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Cancer Cell |?非小細(xì)胞肺癌中的亞克隆性免疫逃逸

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撰文 | 楚雨蕁

對(duì)于大多數(shù)癌癥患者而言, 免疫治療 在臨床上僅有部分響應(yīng),這表明腫瘤內(nèi)的免疫壓力或敏感性并非均質(zhì)。不同腫瘤區(qū)域在免疫細(xì)胞浸潤的程度、新生抗原的表達(dá)以及T細(xì)胞受體庫( T cell receptor repertoire )等方面存在顯著差異,異質(zhì)性腫瘤區(qū)域可能由外部因素(例如基質(zhì)屏障影響免疫細(xì)胞浸潤、免疫抑制微環(huán)境等)驅(qū)動(dòng)和內(nèi)部因素(基因組不穩(wěn)定性、分支型腫瘤演化等)所致。 因此, 異質(zhì)性腫瘤個(gè)體中的 亞克隆之間 在 免疫逃逸能力 上存在 自身固有的差異 。 但僅通過描述性數(shù)據(jù)(如基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組分析 等 ),目前仍難以 評(píng)估 單個(gè)腫瘤亞克隆實(shí)際具備的免疫逃逸能力。

2025年 7 月 3 日,來自 倫敦 弗朗西斯·克里克研究所 Charles Swanton 團(tuán)隊(duì) 、 荷蘭癌癥研究所 Emile E. Voest 和 倫敦 大學(xué) 學(xué)院 Sergio A. Quezada 在 Cancer Cell 雜志上發(fā)表了文章 Subclonal immune evasion in non-small cell lung cancer , 基于團(tuán)隊(duì)前期在病人個(gè)體水平上建立的自體類器官-T細(xì)胞共培養(yǎng)體系 【1】 , 建立了一套 患者來源的可以評(píng)估T細(xì)胞對(duì)腫瘤不同亞克隆應(yīng)答情況 的研究平臺(tái) ,首次 在單克隆分辨率下實(shí)現(xiàn)了對(duì)免疫逃逸現(xiàn)象的直接功能性驗(yàn)證 , 研究結(jié)果表明 (1)不同腫瘤亞克隆在其免疫逃逸能力上存在 內(nèi)在 差異;(2)提供了一種能夠前瞻性發(fā)現(xiàn)和分離患者體內(nèi)免疫逃逸亞克隆的方法 ,提示亞克隆癌癥進(jìn)化持續(xù)塑造癌細(xì)胞的免疫逃逸特性。


接受免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICB)治療的非小細(xì)胞肺癌NSCLC)患者往往很少出現(xiàn)完全 響應(yīng) 的臨床反應(yīng) 【2,3】 ,因此,制定能夠?qū)崿F(xiàn)完全 緩解 腫瘤的治療策略是一個(gè)主要的臨床挑戰(zhàn)。NSCLC具有高度的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性 【4】 ,這種異質(zhì)性如何影響免疫逃逸機(jī)制尚不明確。目前基于基因組和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的描述性研究難以準(zhǔn)確識(shí)別具有免疫逃逸能力的腫瘤亞克隆, 同時(shí), 缺乏功能性驗(yàn)證平臺(tái)來評(píng)估亞克隆水平的免疫相互作用。

研究團(tuán)隊(duì) 利用 TRACERx肺癌進(jìn)化研究 (一項(xiàng) 基于原發(fā)及轉(zhuǎn)移性非小細(xì)胞肺癌多區(qū)域取樣的 前瞻性研究)中的 3名患者的11個(gè)不同腫瘤區(qū)域樣本,建立了81個(gè) 平行 的 類器官 克隆亞系 (clonal organoid sublines) ,通過與自體腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞 ( TIL ) 的共培養(yǎng)實(shí)驗(yàn) 發(fā)現(xiàn) , 取樣區(qū)域 不同 的 腫瘤類器官在誘發(fā)T細(xì)胞反應(yīng)方面存在顯著差異 ,同一腫瘤區(qū)域同時(shí)存在 引起強(qiáng)烈T細(xì)胞識(shí)別( 熱腫瘤 ) 和 僅產(chǎn)生有限激活( 冷腫瘤 ) 的亞克隆系,結(jié)果表明 即使在同一區(qū)域內(nèi),不同 亞 克隆系也表現(xiàn)出明顯的免疫逃逸能力異質(zhì)性。

通過對(duì)不同患者腫瘤亞克隆系類器官的全外顯子測(cè)序(WES) 和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析 發(fā)現(xiàn) ,免疫逃逸和非逃逸的腫瘤亞群代表著具有獨(dú)特進(jìn)化歷史的遺傳學(xué)上不同的亞克隆,在系統(tǒng)發(fā)育樹上分屬不同分支。 通過NY-ESO-1和MART-1肽段配對(duì)的T細(xì)胞受體-抗原系統(tǒng),進(jìn)一步發(fā)現(xiàn) 亞克隆免疫逃逸涉及依賴或不依賴于抗原的機(jī)制,并且類器官 - T細(xì)胞共培養(yǎng)平臺(tái)可用于區(qū)分這些機(jī)制。 對(duì)于其中無法獲得足夠的 自體 TIL的患者,通過類器官-NK細(xì)胞共培養(yǎng)體系,發(fā)現(xiàn)腫瘤類器官誘導(dǎo) NK細(xì)胞激活方面 的顯著差異,并與MHC-I的高表達(dá)呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。 令人意外的是,盡管進(jìn)行了全面的基因組和轉(zhuǎn)錄組學(xué)特征分析, 研究者們 發(fā)現(xiàn)僅憑描述性數(shù)據(jù)無法準(zhǔn)確識(shí)別具有免疫逃逸能力的 腫瘤 亞克隆 , 免疫逃逸相關(guān)基因的突變分析、PD-L1表達(dá)水平檢測(cè)以及 在轉(zhuǎn)錄水平的 差異表達(dá)分析均未能預(yù)測(cè)逃逸表型。

最后,研究者們通過 多重免疫熒光 技術(shù) 揭示了 不同免疫逃逸機(jī)制的局部免疫成分,結(jié)果表明,T細(xì)胞逃逸類器官來源區(qū)域表現(xiàn)出結(jié)構(gòu)化腫瘤細(xì)胞巢,而非T細(xì)胞逃逸區(qū)域表現(xiàn)出腫瘤細(xì)胞混亂、廣泛壞死以及伴隨中性粒細(xì)胞和明顯的CD8+T細(xì)胞的浸潤。巨噬細(xì)胞在T細(xì)胞逃逸區(qū)域主要局限于基質(zhì),在非T細(xì)胞逃逸區(qū)域則與腫瘤細(xì)胞直接混合,提示復(fù)雜的微環(huán)境可能為免疫敏感的腫瘤克隆提供額外的免疫逃逸途徑


綜上, 這項(xiàng)研究建立的類器官-T細(xì)胞共培養(yǎng)平臺(tái)能夠在單克隆分辨率下功能性識(shí)別免疫逃逸 腫瘤細(xì)胞 亞克隆,揭示腫瘤通過亞克隆異質(zhì)性而非單一機(jī)制實(shí)現(xiàn)免疫逃逸。 未來需擴(kuò)大樣本規(guī)模并在更多癌種中驗(yàn)證該平臺(tái)的通用性,同時(shí)建立與臨床免疫治療響應(yīng)的直接關(guān)聯(lián)以指導(dǎo)個(gè)性化治療策略。

https://doi.org/10.1016/j. ccell.2025.06.012

制版人: 十一

參考文獻(xiàn)


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