即便多爾袞沒有娶自己的嫂子孝莊太后，他也毫無疑問，是讓順治帝的家庭關系變得更加混亂的罪魁禍首。順治帝即位之后，首先要面對的，就是親哥哥豪格與叔父多爾袞因為爭奪皇位產生的巨大矛盾。作為上位者的攝政王多爾袞，開始大興刑獄，將豪格及其支持者投入監獄，大有要置侄子于死地的勢頭。據朝鮮史料記載，當時還是因為小皇帝順治“啼泣不食”，終日哭泣、絕食，為兄長求情，才換來豪格的不死。幾年后，順治帝恢復了豪格肅親王的爵位，并在冊文中明確說：豪格底定中原有功，要為他“昭雪”。換言之，之前多爾袞給豪格定的罪是冤枉的。

盡管在弟弟的庇護下，豪格得以保全性命，但掌政的多爾袞絕不會輕易放過他。清朝入關后，豪格雖然立有一系列軍功，卻始終得不到應有的待遇和獎賞，還常常被無端陷害。以至于豪格感到生不如死，表示要將“諸子必以石擲殺之”，就是用石頭把自己的兒子都砸死，然后自己和他們同歸于盡，可見此時他已經到了完全絕望的程度。豪格的這番話說完沒多久，就死于幽禁之中。豪格死后一年多，多爾袞就納了新的福晉，也就是妻子。新福晉不是別人，正是豪格的遺孀博爾濟錦氏。而順治帝眼看著叔父將哥哥迫害而死，又把自己的嫂子變成了嬸母，皇室的家庭關系搞得一團亂麻，內心的郁悶可想而知。

順治皇帝生性敏感，叔父的為所欲為和對皇權的藐視甚至打壓，讓他感到備受壓抑。在年幼時，他沒有能力反抗叔父，只能一味隱忍。清史學界一般認為，順治帝的性格如此抑郁和乖戾，與他少年時代的成長環境有很大的關系。直到順治七年（1650年）底，三十九歲的多爾袞意外離世，順治才終于結束了受叔父控制和擺布的時代。順治八年（1651年）正月，北京紫禁城舉行了隆重的親政大典。十四歲的小皇帝順治，終于把政治權力掌握在了自己手中。但他沒想到的是，自己的個人生活仍舊被多爾袞的陰影籠罩著。親政大典之后，清廷就開始緊鑼密鼓地籌備皇帝的大婚典禮。這門婚事，是多爾袞在生前為順治帝聘定的。新娘是孝莊太后的長兄吳克善的女兒，也就是順治帝的表姐妹。多爾袞做出這項決定，是基于多方面的考慮。滿蒙聯姻自然是不可忽略的因素，討好和結盟孝莊太后及其娘家，肯定也是重要的動機。問題是，剛剛親政、又正處于青春期的順治皇帝，自然不愿意再接受死去叔父的安排和擺布。他本能地反對這門婚事。

在親政大典舉行后的第五天，順治皇帝的舅父，也是他未來的岳父——吳克善，就親自把女兒送到北京，準備與皇帝成婚。清廷的大臣們主張，第二個月就舉行大婚典禮。順治帝不愿意，他推脫說：“大婚吉禮，此時未可遽議，所奏不準行。”就是說，大婚吉禮是很隆重的事情，怎么能在這么倉促之間就決定呢？不準舉行。朝臣們也算是給了剛剛親政的少年天子一個面子，就把婚禮推遲了。但是，又過了四個多月，大婚的各項儀節都已經籌備妥當，由不得順治帝再做推遲了。沒辦法，他只好同意舉行大婚，同時宣布大赦天下，還給母親孝莊太后加上了徽號，以示尊崇。徽號是生前加上的美號。比如我們熟悉的“慈禧”，就是徽號，孝莊則是死后才有的謚號。但因為大家對“孝莊”這個稱號最為熟悉，我這里還是用孝莊來稱呼順治帝的生母。

雖然清代史料中，沒有太多記錄去剖析，順治帝為什么從反對大婚轉變成了同意大婚。但陳捷先先生認為，孝莊太后必然在其中起到了重要作用，她用各種方式讓兒子接受了這門婚事。只是，強扭的瓜不甜。婚后僅僅兩年，順治皇帝就下令給禮部，讓他們查閱：之前的朝代廢掉一個皇后，要經歷哪些程序。大臣們一聽說皇帝要廢后，自然是反復勸阻。順治皇帝則拋出三條理由，來表明自己廢后的決心：第一，皇后是由多爾袞在自己幼時選定的，沒有經過自己的同意。第二，自大婚以來，帝后之間一直“志意不協”，就是夫妻感情一直不和。第三，皇后德行不佳，與宮中上下的關系都處理得不夠好。大臣們一看皇帝心意已決，只好同意將皇后廢黜，降為靜妃，由中宮改居別宮。