1959年7月，中國原子能工業突遭重創——蘇聯單方面撕毀協議，宣布停止向中國提供核工業圖紙資料，并撤走全部援華專家。時任第二機械工業部（主管核工業）部長的宋任窮不禁感嘆：“蘇聯人這一步，是要掐斷我們的命脈！”

當時中共中央正在廬山召開政治局擴大會議，糾正前期工作中的“左”傾錯誤，國防部長彭德懷和分管國防科委的聶榮臻均在廬山，宋任窮當即決定上廬山匯報情況，但原子能工業的技術細節復雜，他需要一位懂行的搭檔。宋任窮經過再三考慮，決定邀請國防科委副主任萬毅一起上廬山。

萬毅得知宋任窮的來意后，面露難色：“聶帥在山上，您去匯報就行。”

宋任窮卻堅持說：“具體數據只有您清楚，必須同去！”

經過幾番勸說，萬毅終于妥協，7月15日，他和宋任窮一起上了廬山。

萬毅

宋任窮和萬毅上山后，馬上去找彭德懷匯報工作。彭德懷已經在7月14日給毛澤東送上了那份“萬言書”，所以他很自然地就聊到了自己寫信的事。萬毅十分同意彭德懷對“大躍進”的一些看法，他感嘆道：“‘人有多大膽，地有多大產’這樣的口號，是唯心主義的嘛！”這次會面僅持續了半小時，卻成為三人最后的平靜對話。

7月16日，毛澤東要求把彭德懷的信印發給參會的同志討論，宋任窮和萬毅被留在了廬山，并被要求參加小組討論。宋任窮由于當時存在著“左”的思想，他表示不同意彭德懷的看法，在會上作了批評彭德懷的發言。

萬毅卻仗義執言，為彭德懷說了公道話：

彭德懷同志把自己考慮到的問題提出來，對于此次會議深入討論有推動作用；提出意見，精神是好的，是赤膽忠心的。從肯定成績、提出問題到糾正缺點來看，基本精神都是對的。但有的問題說得簡單一些，如果再多說幾句，多加分析就清楚了。我基本同意彭總的信。

萬毅

廬山會議結束后，萬毅被撤銷了一切職務，只保留了中央候補委員，宋任窮的批判發言，則讓他得以安全“著陸”。

宋任窮下廬山后，去北京醫院看望鄧小平。此前鄧小平因為腿受傷未能上廬山，他躺在床上，一條腿上了石膏，吊掛在床架上。宋任窮在講述了自己在廬山批判彭德懷的一些情況后，鄧小平說：“彭德懷同志在歷史上是有功的，特別是在抗日戰爭、解放戰爭和抗美援朝斗爭中都有很大的功勞，不論他有什么錯誤，這些功勞都應當充分予以肯定。”

鄧小平在批判彭德懷的調子越來越高的時候講的這番話，對彭德懷無疑起了一定的保護作用，而對宋任窮這些在不同程度上存在著“左”的思想、頭腦不夠清醒的人潑了一瓢冷水。

1980年4月，鄧小平在一次談話中又講到了廬山會議，他說：“1959年上半年，是在糾正‘左’的錯誤，廬山會議前期還在討論經濟工作。彭德懷同志的信一發下來，就轉變風向了。彭德懷同志的意見是正確的，作為政治局委員，向政治局主席寫信，也是正常的。盡管彭德懷同志也有缺點，但對彭德懷同志的處理是完全錯誤的。 ”

鄧小平

對于這次錯誤的批判，宋任窮后來在回憶錄中是這樣說的：“這說明我覺悟不高，認識片面，應當引以為戒，作自我批評。”