 10.1038/nature16465.

2. Havlik, L.P., Das, A., Mietzsch, M., Oh, D.K., Ark, J., McKenna, R., Agbandje-McKenna, M., and Asokan, A. (2021). Receptor Switching in Newly Evolved Adeno- associated Viruses. J Virol 95 , e0058721. 10.1128/JVI.00587-21.

3. Dudek, A.M., Pillay, S., Puschnik, A.S., Nagamine, C.M., Cheng, F., Qiu, J., Carette, J.E., and Vandenberghe, L.H. (2018). An Alternate Route for Adeno-associated Virus (AAV) Entry Independent of AAV Receptor. J Virol 92, e02213-02217. 10.1128/JVI.02213-17.

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