受1958年反“教條主義”運動的影響，蕭克在國防部（副部長）和訓總（副部長兼戰斗訓練部長）的職務被撤銷了。1959年5月，中央批轉總政關于反“教條主義”的報告后，此事算基本結束，告一段落了。

這段時間蕭克處于賦閑狀態，等待著組織重新分配工作。與他類似遭遇的李達，先一步收到新工作的安排通知，到國家體委某俱樂部當主任。這對開國上將軍銜、國防部副部長兼訓總副部長的李達來說，有些屈才了，但也總比閑著無事可做的好。

因此收到通知后，李達馬上就去體委報到了。這時蕭克有些迷茫了，不知道自己的命運將會如何，難道就這樣一直被閑置下去嗎？雖然迷茫，但他內心有股熊熊燃燒的信念之火：不論干什么，都不會消沉，將用努力工作來證明，對黨有多么忠誠。

賀龍、王震、張子意、張啟龍等，蕭克的紅二方面軍老首長、老戰友們，擔心他一蹶不振，遂常去探望，加油打氣。蕭克拍著胸膛做出保證：“我是黨員，永遠不會消極，不用擔心。”

王震擔心蕭克這樣閑著，遲早閑出病來，就出謀劃策道：“黑龍江那邊準備建造一個水庫，正缺少相應的人手，你去那里怎么樣？”當時王震是農墾部長，前幾年就開始在黑龍江大興土木，建立軍墾農場，主持開荒。

蕭克聞言十分激動，當即回應：“行，讓我干什么都行，太感謝你了。”聽王震電話安排妥當了，蕭克的心情也隨之變得愉悅，不再有厚厚的陰霾。可接下來發生的一系列事情，讓他的心情再次變得沉重又復雜起來。

臨去黑龍江前，中央在廬山召開八屆八中全會（也就是著名的59年廬山會議），蕭克身上還有中央委員的身份，遂應邀上山開會。

蕭克一上山，就了解到彭德懷的情況，得知了其不佳的處境。最關鍵的是，彭德懷的出事過程，簡直跟去年的他一模一樣，只不過時間、角色、主持人、具體“錯誤”變了。

見彭德懷跟一年前的自己一樣，陷入有苦難言、難以申辯的尷尬痛苦局面，蕭克在回憶錄中直言出了口怨氣。可是他轉念一想，他又為自己和彭德懷感到萬分難過：為什么有什么事情不能好好說，不能公平公正地看待處理，干嘛非要做到“矯枉過正”的地步？這傷害了多少人。

廬山會議上，不是沒有人請蕭克講幾句、出出氣，但他沒有說什么。廬山上，他對彭德懷的同情、難過，遠超過其他情感。漸漸的，會議開到后面，愈發不對頭，蕭克的心情逐漸變成氣憤，而且是眼睛要噴出火的氣憤。

會議后期，有野心家為滿足不為人知的私心，竟然當眾編造謊言，說出朱德從來沒有當過總司令的話。蕭克是紅二方面軍副總指揮，但是他跟朱德很早就認識。兩人一同參與南昌起義，起義失利后又跟著朱德進行湘南起義。隨后朱德帶領蕭克等人上井岡山，成為紅四軍一員。

蕭克參加過中央革命根據地的歷次反“圍剿”作戰，是純正的中央紅軍一員，他后來之所以成為紅二方面軍的一員，是因為率部給中央紅軍的長征探路。后來到陜北，才跟中央紅軍會合，回歸原組織。

所以，蕭克對敬重的老首長朱德，遭遇的抹黑、不公正遭遇，氣憤和心痛極了，但他又無法改變，什么都做不了。氣氛如此、大勢所趨，他一個無官無職的老干部能怎么樣。

從去年的劉伯承、粟裕、李達和他自己等人，到當下彭德懷、朱德、黃克誠、鄧華等，蕭克感到非常困惑和不理解。

彭德懷和蕭克之間，自始至終都不存在任何私怨、私仇。兩人在井岡山斗爭時期就認識，二十多年革命戰爭，彭德懷雖未直接領導過蕭克，直接交往也是屈指可數，但蕭克對彭德懷一直都很敬重。

1945年華北座談會上，彭德懷因百團大戰遭到一些非議，蕭克是少數幾個力挺彭德懷，站出來為彭解釋聲辯的人之一。

彭、蕭的接觸，主要是在建國后的軍隊正規化、現代化建設工作中。當時蕭克負責全軍教育和訓練，彭德懷主持軍委日常工作。蕭克還是彭德懷做國防部長時的國防部副部長。彭德懷直接領導蕭克工作過幾年。

在反“教條主義”運動開始前，兩人合作得還是相當愉快的，基本沒什么矛盾，分歧也沒有多少。當時蕭克十分認可彭德懷，覺得他工作魄力大、要求嚴、效率高，是一位十足的好領導。而彭德懷也很欣賞蕭克，認為他有著高風亮節、組織觀念強、善于學習、工作努力、思想觀念與時俱進等優點。

反“教條主義”運動的發生，有著說不清的復雜背景，這一點蕭克是贊同的。而他的怨氣主要是認為，這場運動和自己的遭遇也跟自己給彭德懷寫過的一封信有關。

1959年廬山會議后，蕭克和李達等人見到希望的曙光，遂不斷寫信給中央，請求平反。可是過了近19年時間，經歷希望破滅又出現、出現又破滅的多次循環，在1978年11月7日，經過中央和軍委批準，總政發出通知：撤銷對蕭克不公正的錯誤結論。

這一通知雖沒有將反“教條主義”的問題徹底解決，但好歹打開了一個口子。1987年11月25日，總政發出對蕭克等同志徹底平反的通知。

廬山會議后，賦閑在家的彭德懷，一直想找機會跟蕭克等人，說一聲對不起。但一直沒有合適的機會——他戴著一頂“重重的帽子”，冒然上門或冒然發言，只會牽連蕭克。

直到1976年后，彭德懷的侄子，通過總政聯系到蕭克：“伯伯生前要我向您轉達幾句話，‘1958年的事，讓你們受苦了，對不起同志們啊’。”

蕭克搖了搖頭，說自己對他老人家早就沒了怨氣。經過這些年的風風雨雨，他對當年的事有了新的看法和認識。蕭克意味深長地說道：“當時彭總的所作所為，是一定歷史背景下的產物，沒有他也有別人。”

1980年9月，蕭克給中央寫去一封長信，說我們要實現四個現代化，必須安定團結，必要的批判斗爭也要從實際出發，絕不能擴大化。他這是對前面二十多年的歷史總結，希望后人能吸取前人的經驗教訓，不要再出現這樣的悲劇了。