1894年甲午戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)以后，雖然戰(zhàn)事主要集中在北方，但是因?yàn)閾?dān)心日本海軍會(huì)南下襲擊閩浙海面，因此南洋水師也不敢掉以輕心，命六艘主力巡洋艦分守各處。其中“南琛”、“南瑞”兩艦駐防臺(tái)灣，“開(kāi)濟(jì)”、“鏡清”、“寰泰”、“保民”四艦則一起守衛(wèi)吳淞口。

黃海海戰(zhàn)后，由于北洋水師損失慘重，清政府曾經(jīng)考慮抽調(diào)南洋水師北上增援。不過(guò)南洋方面以種種理由推脫，直至戰(zhàn)爭(zhēng)結(jié)束依然沒(méi)有北上。

黃海海戰(zhàn)

當(dāng)然了，南洋水師雖然沒(méi)有直接參加戰(zhàn)斗，但是也并非全程無(wú)所事事，除了日常巡邏之外，日本一度打算雇傭英國(guó)莫臥兒輪船公司出租給美國(guó)巴伯公司的的“巴山”號(hào)輪船運(yùn)送軍用物資到日本。這一消息被清政府駐新加坡的外交人員獲悉，于是通知國(guó)內(nèi)進(jìn)行攔截。

1894年9月20日“巴山”號(hào)輪船在臺(tái)灣海峽被“南琛”號(hào)和海關(guān)的“斯美”號(hào)截停?！澳翔　碧?hào)派出官兵上船檢查，在貨單中看到了有一批運(yùn)往日本的軍火和化工品，于是將其扣留，押往基隆沒(méi)收違禁物資。

“南琛”號(hào)

經(jīng)過(guò)一番檢查，最后查獲了一批運(yùn)往日本的左輪手槍和子彈并將其沒(méi)收。本來(lái)這件事到此也就告一段落了，清軍打算將“巴山”號(hào)放行。然而就在船上水手將其他貨物搬回船上時(shí)，檢查人員又發(fā)現(xiàn)了兩件疑似炮彈的物品。于是“南琛”號(hào)的水兵和海關(guān)人員再次對(duì)貨物進(jìn)行了全面檢查。

第二次檢查沒(méi)有發(fā)現(xiàn)問(wèn)題，但是這樣前后耽擱了“巴山”號(hào)近半個(gè)月的時(shí)間，延誤了貨期。加上恰逢大雨，很多貨物被雨淋濕，一些因此損壞，此外檢查貨物時(shí)也有一些損壞，因此“巴山”號(hào)不得不支付違約罰金和賠償損壞的貨物，損失巨大。

“開(kāi)濟(jì)”號(hào)巡洋艦航行圖，李曉雷繪制

英國(guó)船東為了減少損失，請(qǐng)求英國(guó)政府向清政府索取賠償。英國(guó)方面認(rèn)為南洋水師的行動(dòng)符合戰(zhàn)時(shí)的要求，不過(guò)清政府沒(méi)有建立符合國(guó)際要求的捕獲法庭，行為上有瑕疵，因此向清政府提出賠償請(qǐng)求。

此時(shí)已經(jīng)焦頭爛額的清政府不愿意在這種小事上得罪英國(guó)，于是賠償了輪船公司的損失。對(duì)比日本海軍在豐島海戰(zhàn)中擊沉英國(guó)“高升”號(hào)貨船，最后英國(guó)人卻認(rèn)為責(zé)任也由清政府承擔(dān)，賠償了英國(guó)一切損失，英國(guó)政府在這場(chǎng)戰(zhàn)爭(zhēng)中的態(tài)度有些耐人尋味了。