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中科院2區(qū)if5+: 網(wǎng)藥+實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證文章思路-葛根芩連方通過PI3K/AKT/NF-κB軸緩解腹瀉~

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寫在前面之前有分享過網(wǎng)藥+實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的寫作思路,今天以具體文章為例子~

網(wǎng)藥生信咨詢加微信:1278317307。

思路:首先篩選中藥的活性成分和靶點(diǎn)以及疾病靶點(diǎn)——取靶點(diǎn)的交集——構(gòu)建草藥-成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)——PPI 分析——GO和KEGG分析——實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證(體內(nèi)外實(shí)驗(yàn) 。單個通路驗(yàn)證-兩個信號通路驗(yàn)證-多個通路聯(lián)合驗(yàn)證)。下文是典型的單個信號通路聯(lián)合的機(jī)制研究!


文章題目Gegen Qinlian standard decoction alleviatedirinotecan-induced diarrhea via PI3K/AKT/NF-κB axis by network pharmacology predictionand experimental validation combination

葛根芩連方通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證相結(jié)合,通過 PI3K/AKT/NF-κB 軸緩解伊立替康誘導(dǎo)的腹瀉


【摘要】

背景:伊立替康(CPT-11)給藥引起的頻繁發(fā)生的化療誘導(dǎo)性腹瀉(CID)是CPT-11最具代表性的副作用,導(dǎo)致化療暫停或失敗。我們之前的研究表明,葛根芩連方對CPT-11誘導(dǎo)的腹瀉具有顯著的緩解作用。然而,參照日本漢方醫(yī)學(xué),中藥標(biāo)準(zhǔn)湯劑將彌補(bǔ)古代制劑應(yīng)用與現(xiàn)代工業(yè)生產(chǎn)之間的差距。

方法:采用LC-MS技術(shù)結(jié)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),鑒定GQD標(biāo)準(zhǔn)煎劑治療CPT-11誘導(dǎo)的腹瀉的有效成分和機(jī)制。通過SN-38激活的NCM460細(xì)胞體外實(shí)驗(yàn)和CPT-11誘導(dǎo)的體內(nèi)腹瀉實(shí)驗(yàn),研究了GQD標(biāo)準(zhǔn)煎劑與腸屏障功能相關(guān)的抗炎活性。分析了與炎癥有關(guān)的蛋白質(zhì)、mRNA水平、疾病嚴(yán)重程度評分和與腸道炎癥有關(guān)的組織學(xué)。

結(jié)果:在GQD標(biāo)準(zhǔn)煎劑中鑒定出37種活性化合物。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析表明,PI3K-AKT信號通路可能是GQD標(biāo)準(zhǔn)湯治療CPT-11誘導(dǎo)的腹瀉的主要通路,PIK3R1、AKT1、NF-κB1是核心蛋白。此外,我們發(fā)現(xiàn)上述預(yù)測的關(guān)鍵蛋白質(zhì)和途徑在體內(nèi)和體外實(shí)驗(yàn)中得到了驗(yàn)證,GQD標(biāo)準(zhǔn)煎劑可以在體外保護(hù)細(xì)胞增殖,改善CPT-11誘導(dǎo)的小鼠模型腹瀉。

結(jié)論:本研究揭示了GQD標(biāo)準(zhǔn)湯中37種活性成分對CPT-11誘導(dǎo)的腹瀉的分子機(jī)制。并通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了核心蛋白和通路。這些數(shù)據(jù)為GQD標(biāo)準(zhǔn)湯劑活性成分的特定分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ),本研究可為CID的中醫(yī)治療提供科學(xué)參考。

【研究流程圖】



結(jié)果部分

1.通過UPLC-Q-TOF/MS技術(shù)鑒定GQD標(biāo)準(zhǔn)湯劑中的化合物


2.在CPT-11誘導(dǎo)的腹瀉條件下鑒定GQD標(biāo)準(zhǔn)湯的活性化合物蛋白


3.化合物-靶點(diǎn)-疾病的網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建


4.GQD 標(biāo)準(zhǔn)煎劑對 SN-38 誘導(dǎo)的 NCM460 細(xì)胞的影響


5.GQD標(biāo)準(zhǔn)湯劑在體內(nèi)對CPT-11誘導(dǎo)的腹瀉起到治療作用


6.GQD 標(biāo)準(zhǔn)煎劑可防止 CPT-11 暴露小鼠的緊密連接改變


7.推定蛋白質(zhì)和GQD標(biāo)準(zhǔn)湯抑制結(jié)腸炎水平的實(shí)驗(yàn)證實(shí)


結(jié)論與討論】寫作思路

本研究采用綜合策略,展示了 GQD 標(biāo)準(zhǔn)湯劑中 37 種有效成分對 CPT-11 誘導(dǎo)的腹瀉的分子機(jī)制。UPLC-MS/MS分析揭示了GQD標(biāo)準(zhǔn)湯劑的37種有效化合物,用于后續(xù)的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析。并通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證核心蛋白和通路。我們證明 GQD 標(biāo)準(zhǔn)湯劑可通過 PI3K/AKT/NF-κB 信號通路抑制炎癥和腸粘膜屏障改變,并在體內(nèi)和體外實(shí)驗(yàn)中得到進(jìn)一步驗(yàn)證。該數(shù)據(jù)為 GQD 標(biāo)準(zhǔn)煎飲活性成分的特定分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。此外,這項(xiàng)研究可以作為 CID 中醫(yī)治療的新基礎(chǔ)。然而,GQD 標(biāo)準(zhǔn)煎劑對 CPT-11 誘導(dǎo)的腹瀉的臨床效果有待進(jìn)一步研究。

注:本文原創(chuàng)表明為原創(chuàng)編譯,非聲張版權(quán),侵刪!

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