醫學影像診斷領域正悄然發生革命,視覺變換器這一人工智能新銳力量,正以驚人的速度改變著肺癌診斷與預后的游戲規則。從肺部CT掃描到病理切片,這些智能模型如同訓練有素的放射科醫生,能夠捕捉影像中隱藏的微妙特征,甚至能預測患者的生存期。然而,這場技術革命也面臨著計算資源需求巨大、臨床轉化路徑不明晰等挑戰。隨著中國和美國研究者引領這一領域的快速發展,我們不禁要問:這些先進算法是否真能突破傳統影像診斷的瓶頸,為肺癌患者帶來生存希望?
智能革新路
肺癌作為全球范圍內高致死率的癌癥之一,其早期診斷與準確預后評估對患者生存至關重要。長期以來,醫學影像技術如CT掃描、X光、PET和MRI在肺癌的診斷、預后和早期檢測中扮演著至關重要的角色。傳統上,這些影像需要經驗豐富的放射科醫生進行解讀,這不僅耗時,還可能受到人為誤差和觀察者間差異的影響。
2017年前后,人工智能方法特別是深度學習模型開始在醫療影像自動化處理領域嶄露頭角。卷積神經網絡(CNN)曾一度主導這一領域,在各種醫學影像應用中展現出顯著的改進。然而,隨著技術的不斷演進,研究人員發現CNN存在一個重大缺陷:它們難以捕捉圖像中的長程依賴關系,如無法有效提取上下文信息和物體之間的非局部關聯。
2020年,Dosovitskiy及其團隊創新性地將自然語言處理中的變換器技術應用到了圖像處理領域,開發出了視覺變換器(Vision Transformer,簡稱ViT)。這種新型模型將圖像分類視為一系列圖像塊的序列預測任務,能夠捕捉圖像內部的長期依賴關系。與CNN相比,視覺變換器在處理全局信息時表現出了明顯的優勢。
在醫學影像領域,視覺變換器的應用如雨后春筍般興起。2022年的統計數據顯示,中國和美國研究人員分別發表了21篇和8篇相關研究,占據了這一領域研究的絕大部分比例。這些研究覆蓋了肺癌診斷與預后的多個方面,包括肺癌類型分類、腫瘤分割、結節檢測和生存預測等。
視覺變換器的獨特之處在于其能夠關注圖像的全局特征,不受感受野大小的限制。這一特性在處理醫學影像時尤為重要,因為醫學圖像中的病變往往需要結合周圍組織和整體結構來判斷。例如,在肺部CT圖像中,良性和惡性結節的區分不僅需要觀察結節本身的特征,還需要考慮其與周圍組織的關系。
值得注意的是,研究人員并沒有完全拋棄CNN,而是將視覺變換器與CNN結合,創造出更強大的混合模型。2022年發表的7項研究展示了將視覺變換器與CNN結合的方法,這種組合利用了CNN在提取局部特征方面的優勢和視覺變換器在捕捉全局關系方面的能力,形成了互補效應。
在技術實施方面,幾乎半數研究(18篇)使用了PyTorch框架,這反映了PyTorch在深度學習研究中的主導地位。計算資源需求方面,雖然有些研究使用了多達48個GPU的集群,但大多數研究僅使用了1-4個GPU,這表明視覺變換器模型雖然計算密集,但通過合理設計,也可以在較為普通的硬件上實現。
多維應用譜
在肺癌應用領域,視覺變換器展現出了令人印象深刻的多功能性。研究數據表明,34項納入研究中,有11項(占比32%)專注于肺癌類型的分類任務,15項(占比44%)致力于預測腫瘤生長或疾病進程,6項(約18%)關注肺部腫瘤或結節的分割,還有少量研究進行肺結節檢測。
肺癌類型分類是視覺變換器最常見的應用之一。鑒別肺鱗狀細胞癌和肺腺癌是這類研究的核心任務,這對確定治療方案至關重要。例如,2021年Shao等人開發的TransMIL模型采用變換器架構處理全幻燈片圖像(WSI),在區分肺癌亞型方面取得了優于傳統方法的成績。這類模型的特點是能夠從大量醫學圖像中自動提取關鍵特征,減少人工解讀的主觀性。
良惡性肺結節的區分是另一個重要應用。2022年,Wu等人使用Swin Transformer模型來區分良性和惡性肺部結節,該模型在公共數據集上達到了高達95%的準確率。Swin Transformer作為視覺變換器的一種變體,通過引入移動窗口注意力機制,在處理醫學圖像中的細微差異時表現出色。
視覺變換器在肺癌患者生存預測方面也顯示出巨大潛力。2022年,Chen等人開發的多模態協同注意力變換器能夠分析千兆像素級別的全幻燈片圖像,預測肺癌患者的生存期。這類模型的創新之處在于能夠整合病理學圖像和基因組學數據,提供更全面的預后評估。
在肺部結節分割方面,視覺變換器與UNet模型的結合產生了顯著效果。2022年,Dhamija等人提出了將卷積和變換器網絡融合的方法,在肺部結節分割任務中取得了88%以上的Dice相似系數(DSC),這一指標衡量了分割結果與真實標注的重疊度。
數據類型方面,22項研究使用了公開可用的數據,6項使用私人收集的數據,另有6項同時使用了公開和私人數據集。在這些研究中,約三分之二(21項)使用了肺部CT掃描,而三分之一(11項)使用了組織病理學或全幻燈片圖像。最常用的公共數據集包括肺成像數據庫聯盟(LIDC-IDRI)、癌癥基因組圖譜(TCGA)和LUNA16數據集。
在技術實現方面,研究者們展現出了多樣化的方法。除了單純使用視覺變換器外,不少研究將其與其他技術結合。例如,一些研究將視覺變換器與CNN結合,另一些則將其與UNet模型融合,還有研究探索了視覺變換器與圖網絡的組合。特別是SWIN變換器(一種能更好處理高分辨率圖像的變換器變體)作為6項研究的骨干架構,顯示出在肺癌影像分析中的突出優勢。
評估這些模型性能的指標主要包括準確率和ROC曲線下面積(AUC),每項在16項研究中被報告。其他常用指標包括特異性(11項研究)、敏感性(9項研究)、Dice相似系數(7項研究)和一致性指數(6項研究)。這些多元化的評估指標反映了視覺變換器在肺癌應用中的全面性能表現。
總體而言,視覺變換器在肺癌應用中展現出了從診斷分類到預后預測的全方位能力。通過捕捉醫學圖像中的復雜特征和長程依賴關系,這些模型正在改變傳統醫學影像解讀的范式,為肺癌患者帶來更精準、更個性化的診療可能。
數據實踐論
在視覺變換器肺癌應用的研究中,數據集的選擇和質量直接影響著模型的性能和可靠性。公共數據集在這一領域扮演著核心角色,它們不僅提供了標準化的測試基準,還促進了研究成果的可比較性和可重復性。根據2022年的統計,在34項納入研究中,有22項完全依賴公共數據集,6項使用私人收集的數據,另有6項同時使用了公共和私人數據。
肺成像數據庫聯盟(LIDC-IDRI)是最受歡迎的數據集之一,被6項研究采用。這個數據集包含了1018例胸部CT掃描,每例都有多位放射科醫生的標注,為肺結節檢測和分類研究提供了寶貴資源。癌癥基因組圖譜(TCGA)數據集同樣受到廣泛使用,特別是在處理肺鱗狀細胞癌和肺腺癌分類任務時。LUNA16數據集作為另一個重要資源,被4項研究采用,其特點是專注于肺結節檢測與分割。
這些公共數據集的規模各不相同。例如,LC25000數據集包含25,000張肺癌和結腸癌的組織病理學圖像,而NLST(國家肺篩查試驗)數據集則包含了超過53,000名參與者的低劑量CT掃描。數據集的多樣性對于訓練魯棒的模型至關重要,不同的數據來源和采集環境可以幫助模型學習更加通用的特征。
計算資源需求是視覺變換器應用的另一個關鍵方面。與傳統的卷積神經網絡相比,視覺變換器通常需要更多的計算資源和內存。在已發表的研究中,GPU使用情況差異明顯。最極端的例子是一項研究使用了48個NVIDIA V100 GPU的集群進行訓練,而大多數研究則使用了1-4個GPU。
具體來看,3項研究使用了單個NVIDIA RTX 2080Ti GPU(通常具有11GB顯存),4項研究使用了NVIDIA V100 GPU(其中一項使用了4個V100),3項研究使用了單個NVIDIA RTX 3090 GPU。這種多樣化的硬件配置反映了視覺變換器模型在不同規模項目中的適應性,同時也提示了計算資源在該領域研究中的重要性。
模型評估方面,研究人員采用了多種驗證方法和評估指標。最常見的是將數據分為訓練集、驗證集和測試集,約有11項研究采用這種方法。交叉驗證也很受歡迎,8項研究使用了5折交叉驗證,6項使用了10折交叉驗證。這些不同的驗證策略旨在確保模型的泛化能力,避免過擬合現象。
評估指標方面,準確率和ROC曲線下面積(AUC)是最常用的兩個指標,各有16項研究報告。特異性(11項)、敏感性(9項)、Dice相似系數(7項)和一致性指數(6項)也被廣泛采用。Dice相似系數主要用于評估分割任務的性能,而一致性指數則常用于評估生存預測模型。這些多樣化的指標從不同角度評估了模型性能,提供了全面的性能畫像。
研究結果的可重復性是科學研究的基礎,但在視覺變換器肺癌應用研究中,這一點顯得尤為薄弱。在34項研究中,僅有9項(約26%)提供了GitHub鏈接分享實現代碼。這種低共享率限制了研究社區的協作與進步,也使得結果驗證變得困難。
2022年,數據顯示使用視覺變換器的肺癌應用研究呈爆發式增長,單年就發表了28項研究,而2021年僅有4項,2020年只有2項。這一趨勢反映了研究者對這一技術在肺癌應用中潛力的認可,也預示著這一領域可能會繼續蓬勃發展。
挑戰未來圖
盡管視覺變換器在肺癌診斷與預后評估中展現出了巨大潛力,但這一領域仍面臨著多重挑戰。計算復雜性是最突出的問題之一。視覺變換器模型本身就具有較高的計算復雜度,當處理高分辨率醫學圖像時,這一問題更加突出。特別是在處理全幻燈片病理圖像時,這些圖像可以達到千兆像素級別,即使是強大的GPU也難以直接處理。
從實際應用角度看,計算資源需求與臨床相關性之間的平衡尤為重要。雖然使用48個V100 GPU的集群可以訓練出高性能模型,但這樣的硬件配置在大多數醫療機構中是不現實的。如何在有限的計算資源下保持模型性能,成為研究者面臨的關鍵挑戰。一些研究已經開始探索模型壓縮、知識蒸餾等技術,試圖減輕計算負擔。例如,2022年Chen團隊提出的層次化自監督學習方法,能夠有效處理千兆像素級別的圖像,同時保持計算效率。
模型可解釋性的缺失是另一個關鍵挑戰。視覺變換器與大多數深度學習模型一樣,常被視為"黑盒",其決策過程難以解釋。在醫療領域,特別是在涉及生死攸關的肺癌診斷中,理解模型為什么做出特定決策至關重要。醫生和患者都需要了解算法推薦背后的理由,以建立對AI系統的信任。
在已發表的研究中,只有少數關注了模型的可解釋性。2022年Shen等人的研究是個例外,他們提出了一種可解釋的生存分析方法,使用卷積參與的視覺變換器,能夠指出影響肺癌預后預測的關鍵因素。這類研究為提高臨床接受度鋪平了道路,但總體而言,模型可解釋性仍然是個被忽視的方面。
研究地域分布的不平衡是個值得關注的現象。中國(21項)和美國(8項)研究占據了絕大多數,而其他國家如加拿大、印度、沙特阿拉伯、韓國和巴基斯坦各只有1項研究。這種失衡狀態限制了研究視角的多樣性,也可能導致模型在不同人群和醫療系統中的適用性問題。特別是在發展中國家,肺癌負擔可能更重,但相關研究卻明顯不足。
技術轉化到臨床實踐是個巨大挑戰。雖然許多研究報告了令人印象深刻的性能指標,但幾乎沒有研究詳細討論如何將這些模型整合到現有的醫療工作流程中。模型的部署、維護、更新,以及與現有醫院信息系統的集成,都是實際應用中必須考慮的問題。
移動設備部署是一個未被充分探索的方向。在已發表的研究中,沒有一項討論了將視覺變換器模型部署到移動設備上的可能性。考慮到醫療資源分配不均的現實,特別是在偏遠地區和發展中國家,能夠在普通智能手機上運行的輕量級模型將大大提高肺癌篩查的可及性。這需要研究人員開發計算效率更高的模型變體,可能結合模型量化、剪枝等技術。
網絡平臺開發是另一個潛在機會。已發表研究中提到了一個交互式儀表板(lung-cancer.onrender.com/),但這類面向醫生、患者甚至普通公眾的在線工具仍然稀少。這些平臺可以降低先進AI技術的使用門檻,促進技術擴散和應用。
視覺變換器在肺癌研究中的迅速崛起表明,這一領域正處于快速發展階段。未來的研究方向可能包括:開發更加高效的視覺變換器變體,專為醫學圖像優化;結合多模態數據(影像、基因組學、電子健康記錄等)進行更全面的分析;增強模型可解釋性以提高臨床接受度;以及探索在資源受限設備上的部署策略。
隨著技術的不斷成熟和研究的深入,視覺變換器有望成為肺癌診斷與預后預測的強大工具,但真正實現其臨床價值還需要解決上述挑戰。這一旅程才剛剛開始,未來充滿了機遇與可能。
參考資料
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Dosovitskiy, A., et al. (2020). An image is worth 16x16 words: Transformers for image recognition at scale. arXiv preprint arXiv:2010.11929.
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