2002年，劉源被任命為解放軍總后勤部副政委。上任不久后，劉源便碰上了大裁軍，他的任務(wù)是裁減總后勤部所屬的4所院校。

這4所院校是解放軍第一軍醫(yī)大學、軍需大學、第四軍醫(yī)大學吉林軍醫(yī)學院和第三軍醫(yī)大學成都醫(yī)學院。

那時候，這些院校的許多人不愿離開部隊。對此，劉源的心里也不好受。然而，此時的總后勤部資金有限，很難支撐部隊的開支。

這是因為，國家為了發(fā)展，只好把有限的財力用在經(jīng)濟建設(shè)投資上，國防開支便不得不進行壓縮。因此，總后勤部的資金就少了許多。

在這種情況下，為優(yōu)化軍費配置，為軍隊購置更多尖端裝備，加快軍隊向信息化的轉(zhuǎn)型發(fā)展，把這4所院校整體移交給當?shù)卣?，就是一個很好的選擇。

2003年，經(jīng)過一段時間的努力后，劉源終于做通了這些院校人員的思想工作，同意劃歸到地方上。

直到此時，解放軍總后勤部才最終決定，將所屬的解放軍第一軍醫(yī)大學整體移交給廣東省。

8月4日，在解放軍第一軍醫(yī)大學移交廣東省管理的交接儀式上，劉源將第一軍醫(yī)大學比作“女兒”。

在移交時，劉源握著廣東省省長黃華華的手，懷著激動和擔憂的復(fù)雜情緒，對他說：“我‘女兒’嫁到你家了，你要好好對她！”

看得出來，劉源對第一軍醫(yī)大學是有感情的，也是當做自己的女兒一樣看待的。

聽了劉源的話，黃華華懷著復(fù)雜的心情，點了點頭。那一刻，黃華華也仿佛成為第一軍醫(yī)大學的“公公”。

2004年8月24日，解放軍第一軍醫(yī)大學開始轉(zhuǎn)隸移交廣東地方辦學，整體退出了軍隊序列，并更名為“南方醫(yī)科大學”。

當天，中共中央政治局委員、廣東省委書記張德江，中央軍委委員、總后勤部部長廖錫龍上將、總后勤部政委張文臺上將、廣東省省長黃華華等軍地雙方的領(lǐng)導(dǎo)，出席了解放軍第一軍醫(yī)大學移交暨南方醫(yī)科大學的揭牌儀式。

期間，總后勤部副部長王謙宣讀了中央軍委關(guān)于撤銷第一軍醫(yī)大學番號的命令，并與廣東省委常委、常務(wù)副省長鐘陽勝共同簽署了《第一軍醫(yī)大學移交廣東省交接紀錄》。

至此，解放軍第一軍醫(yī)大學完成了轉(zhuǎn)身。此后，廣東給南方醫(yī)科大學投入了不小的資金和政策支持。

2006年2月，廣東省委、省人民政府作出了《關(guān)于建設(shè)中醫(yī)藥強省的決定》。在《決定》中，明確提出：

支持南方醫(yī)科大學發(fā)揮中西醫(yī)結(jié)合學科群優(yōu)勢，建設(shè)一所投資主體多元、醫(yī)教研一體、國內(nèi)一流水平的南方中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院。

在廣東地方的資金和政策支持下，南方醫(yī)科大學發(fā)展得越來越好，履行了廣東省委對劉源的承諾。

后來，南方醫(yī)科大學不僅新建了占地244.5畝的中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院（三級甲等），還得到了整體劃規(guī)過來的廣州郵電醫(yī)院，更是入選了第一批卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃項目試點高校。