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《科學》:每年“殺死”超過10萬人,“超級細菌”高度耐藥的原因終于找到了

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▎藥明康德內容團隊編輯

自最早的抗生素青霉菌進入臨床起,伴隨著抗生素的大量使用和細菌的快速進化,抗生素耐藥性已經成為日益嚴峻的全球公共衛生威脅。

在青霉素用于治療金黃色葡萄球菌后不久,對青霉素耐藥的菌株就出現了;1959年,抗生素甲氧西林的誕生成功治療了耐青霉素金黃色葡萄球菌菌株,但僅僅一年后,耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA)感染的出現帶來了新一輪的危機。如今,MRSA仍在嚴重威脅著人類健康,每年有超過12萬人死于這種“超級細菌”。

MRSA的高度耐藥性是如何形成的?本周,發表于《科學》雜志的最新研究告訴我們,原來我們一直小瞧了這些“超級細菌”的耐藥本領。來自英國謝菲爾德大學的研究團隊發現,除了已知的耐藥機制,高度耐藥性MRSA還可以通過一種前所未知的細胞分裂機制,在高濃度甲氧西林中生存、繁衍。這項發現為開發針對高度耐藥菌的新型抗生素提供了新的機遇。


要理解MRSA的耐藥機制,我們首先要知道,甲氧西林是如何殺死細菌的。甲氧西林屬于β-內酰胺類抗生素,這也是如今最常見的抗生素類型。

細菌的生存離不開細胞壁的保護,而細胞壁的主要構造單元是由糖和氨基酸組成的肽聚糖。但只有肽聚糖還不夠,要想將這些“磚塊”砌成一堵“墻壁”,青霉素結合蛋白(penicillin-binding protein, PBP)扮演著 “水泥”的角色,這種酶可以將肽聚糖交聯成完整的細胞壁,并且參與細胞壁的修復。

而β-內酰胺類抗生素的作用對象正是PBP。抗生素與PBP結合后,可以抑制后者的活性,阻止新細胞壁的形成與細胞壁修復,從而殺死失去了完整細胞壁保護的細菌。不過,MRSA的出現帶來了新的變數。

MRSA在青霉素進入臨床之前就已存在,而青霉素的使用作為一種選擇壓力,驅動了MRSA的傳播。 已有的研究認為,MRSA的耐藥性是通過突變獲得mecA基因而產生的。 PBP包括了PBP1、PBP2等類型,而mecA基因可以編碼一種獨特的PBP酶——PBP2a。與天然PBP不同的是,PBP2a對β-內酰胺的親和力很低,因此很難被β-內酰胺類抗生素結合。 也就是說,這類抗生素無法抑制PBP2a的活性,這導致了MRSA可以在甲氧西林存在的情況下組裝細胞壁、持續分裂。

不過需要指出的是,雖然是耐藥菌,但絕大多數MRSA的耐藥能力是有限的,只能在略高于最低抑菌濃度的甲氧西林中增殖。而造成更大健康威脅的,是MRSA中萬里挑一的高度耐藥性MRSA,這種現象稱作異質性耐藥性。

在高濃度抗生素環境中,只有這些極少數的高度耐藥性MRSA可以延續細胞復制。這時,上面介紹的過程將不足以講述這些MRSA耐藥的完整故事。

為了找到高度耐藥性MRSA可能的耐藥新機制,研究團隊首先使用能夠展示細胞膜細節的原子力顯微鏡,對比觀察了高度耐藥性MRSA與甲氧西林敏感金黃色葡萄球菌(MSSA)的肽聚糖結構。

細菌分裂時,兩個子代細胞中間部分的新細胞壁被稱為隔膜(septa)。在沒有抗生素的環境中,MSSA和MRSA的隔膜外表面展現出相同的特征——肽聚糖形成了如下圖左所示的同心環狀結構

但在高濃度的甲氧西林環境中,不同細菌的隔膜外表面結構出現了分化。MSSA和普通MRSA的隔膜上出現了大的孔洞,遭到破壞的細胞壁也無法保護這些細菌;與此同時,高度耐藥性MRSA的隔膜出現了令人意外的變化——同心環消失了,取而代之的是獨特的小孔徑致密網狀肽聚糖結構(如下圖右所示)。


▲不存在抗生素時,MRSA隔膜的肽聚糖形成同心環狀結構(左);在高濃度抗生素存在時,高度耐藥性MRSA的肽聚糖轉變為小孔徑致密網狀(右)。(圖片來源:參考資料[1])

接下來,研究團隊解釋了不同細菌中的肽聚糖結構變化。研究團隊發現,讓肽聚糖交聯形成同心環狀網絡的,是PBP1蛋白。對于MRSA,mecA基因編碼的PBP2a可以替代天然PBP2的活性,讓細菌在低濃度甲氧西林中存活。然而,PBP2a無法替代PBP1的活性,因此在高濃度甲氧西林中,PBP2a無法修復出現大孔洞的細胞壁。因此,高度耐藥性MRSA的存活以及全新的致密網狀隔膜還需要其他的解釋。

隨后的分子分析找到了在高濃度抗生素環境中,高度耐藥性MRSA可以切換的第二種分裂模式。rpoB基因編碼RNA聚合酶基因的β亞基,研究發現第二種分裂模式正是由rpoB突變介導的。在PBP1活性缺失的情況下,rpoB突變以及其他幾種pot突變使得隔膜形成獨特的致密網狀結構,維持了細胞壁的完整性。

由此,這項研究為我們描繪出了更加完整的MRSA耐藥機制。首先,mecA突變讓所有MRSA獲得了抵御低濃度甲氧西林的能力;在此基礎上,高度耐藥性MRSA額外擁有的rpoB突變讓它們在高濃度甲氧西林中也能延續細胞分裂。


▲mecA突變和rpoB等pot突變共同構成了高度耐藥性MRSA的耐藥機制(圖片來源:參考資料[1])

在揭示了高度耐藥機制后,研究團隊還進一步找到了幾種化合物,用于抑制攜帶不同mecA、pbp2、pbp1和rpoB突變組合的金黃色葡萄球菌生長。同期的觀點文章指出,這項新發現闡明了理解耐甲氧西林和更普遍耐藥性的機制的重要性,并將促使人們找到克服對β-內酰胺類抗生素耐藥的新療法。

參考資料:

[1] Adedeji-Olulana et al., Two codependent routes lead to high-level MRSA. Science (2024). DOI: 10.1126/science.adn1369

[2] Ewan Harrison. Bacteria divide to conquer antibiotics. Science (2024). DOI: 10.1126/science.adt0042

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