在生信分析中，我們有個口訣，“表達有差異，差異影響表型”，用來判斷基因差異表達和與預后（生存參數）的關系。通常，基于公共數據分析，表達有差異，預后好或預后差的基因，我們都可以做，因為已經有很多文章，尤其是高表達預后差的基因。當然，的基因，的基因也可以做，都有文章發表。

另外，①腫瘤中表達沒差異，預后沒差異的基因，我們大概率不會做成生信課題。但比較棘手的是，②腫瘤中高表達，但患者預后沒差異的基因，應該怎么辦？以及③腫瘤中表達無明顯變化，預后有差異，又該怎么辦？

這次，我們主要回答果友關于“腫瘤中高表達但是預后沒有顯著性的基因”，應該怎么辦？

2023年9月，Am J Cancer Res期刊上發表一篇題為High Mesothelin expression in pancreatic adenocarcinoma is associated with aggressive tumor features but not prognosis的研究論文，展示了高表達但預后沒差異基因發文章的一種策略：那就是撇開臨床表型（生存參數），關注細胞表型（增殖、耐藥等）！ 2020年前后，純生信文章套路就是這樣。沒有實驗驗證的結果，確實有待商榷，但這是時代的漏洞和局限，并不是造假。這篇文章的思路和策略，值得借鑒！

腫瘤中高表達，預后沒差異。

Mesothelin 高表達與高增殖表型相關。

Mesothelin 高表達與免疫抑制相關。

Mesothelin 高表達與化療敏感性增強相關。上述數據分析都是基于芯片數據或者二代測序數據展開的，也沒有濕實驗加持，有明顯的局限性。但是，這篇論文為高表達預后沒差異的基因找到了出口，那就是做細胞表型。其實很多基礎實驗室做課題通常并不care預后，只是高通量測序數據公開之后，大家才越來越關注預后這塊了。

腫瘤的發展是一個多基因多因素相互影響的過程。單純測序數據分析基因對預后沒影響，但是有可能在某些藥物治療下就影響預后了；或者該基因和另外一個基因存在互作關系，在另外一個基因激活的情況話，這個基因就影響預后了。因此，當發現興趣基因對預后沒影響的時候，可以繼續嘗試做一些細胞表型分析。

參考資料，僅用于學術交流。

1. https://mp.weixin.qq.com/s/k19tjNN3H6FtAc61qadD7A

2. https://mp.weixin.qq.com/s/VIOrYZOM95cAUH2wtkrCDA