伊朗媒體報道，該國強力部門又摧毀一個制造無人機的以色列特工窩點。在12天戰爭期間，以色列摩薩德秘密生產部署的大量無人機，從伊朗境內各地的秘密窩點起飛，執行偵察、引導和打擊任務。這是德黑蘭和伊朗軍方在戰前未預料到結果。在大批潛伏的特工和被摩薩德收買人員的情報支持下，以色列空軍的先發制人襲擊行動十分順利。第一次空襲行動就給伊朗軍隊的指揮體系造成重創。

按照以色列軍方發布的戰報，在6月13號凌晨，200多架以軍戰機在情報系統精確指引下，襲擊伊朗境內100多個目標，其中包括伊朗軍方高層藏身地，打死3名最高級別指揮官，分別是伊朗武裝部隊總參謀長穆罕默德·巴蓋里、伊斯蘭革命衛隊總司令侯賽因·薩拉米、應急指揮部司令吳拉姆-阿里·拉希德這個級別的伊朗軍事指揮官被團滅，簡直令人難以置信。

外界懷疑，德黑蘭政府和軍方內部有內鬼，向以色列提供了精準的實時情報信息，F-35戰斗機才能成功“斬首”上述三名伊朗最高級別軍事領導人。

為此，伊朗軍方一方面組織大規模的報復性反擊，投入數百枚（總計591枚）以色列本土目標，一方面在國內抓間諜、抓內鬼。短短十幾天內就在全國各地抓獲九百多名以色列間諜和內鬼（被摩薩德收買的伊朗人）。

前革命衛隊總司令穆赫辛·雷扎伊接受法爾斯通訊社采訪

7月12日，伊朗國家利益委員會秘書長、前革命衛隊總司令穆赫辛·雷扎伊接受法爾斯通訊社采訪時首次透露：“在12日戰爭中，以色列空軍猛烈轟炸了最高國家安全委員會會議場所的六個地點。

但由于伊朗方面每次會議都進行了精心策劃，因此沒造成太大損失。”不過，6月15日召開的那次伊朗總統參加的高層軍事會議，突然遭到多枚以色列導彈襲擊，情況相當兇險。很明顯，這次高層軍事會議地點泄密了。

法爾斯通訊社12日報道稱，6月15日（12天是伊以沖突的第三天），以色列空軍使用六枚導彈或反掩體炸彈空襲了德黑蘭西部一座建筑下的地下設施。當時，伊朗國家安全委員會會議正在那里舉行。這些導彈瞄準了該建筑的入口和出口，以阻止逃生路線并擾亂氣流，爆炸導致會議所在樓層停電。包括伊朗總統佩澤什基安在內的伊朗官員通過緊急艙門逃生。佩澤什基安撤離時受傷，腿部輕微骨折。