乾隆二十八年(1763 年)，鎮江城防被江寧調撥過來的八旗蒙古接管，江寧蒙古八旗也由此全部移駐鎮江。

這批蒙古八旗官兵實數1300多人（另有養育兵、匠役300人左右），由一副都統率領，大多是清初編立的八旗蒙古后裔，稱為京口駐防蒙古八旗，直到清朝結束不再變動，巴玉藻即是這批蒙古軍的后人。

巴玉藻的父親名叫巴煥庭，是京口駐防八旗的左翼鑲紅六甲防御（五品武職），家在鎮江城內竹竿巷附近，雖是蒙旗卻已是地道的鎮江人。巴煥庭有三個兒子，老大巴玉潤，老二巴玉春，老三就是巴玉藻。

巴玉藻

巴玉藻的長兄及二兄均曾留學日本，與黑龍江督軍朱慶瀾關系深厚，后分任黑龍江高等審判廳廳長和交際處處長；而巴玉藻則從事了航空技術專業。

1906年巴玉藻14歲時，從京口八旗中學堂畢業，進入南京江南水師學堂學習航海輪機。1909年清政府選派人員赴英國留學，巴玉藻被選中，入阿姆斯特朗學院學習機械工程。 1915 年奉命轉赴美國深造，入麻省理工學院航空工程系學習，開始了航空報國的生涯。

在美期間僅九個月，巴玉藻就學成取得航空專業碩士學位，應聘任美國寇提司( Curtiss )飛機制造廠設計工程師和通用飛機廠工程師，并被接納為美國自動化工程學會會員。

1917年巴玉藻及王助等留美航空專家毅然回國，并于1918年1月出任中國第一家飛機制造廠——福州船政局飛機制造工程處主任，負責建造飛機。

巴玉藻不僅研制飛機，還著力培養本土航空專才。1918 年 4 月，巴玉藻兼任了福州海軍飛機制造專班教官，參與教授航空動力學、飛機制造學、飛機工程學、飛機實地圖算、飛機穩度算法等多門專業課程。

1919年8月，巴玉藻、王助等制造成功第一架水上飛機——“甲型1號”初級教練機。

“甲型1號”初級教練機

此后巴玉藻、王助團隊陸續設計制作出十多種各型水上飛機，并仿制弗力提教練機14架，道格拉斯6架。

乙型水上教練機

新丁一號水上轟炸機三視圖

新甲三號水上偵察機

戊三型水上偵察機 中為巴玉藻

1928年5月，巴玉藻代表中國出席德國柏林的萬國博覽會，在會中其表示：”我國制造飛機的數量少，在質量上外國沒有比我們強“，足見當時中國航空人的技術自信及水平。

1929年春，巴玉藻回國后不久被診斷出腦部中毒，并于同年6月去世。巴玉藻臨終前，曾懷疑自己在回國途中遭人毒害，此成為一樁懸案。