近期 Nature Medicine、Genome Biology 等期刊在微生物領域連發重磅研究。

? 來自斯坦福大學的研究團隊通過連續血糖監測、代謝生理檢測以及代謝組學、脂質組學、蛋白質組學和微生物組學等多維度多組學方法，發現與餐后血糖反應（PPGR）及代謝表型相關的分子標志物，揭示了個體對多種標準碳水化合物膳食 PPGR 的差異及其背后的代謝生理機制[1]。

?周宏偉教授、何肖龍教授團隊通過宏基因組、代謝等多組學聯合分析發現，肝硬化患者腸道中

Ruminococcus gnavus

?華大生命科學研究院基于華大自主測序平臺，開展宏基因組高通量深度測序，對大規模健康年輕人群的鼻腔微生物組進行研究，構建了迄今為止最為全面的鼻腔微生物群落目錄，揭示了不同性別的鼻腔微生物差異，并首次系統地評估鼻腔微生物這條「防線」的強度，為開發新的預防和治療策略提供了重要線索[3]。

如今發文越來越卷，如何將微生物研究與宏基因組測序與代謝等其他組學巧妙結合，以此碰撞出新的火花？「微生物+組學」的研究思路是什么？有哪些常見的發文套路？

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講師一：高杰 廣州醫科大學附屬第二醫院消化科 教授 博士生導師

主題：消化系統疾病宏基因功能酶挖掘

1. 聚焦腸道菌群功能酶在克羅恩病、肝性腦病中的突破性發現及臨床轉化；

2. 利用宏基因組、細菌培養組、代謝組等多組學分析發現腸道菌群 DL-內肽酶是產生 NOD2 配體的關鍵酶。體內實驗證明，低活性的 DL-內肽酶會增加小鼠對腸炎的易感性。直接補充 DL-內肽酶、產 DL-內肽酶益生菌或小分子 NOD2 激活劑，能通過激活 NOD2 信號緩解小鼠腸炎。深入闡述菌源 DL-內肽酶通過 NOD2 信號緩解克羅恩病具體機制；

3. 通過臨床隊列研究與宏基因組數據驗證發現肝硬化病人中單胺合成能力顯著提升并鎖定關鍵物種

Ruminococcus gnavus

講師二：張喆 深圳華大生命科學研究院 生物信息副研究員

主題：宏基因組測序鼻腔微生物組群落提升疾病預測與生物標志物發現

1. 通過大規模宏基因組測序分析，揭示鼻腔微生物組性別差異；

2. 構建了全面的人鼻腔細菌 MAGs 目錄，并整合真菌群落進行分析；

3. 在分類學和功能水平上系統評估性別差異，發現鼻腔微生物組在不同性別之間存在的廣泛性別特異性特征；

4. 鼻腔微生物群落關鍵物種的性別依賴性遺傳進化特征，表明遺傳進化力量在塑造性別特異性方面發揮了重要作用。

參考文獻

[1].Wu Y, Ehlert B, Metwally AA, et al. Individual variations in glycemic responses to carbohydrates and underlying metabolic physiology.

Nature Medicine

[2]He X, Hu M, Xu Y, et al. The gut–brain axis underlying hepatic encephalopathy in liver cirrhosis.

Nature Medicine

[3]Ju Y, Zhang Z, et al. Integrated large-scale metagenome assembly and multi-kingdom network analyses identify sex differences in the human nasal microbiome.

Genome Biol

內容策劃：劉青、潘成

內容審核：朱卿

題圖來源：圖蟲創意