臺灣《鏡周刊》5月7日報道，蔡英文已決定520卸任前特赦陳水扁，并由幕僚單位啟動特赦作業(yè)。后有媒體報道，特赦陳水扁，可能采用“免刑不免罪”的方式。5月16日，此前并未明確否認此事的蔡辦發(fā)言人林聿禪明確表示，“實際上相關(guān)程序都必須依法進行，并且也無此決定”。知情人士透露，蔡英文卸任前無法赦扁是由于蔡內(nèi)閣已于16日總辭，進入看守階段，即使蔡英文命令特赦陳水扁，行政部門也無法進行副署及完成后續(xù)程序。

對于陳水扁特赦案突然生變一事，臺灣各界人士表示了自己的看法。

5月10日曾在臉書痛批蔡英文特赦陳水扁是“為德不卒、充滿算計”的民進黨黨員、臺灣民意基金會董事長游盈隆16日第一時間在臉書表示，以“內(nèi)閣已總辭”，無法完成特赦陳水扁，這種說法太牽強、太可笑；若真心想特赦，蔡權(quán)力行使不受周休二日影響，時間還多的很。

記者在詢問陳水扁本人的看法，陳水扁直接引用了游盈隆的說法回復(fù)記者，“內(nèi)閣已總辭，無法完成特赦”，這種說法漏洞百出，太可笑了。

臺灣前駐新西蘭代表介文汲16日在節(jié)目中表示，陳水扁特赦案最后一刻被拿掉，他推測，是因為美國明確反對。美國人對陳水扁深惡痛絕，認為陳水扁當年玩到美國人頭上。美國正好給賴清德一個機會教育，跟美國人玩花樣，下場就跟陳水扁一樣。

臺北市前市長、民眾黨主席柯文哲17日針對此事表示，特赦這種重大事件不應(yīng)透過媒體放話來測風(fēng)向，應(yīng)該蔡英文自己出來說明， “整個事件到最后變成是耍人家（指陳水扁）”。

民進黨籍高雄市市長陳其邁17日受訪時認為，特赦屬于領(lǐng)導(dǎo)人的職權(quán)，他予以尊重；他也希望未來賴清德當局基于司法、政治及減少社會對立的情況來綜合考慮此事。

媒體人張禹宣17日節(jié)目中表示，在周刊爆出來特赦案的時候，沒有直接否認，還讓大家討論一兩個禮拜，所以顯然是刻意的讓子彈飛，而且這個子彈是有目標的；現(xiàn)在很明顯是打到了賴清德身上。蔡英文把陳水扁這個爛攤子，給賴清德留下來了。