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特朗普政府又“作妖”!CASP或因經費不足而停辦,曾誕生AlphaFold2諾獎成果,科研界痛惜!

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  特朗普政府削減科研經費下,已經嚴重波及到AI生命科學。

  根據Science報道,著名的CASP比賽(結構預測的關鍵評估)將因為NIH經費不足而停辦。

  要知道,AlphaFold2就是在CASP14上一舉成名,以近乎實驗室的精度實現對蛋白質三維結構的精準預測,碾壓所有對手,解決困擾生命科學60年的難題。

  就在該比賽4年后,AlphaFold2以重磅級成果獲得了2024年諾貝爾化學獎,足以見得其對行業的深遠意義。

  可以說CASP促進并見證了AI+生命科學的里程碑式突破。

  

  202年諾貝爾化學獎得主

  CASP極大程度地推動了AI+生命科學的進展。然而,這項舉辦了30年的計算生物學卻面臨著停辦危機。

  據報道,來自美國NIH美國國立衛生研究院的資金已經用完,并將在8月8日耗盡負責監督該贈款的加州大學 戴維斯分校的緊急支持。

  或許,我們將等不到CASP17了。

  

  AI生命科學推動者

  CASP全稱為Critical Assessment of Protein Structure Prediction,意為蛋白質結構預測的關鍵評估。

  該賽事始于1994年,當時計算生物學開始在學界興起,但所有團隊都聲稱自己的蛋白質折疊算法最優,各家都能給出自己的理由。

  大家意見不統一,是騾子是馬,不如拉出來溜溜?

  于是,為了幫助學界建立一個客觀、統一的評估標準,科學家John Moult及其伙伴創辦了CASP比賽。

  它通過盲測和獨立評估的方式,逐漸成為了評估蛋白質結構預測技術準確性的“黃金標準”。

  比賽中,參賽者們預測的是一些結構尚未公開的蛋白質,同時以獨立評估的方式,將其和實驗室結果進行嚴格的評分。

  其公正性得到了學界的一致認可,因此當AlphaFold2經驗亮相CASP14時,雖然震驚了學界,但科學家依然相信其評估結果。

  如今,該賽事已經發展成全球性的、兩年一度的結構預測比賽,每年有數百個團隊參與,被譽為AI生命科學界的“奧林匹克”

  中國也有不少團隊拿下過好成績,CASP15中拿下多個第一。常規target(單體蛋白)預測類別中,山東大學楊建益團隊排名第一;RNA結構預測類別中,中國公司智峪生科居榜首;蛋白質-配體復合物預測類別中,江蘇理工大學常珊博士團隊位列第一;蛋白質復合物界面接觸殘基精度評估類別中,浙江工業大學張貴軍團隊排名第一。

  可以說,CASP對于AI生命科學的意義是革命性的。它不僅驅動AI在生物學領域的應用,也促進了AI在整個藥物研發的應用。

  甚至因AlphaFold2獲得諾貝爾獎的Demis Hassabis稱,也許就在未來十年左右,我們也許能治愈所有疾病。

  沒有人想停下AI+生命科學的腳步。

  

  無奈停辦?

  盡管CASP見證了AlphaFold2這一諾貝爾獎成果,但一項諾獎成果只是AI+生命科學的開始。

  因為AlphAFold2只解決了單體蛋白質結構預測,CASP已經開始將目光投向更復雜的挑戰,如RNA結構預測、蛋白質-配體相互作用、蛋白質動力學等。

  如今的CASP已經遠遠超過其最初的規模,不僅項目一再拓展,同時不僅局限于科研,和產業界有了更多的聯系。

  例如,CASP新增一項比賽項目中是確定藥物分子如何與蛋白質靶標結合,這是發現新藥的關鍵。如果停辦,這些更前沿、更復雜的領域的評估和推動將面臨困難。

  然而現實是,不止是CASP比賽,很多科學家因為NIH經費削減連生存都處了問題。

  特朗普上臺后,白宮計劃在2026年將美國醫療健康支出費用削減四分之一以上,并將NIH的預算在今年的基礎上減少180億美元至270億美元,降幅達40%

  由于經費大幅度削減,導致NIH開啟徹底重組,據稱,已有近5000名NIH員工和承包商已被解雇,數千項研究與實驗陷入停滯狀態。

  今年2月,白宮還宣布要求將NIH的“間接經費”削減至預算的15%,引發了強烈的不滿。

  

  學界嚴厲地指出:特朗普政府的科研經費削減行動動搖了自第二次世界大戰以來美國聯邦政府資助大學科學研究的制度基礎。

  而CASP的停擺可能會在一定程度上削弱其作為AI驅動生物學進步的催化劑作用。

  因為CASP是唯一一個全球性的、獨立評估蛋白質結構預測方法準確性的比賽。如果停辦,研究人員將缺乏一個客觀、權威的平臺來比較和驗證新的方法。

  不僅項目本身需要資助,還包括加州大學戴維斯分校的贈款用于協調大批科學志愿者,包括實驗小組、建模小組、評估員等。

  組織者們仍然希望CASP 能夠得到資助。主辦方表示,如果NIH或其他資助者沒有通過,加州大學戴維斯分校目前正在探索是否有能力存檔CASP的計算機服務器。這樣,競爭對手幾十年的資源就不會丟失。

  科學家們紛紛痛惜,希望有人能夠繼續資助這項賽事。

  有人表示,谷歌或者Google DeepMind應該資助這項賽事,因為它們有充足的資源。

  但是,即使資金真的到賬,也不能保證在運行該計劃的人離開并且科學志愿者網絡解散后,CASP的成功會持續下去。

  —The End—

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