1937年陳獨秀出獄后，毛主席曾委托周恩來去看望，并且詢問陳獨秀，是否愿意回來工作，陳獨秀說：“守常死了，延年死了，問我年紀大了，能怎么辦？”
其實陳獨秀晚年大可不必如此凄慘，擺在他面前的有三條路，第一，接受蔣介石的邀請，出任國民黨勞動部部長，但他狠心拒絕。第二，接受北大時期的好友胡適的邀請去美國，買個小房子安安靜靜做個利己主義者，但他也拒絕了。第三，接受毛主席的邀請去延安，回到黨內工作。

他都沒有選，1938年6月，陳獨秀坐上一只小船，經過兩個月的長途跋涉回到了老家江津，在這里一直居住到去世，有朋友說，陳獨秀的晚年生活拮據，清冷凄慘。
陳獨秀回到江津后，先是投奔好友鄧仲純，但是他撬開房門，發現是個小護士開門，小護士得知是陳獨秀，馬上為他沏茶，不久便說去通知鄧仲純，不料等了半天也沒有人。
一天快過去了，小護士回來說，鄧仲純不方便見客，陳獨秀氣憤不已，他對小護士說，就算我餓死，也不會寄人籬下！
他本想回到江邊，結果遇到一個老友說，有個重慶人叫方孝遠也在江津，陳獨秀一聽，他認識啊，以前都是好朋友。結果見到方孝遠，方孝遠為陳獨秀打抱不平，這個鄧仲純竟然忘恩負義，但陳獨秀覺得事已至此，不必再麻煩了。
所以在方孝遠的幫助下，陳獨秀租了一間房子，但是晚上，鄧仲純又來道歉了。
鄧仲純其實心里難受，這都是老婆作怪，他心里還是非常感激陳先生的。一直到了次年的3月，他特意在江津中學對面租下了一個小院，開辦起了名為“延年醫院”的醫療機構，其目的便是想要以此來彌補自己對陳獨秀的那份愧疚之意，并且誠摯地邀請陳獨秀到那里去居住。
陳獨秀并未推辭，而是帶著全家人一同搬了過去。在那個時候，陳獨秀的生活狀況愈發窘迫起來，面對不斷飛漲的物價，他常常陷入囊中羞澀的困境，經濟上十分拮據。

陳獨秀一家七口人與鄧仲純一家同在一個大鍋里吃飯，雖說這樣的生活略顯緊湊，但一家人聚在一起倒也有著幾分歡樂的氛圍。然而，日子久了，經濟方面的壓力主要都落在了鄧仲純的身上，如此一來，鄧太太的臉上漸漸顯露出了不滿的神情。她時不時地會說出一些含沙射影、指桑罵槐的話語，這讓陳獨秀心里覺得特別不舒服。最終，陳獨秀無奈之下，只好搬離了“延年醫院”。
在好友的幫助下，在《時事新報》擔任編輯，每個月有160塊錢的稿費，按照當時的物價，160塊錢可以在江津買50斤大米，但即便如此，依然不能維持他家里的生活，實在是上有老下有小。
所以很多人就不理解他，完全可以大富大貴，為什么非要回到這個鳥不拉屎的江津呢。
晚年的陳獨秀過得孤苦伶仃，身體狀況極差，在寫作時還會突然暈倒。陳太太見狀，立刻帶著陳獨秀前往重慶治病。陳獨秀作為公眾人物，一到重慶，許多報紙便爭相報道起來。正在延安的毛主席得知陳獨秀的生活狀況后，馬上派人前去慰問。

周恩來曾多次在生活上給予陳獨秀照顧，但都被陳獨秀婉言謝絕了。1942年5月27日，陳獨秀在江津死去，享年63歲。臨終之際，陳獨秀對潘蘭珍滿懷遺憾地說道，延年和喬年都走了，這些年來，我唯獨對不起你啊，你跟著我受苦了，我死可以，就是放心不下你。
新中國成立后，毛主席也多次緬懷這位曾經的恩師。1953年，毛主席抽空時來到安徽視察，在和安慶書記聊天時突然說起來了這位北大的老師。
毛主席來到安慶后問道：“你們知道陳獨秀的家在哪里嗎？”傅大章知曉這里有座獨秀山，或許是睹物思人，毛主席接著又問：“獨秀山是因為陳獨秀而得名，還是陳獨秀因山得名呢？”

傅大章回答說：“這獨秀山幾百年了，應該是陳獨秀因山起的名字。”他還告訴毛主席，陳獨秀有個娃娃過得不好，現在去了窯廠工作，生活艱難，聽說把北京的老宅都給賣了……其實就是陳松年。
毛主席得知后，感慨地說道：“哎，何必賣房子呢，生活困難可以照顧嘛。”
隨后，根據毛主席“陳獨秀的后人有困難可以照顧”的指示，當地政府對陳獨秀的后人給予了特殊關照。