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職位信息

新南威爾士大學(xué)加文醫(yī)學(xué)研究所的基因組學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)中心招收全獎博士

研究揭示 ALS 機(jī)制：整合單細(xì)胞長讀測序和 CRISPR 技術(shù)

項目介紹：

我們正在尋找一名積極進(jìn)取的博士候選人，為我們結(jié)合單細(xì)胞長讀數(shù)測序和 CRISPR 技術(shù)的開創(chuàng)性研究做出貢獻(xiàn)，以研究 ALS 的分子機(jī)制。該項目提供了一個利用先進(jìn)的基因組技術(shù)和計算生物學(xué)站在神經(jīng)退行性疾病研究前沿的獨(dú)特機(jī)會。

我們實驗室的專長

我們的實驗室在 RNA 生物學(xué)和剪接機(jī)制方面擁有超過 15 年的經(jīng)驗，在應(yīng)用生物信息學(xué)方法解決復(fù)雜的生物學(xué)問題方面處于領(lǐng)先地位。我們最近在高影響力期刊上發(fā)表的論文展示了我們在以下方面的創(chuàng)新應(yīng)用：

• 用于全長轉(zhuǎn)錄本分析的長讀測序技術(shù)
• 用于剪接模式檢測的先進(jìn)計算管道
• 基于 CRISPR 的基因組編輯技術(shù)，為疾病機(jī)制建模
• 整合多組數(shù)據(jù)集的機(jī)器學(xué)習(xí)算法

您的主要工作：

• 開發(fā)并應(yīng)用新的計算方法來分析單細(xì)胞長讀測序數(shù)據(jù)
• 設(shè)計并實施 CRISPR 篩選以研究 ALS 相關(guān)基因
• 整合不同的數(shù)據(jù)集，構(gòu)建 ALS 進(jìn)展的綜合模型
• 與濕實驗室科學(xué)家合作驗證計算結(jié)果
• 在國際會議上展示你的研究成果并在頂級期刊上發(fā)表

導(dǎo)師介紹

Dr Robert Weatheritt

副教授 Robert Weatheritt 是 ARC 未來研究員、新南威爾士大學(xué) BABS 的 EMBL 澳大利亞小組負(fù)責(zé)人和加文研究所的實驗室負(fù)責(zé)人。Weatheritt 博士在海德堡 EMBL 獲得博士學(xué)位，隨后在劍橋大學(xué)和多倫多大學(xué)擔(dān)任博士后研究員。Weatheritt 博士于 2018 年開設(shè)了自己的實驗室，專注于將數(shù)據(jù)方法與 CRISPR 篩選方法和轉(zhuǎn)錄組學(xué)相結(jié)合，以了解 RNA 在驅(qū)動細(xì)胞表型中的作用。Weatheritt 博士在高影響力期刊上發(fā)表了 40 多篇同行評審文章，其中包括在《自然》、《細(xì)胞》和《科學(xué)》上發(fā)表的多篇論文。

申請要求：

• 生物信息學(xué)、計算生物學(xué)或相關(guān)領(lǐng)域的理學(xué)碩士學(xué)位（特別歡迎具有計算專業(yè)知識的生物學(xué)家！）
• 強(qiáng)大的編程技能（Python、R 或類似技能）
• 具有 NGS 數(shù)據(jù)分析和基因組學(xué)工具經(jīng)驗
• 了解機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)者優(yōu)先
• 出色的溝通能力和跨學(xué)科團(tuán)隊工作能力

獎學(xué)金：

新南威爾士大學(xué)通過競爭性申請為國際和國內(nèi)（新西蘭和澳大利亞）學(xué)生提供資助。最低要求為一等榮譽(yù)學(xué)位或碩士學(xué)位。新南威爾士大學(xué)在批準(zhǔn)申請時會考慮工作經(jīng)驗證明和大學(xué)質(zhì)量（基于全球排名）。

參考：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39232238/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38036695/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38917794/