【寫在前面】：之前有分享過網藥+實驗驗證的寫作思路，今天以具體文章為例子~

思路：首先篩選中藥的活性成分和靶點以及疾病靶點——取靶點的交集——PPI 分析——核心靶點篩選——GO和KEGG分析——構建“成分-目標-通路”網絡——實驗驗證

【文章題目】Exploring the Effects and Mechanisms of Valerian Volatile Oil in Treating Insomnia Using Network Pharmacology, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulation-Based Approaches

使用網絡藥理學、分子對接和基于分子動力學模擬的方法探索纈草揮發油治療失眠的效果和機制

【摘要】

纈草具有多種藥理作用，包括鎮靜和催眠特性、抗高血壓作用、抗菌活性和肝臟保護作用。失眠是當代社會最普遍的疾病之一，對人們的日常生活產生重大影響。本研究旨在通過化學分析、網絡藥理學、分子對接、分子動力學模擬和實驗驗證，探討纈草揮發油 （VVO） 的抗失眠作用，并探討其潛在作用機制。通過氣相色譜-質譜 （GC-MS） 分析和藥物相似性篩選，我們鑒定了 38 種活性化合物。網絡藥理學研究表明，這 38 種化合物可能影響 103 個與失眠相關的靶點，如單胺氧化酶 B （MAOB）、多巴胺受體 D2 （DRD2）、單胺氧化酶 A （MAOA）、白細胞介素 1β （IL1B）、溶質載體家族 6 成員 4 （SLC6A4）、前列腺素-內過氧化物合酶 2 （PTGS2） 和 5-羥色胺受體 2A （HTR2A），有助于調節神經活性配體-受體相互作用， 5-羥色胺能突觸和鈣信號通路。分子動力學模擬的結果表明，雙[（6,6-二甲基-3-雙環[3.1.1]庚-2-烯基）甲基] （E）-丁-2-烯二酸酯表現出與 MAOB 的穩定相互作用。動物研究表明，灌胃施用高劑量 （100 mg/kg） 的 VVO 可顯著降低小鼠的自主活動、減少睡眠潛伏期并延長睡眠時間。此外，Western blot 實驗的結果表明，VVO 與 MAOB 相互作用，導致大腦皮層中 MAOB 的表達水平降低。本研究通過化學分析、網絡藥理學和實驗驗證證明了 VVO 對失眠的保護機制，并擴展了 VVO 的可能應用，VVO 是一種用于失眠治療的潛在治療成分。

【結果部分】

1.GC-MS 分析

2.失眠靶點的的預測和交叉靶點的篩選 3.構建 PPI 網絡

4.GO 功能和 KEGG 通路富集分析 5.構建“成分-目標-通路”網絡

6.分子對接結果

7.分子模擬結果

8. VVO 對戊巴比妥誘導小鼠睡眠時間潛伏期和睡眠時間持續時間的影響

9.VVO 對小鼠自主活動的影響

10.VVO 對大腦皮層 MAOB 蛋白水平的影響

【結論與討論】寫作思路

綜上所述，我們的研究結果闡明了 VVO 通過多種成分和多個靶點治療失眠，其中 MAOB、MAOA、SLC6A4、HTR2A 和其他在血清素能突觸中起著至關重要的作用 VVO 治療失眠。這些研究結果為 VVO 治療失眠的臨床應用提供了理論支持和研究數據，初步揭示了 VVO 治療失眠的藥效學基礎和藥理作用機制。然而，我們的研究也有一些局限性。網絡藥理學研究通常基于計算預測，但在未來的研究中，有必要整合其他更直接和精確的方法（如高通量測序）來驗證我們的發現 。

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