1995年8月換代的第二代Cynos，繼承了第一代的底盤與車身結構，因此在同為2380mm軸距下獲得4155×1660×1295mm的車身尺寸，長度與寬度與第一代相同。車型依舊分為α與β兩級，但這次α與β的動力系統差異顯著：α搭載代號4E-FE的1331cc直列四缸DOHC自吸發動機（88hp、11.8kgm），β則采用代號5E-FHE的1496cc DOHC直列四缸自吸發動機（110hp、13.9kgm）。1.3L車型配置四速手動和三速手動兩種變速箱，1.5L則提供四速自動和五速手動兩種選擇。兩種級別的車型吸引了不同群體，α主要吸引女性用戶，β則受到初入社會的新人與老年人的喜愛。

雖然第二代Cynos和第一代造型非常相似，但線條更加圓潤，同時保留了既有的跑車風格，這主要是豐田希望能夠吸引更多女性和年輕男性消費者。內飾方面則與Tercel系列共用，全車玻璃具備UV-Cut防紫外線功能，電動窗為1.5L車型的標準配置，CD音響主機則列為全系選配。為強調輕量化與高經濟性，α與β的車身重量分別為870公斤和920公斤，平均油耗方面，1.3L車型為19.2km/L，1.5L則為15.8km/L。

1996年8月在日本推出敞篷車型，提供1.3L與1.5L兩種動力選擇。與Celica敞篷相同，由于是從雙門車型改裝而來，由美國敞篷廠商ASC負責設計改裝。生產過程中，豐田先將Cynos車殼運至美國，由ASC切除車頂與B、C兩柱結構，并加強A柱，然后運回日本組裝，因此成本遠高于雙門版本。考慮到敞篷車型對安全性的更高要求，豐田將Cynos敞篷設定為"安全配備全系標準化"的特殊車型，ABS和SRS雙氣囊均為標準配置，這在當時堪稱創舉。另外，雖然敞篷為手動控制，但后窗卻采用玻璃材質，并配有除霧功能。由于增加敞篷結構，Cynos敞篷從原本雙門的四座設計變為2+2座椅布局。

1997年進行小改款，將晶鉆大燈、GOA車身列為標準配置，不僅提升了外觀，安全系數也符合時代需求。同時為滿足性能愛好者的需求，特別將1.3L車型與五速手動變速系統搭配，提高了Cynos的商品價值。

1999年，由于雙門車型逐漸冷門，Cynos在產品末期每月在日本市場僅銷售200輛。隨著豐田新一代戰略車型Vitz/Platz的問世，與Tercel、Corolla II、Starlet共同生產的雙門車Cynos就此退出歷史舞臺。從誕生到停產，Cynos一直被視為"平民跑車"，正是這種經濟實惠的雙門車型，滿足了預算有限買家的愿望。