當地時間6月9日上午，日本官房長官林芳正在例行記者會上公開表態稱，“遼寧艦”航母打擊群于6月7日凌晨深入日本小笠原諸島南鳥島附近的專屬經濟區水域進行多兵種聯合海上演練，因此，“日方已經正式向東大進行了適當的申訴，希望東大表明為何要派遣大型水面艦艇編隊深入日方東部島嶼縱深，組織大規模海空兵力演習。”與此同時，林芳正還當即表示日本防衛省正在全力加強海空警戒監視。
據林芳正親口承認，日本海上自衛隊作戰飛機和水面艦艇與6月7日當前，確認在南鳥島西南大約350公里海域發現包括“遼寧艦”在內的多艘戰斗艦艇，由于南鳥島是日本所有島嶼中最東端的偏遠領土，因此日本防衛省認為該島是東大海軍為提升遠海作戰能力特意選擇的“繞行目標”，日本防衛省在6月8日發表的公告稱，“遼寧艦”航母打擊群在6月7日當天在南鳥島專屬經濟區附近進行了大規模艦載機起降訓練，隨后編隊進入硫磺島東部約500公里海域，目前編隊正在朝著硫磺島以西航行。
然而，值得一提的是，在“遼寧艦”航母打擊群5月28日前后還在菲律賓海以南活動時，日本航空自衛隊和海上自衛隊就似乎失去了“遼寧艦”航母打擊群蹤跡的所有信息，直到6月7日，也就是10多天后，日本自衛隊在發現，“遼寧艦”航母打擊群已經在4000公里外的南鳥島附近海域。日本海上自衛隊到現在也不知道“遼寧艦”航母打擊群是從關島附近海域一路繞行進入小笠原群島，還是直接從菲律賓海直插日本本州島以東的，這一“不按常理出牌”的航行軌跡，令日方震動。
日本媒體認為，此次“遼寧艦”航母戰斗群深入第二島鏈的戰術目標就是適應附近海域的海上環境，為未來常態化海上遠航編隊訓練奠定基礎。日媒認為“遼寧艦”航母戰斗群的前出行動表明，東大海軍已經將從小笠原諸島延伸至關島、天寧島（北馬里亞納群島）等地的所謂“第二島鏈”，定位為未來海上區域拒止作戰的重要戰役執行地點（預設戰場），并正在通過不斷進行遠洋機動部署來落實阻止美軍武裝力量接近“目標戰區”的海空拒止戰略。
日本媒體分析稱，隨著東大海軍作戰力量逐漸深入西太平洋中部海域，東大正在制定的戰役目標，是通過大型水面艦艇編隊前出，來拒止美軍增援部隊在第二島鏈和第一島鏈之間關鍵區域的兵力集結和快速部署，并防止美軍進入離中國更近的第一島鏈內。
日本媒體認為，此次“遼寧艦”航母戰斗群遠海作訓任務表明：
1、東大正在以部分兵力前出琉球群島為主的第一島鏈和北馬里亞納群島、馬紹爾群島為主第二島鏈，繼而進入美軍西太平洋防御縱深、將美方的縱深（兩個島鏈之間的海空域）變成東大的前沿，一方面，這一前出行動在平時可以加強對關鍵海域和美軍活動區后方的偵察和預警，另一方面，在局部沖突或突發事件爆發之際，可以對美軍縱深的指揮中樞形成實質性威脅，繼而打亂美軍在第一島鏈以東的軍事部署方案，擾動其兵力集結的組織預案，截斷美軍兵力從第二島鏈向第一島鏈集結的海空通道。
2、通過海空兵力集群深入美軍重要活動區，從而掩護水下核反擊能力適時通過巴士海峽、巴布延海峽、巴林塘海峽、宮古海峽，進入第一島鏈和第二島鏈之間的預設發射陣地，從而通過核力量前出抑制沖突升級。
3、通過“遼寧艦”航母戰斗群遠海任務，不僅可以進行海上遠距離縱深防御，將距離第一島鏈的海空防線向東推進1000海里，而且還可以實施大范圍海上兵力機動隊對敵方關鍵節點和薄弱后方中樞區域進行干擾打擊，例如對關島基地群實施火力壓制，將大范圍的戰略外線反擊作戰作為牽制美軍前沿部署的重要途徑，繼而通過大膽縱深穿插不斷造成并擴大敵方被動。