本文研究通過全外顯子組測序技術(shù)首次在人類動脈粥樣硬化斑塊中發(fā)現(xiàn)了大量克隆細(xì)胞群的存在,這些克隆細(xì)胞群或會通過不對稱細(xì)胞增殖在斑塊形成和發(fā)展中發(fā)揮重要作用。
近年來,心血管疾病已成為全球范圍內(nèi)的首要死因,其中動脈粥樣硬化更是扮演了關(guān)鍵角色。據(jù)《柳葉刀》發(fā)布的全球疾病負(fù)擔(dān)研究報告顯示,2019年心血管疾病導(dǎo)致的死亡人數(shù)高達(dá)1790萬,占全球總死亡人數(shù)的32%,作為心血管疾病的主要病理基礎(chǔ),動脈粥樣硬化的發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,涉及脂質(zhì)代謝異常、慢性炎癥、細(xì)胞增殖與遷移等多個環(huán)節(jié)。近年來,隨著基因測序技術(shù)的飛速發(fā)展,科學(xué)家們開始從基因組層面探索動脈粥樣硬化的發(fā)病機(jī)制,特別是克隆細(xì)胞群的存在及其作用。
近日,一篇發(fā)表在國際雜志JCI Insight上題為“Mutational landscape of atherosclerotic plaques reveals large clonal cell populations”的研究報告中,來自南丹麥大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究利用一種全外顯子組測序技術(shù)對人類動脈粥樣硬化斑塊中的克隆細(xì)胞群進(jìn)行了深入研究,有望為理解動脈粥樣硬化的病理過程提供了新的視角。
文章中,研究人員旨在闡明人類動脈粥樣硬化斑塊中是否存在克隆細(xì)胞群,并探討這些克隆細(xì)胞群在斑塊形成和發(fā)展中的作用。與以往基于X染色體失活的研究不同,這項研究利用了體細(xì)胞突變作為遺傳標(biāo)記來直接追蹤斑塊內(nèi)細(xì)胞的克隆擴(kuò)增情況,從而為動脈粥樣硬化的病理學(xué)研究提供了新的方法學(xué)支持。
體細(xì)胞突變和局部擴(kuò)增的克隆細(xì)胞群是動脈粥樣硬化的固有特征
該研究納入了13名接受頸動脈內(nèi)膜切除術(shù)的患者,研究人員從其頸動脈斑塊中提取DNA樣本并同時收集非動脈粥樣硬化動脈(如升主動脈和胸廓內(nèi)動脈)及血液白細(xì)胞DNA作為對照;他們采用全外顯子組測序技術(shù)對樣本進(jìn)行深度測序,并通過生物信息學(xué)分析識別斑塊特異性的體細(xì)胞突變。此外,還利用微滴數(shù)字PCR技術(shù)對部分突變進(jìn)行驗證。整個實驗流程主要包括樣本收集與處理、DNA提取、全外顯子組測序、數(shù)據(jù)分析與驗證等步驟。通過比較斑塊樣本與血液白細(xì)胞樣本的測序結(jié)果,研究人員篩選出了斑塊特異性的體細(xì)胞突變,并據(jù)此推斷斑塊內(nèi)克隆細(xì)胞群的存在及其分布情況。
研究結(jié)果表明,13個頸動脈斑塊樣本中有12個檢測到了體細(xì)胞突變,而所有非動脈粥樣硬化動脈樣本中均未檢測到突變,這些突變主要集中在與收縮裝置相關(guān)的基因上,且突變克隆細(xì)胞在斑塊樣本中的比例往往超過10%。此外,部分?jǐn)y帶克隆性造血不定潛能(CHIP,clonal hematopoiesis of indeterminate potential)突變的造血細(xì)胞能侵入動脈粥樣硬化斑塊并在斑塊細(xì)胞群中占據(jù)一定比例,這些發(fā)現(xiàn)表明,體細(xì)胞突變和克隆細(xì)胞群是動脈粥樣硬化的重要特征之一。
綜上,本文研究通過全外顯子組測序技術(shù)首次在人類動脈粥樣硬化斑塊中發(fā)現(xiàn)了大量克隆細(xì)胞群的存在,這些克隆細(xì)胞群或會通過不對稱細(xì)胞增殖在斑塊形成和發(fā)展中發(fā)揮重要作用。此外,研究還發(fā)現(xiàn),CHIP克隆細(xì)胞能侵入動脈粥樣硬化斑塊,這就進(jìn)一步揭示了克隆性造血與動脈粥樣硬化之間的復(fù)雜聯(lián)系,相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)不僅為理解動脈粥樣硬化的病理機(jī)制提供了新的視角,也為未來的治療策略提供了新的思路。
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