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AI 逆向設計抗癌藥,越想激活 STING,越要先「保護」cGAMP

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在癌癥免疫治療中,STING 通路一直被視為激活抗腫瘤免疫的關鍵。該通路可調動 I 型干擾素、激活樹突狀細胞和細胞毒性 T 細胞的通路,理論上能讓腫瘤微環境從「免疫沙漠」變為「免疫戰場」。

但很遺憾,現實很骨感。直接激活的藥物要么如同莽夫,直接開啟狂暴(啟動細胞因子風暴),要么局限在瘤內,幫助有限。此外,腫瘤微環境中的 ENPP1 能夠降解激活 STING 的關鍵分子 cGAMP,這也為治療帶來了頭疼的問題。

英矽智能在一項研究中,使用多種 AI 技術與來自患者的多組學數據得出一項結論:與其直接激活 STING ,不如抑制 ENPP1,讓腫瘤自己分泌的 cGAMP 積攢起來,進而被動激活 STING。

這項研究以「Oral ENPP1 inhibitor designed using generative AI as next generation STING modulator for solid tumors」為題,于 2025 年 5 月 23 日刊登于《Nature Communications》。



論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-025-59874-0

全新思路的發現與拓展

研究團隊用 PandaOmics 平臺分析了大量患者多組學數據,發現 ENPP1 在三陰性乳腺癌、肝癌、卵巢癌等「免疫冷腫瘤」中不僅呈高表達,還和 STING 通路活性呈負相關。

打個比方來說,ENPP1 就像腫瘤微環境里的剎車,踩得越狠,STING 通路越難激活,患者預后越差。

在結直腸癌和胃癌的空間轉錄組數據中,ENPP1 高表達區域基本無法采取任何免疫措施,CD8+ T 細胞和促炎巨噬細胞都對此敬而遠之。

而對于反向抑制 ENPP1 這種全新的思路,如何鎖定 ENPP1 作為新型免疫檢查點,成了這場戰役的核心策略。



圖 1:ENPP1 在實體瘤中作為固有免疫檢查點的驗證及 ENPP1 靶向策略的優先級確定。

傳統藥物研發像大海撈針,但生成式 AI 讓這一切變得高效。

研究團隊采用 Chemistry42 平臺,以已知 ENPP1 抑制劑 QS1 和 QPS2 為起點,通過設置指定結合點和多模型優化,短短幾步就生成了苗頭化合物 ISM7516。該分子抑制 cGAMP 降解的 IC(50) 低至 2.55 nM,比前輩 QS1 強了 50 多倍。



圖 2:生成式 AI 輔助發現的 ENPP1 抑制劑。

但 AI 的迭代還沒有結束。通過分子對接和結合能計算(Alchemistry 模塊),團隊發現 ISM7516 的磺酰胺基團和苯甲基能與 ENPP1 形成關鍵氫鍵和疏水作用。

他們將甲氧基換成甲基,搭配上氟原子增強親和力,再通過 ADMET 預測排除肝藥酶誘導和心臟毒性風險。最終,口服生物利用度高、選擇性強的 ISM5939 誕生了。

ISM5939 對 ENPP1 的 IC(50) 低至 0.63 nM,對 ENPP2 和 ENPP3 的選擇性超過 15000 倍,堪稱指哪打哪的精準武器。

從實驗室到小鼠模型

在細胞實驗中,ISM5939 展現了它的性能:在表達 ENPP1 的乳腺癌細胞里,它能讓分泌到細胞外的 cGAMP 水平提升數倍,而且這種效果在 ENPP1 敲除細胞中消失,證實了靶向操作的真實性。

更妙的是,它激活 STING 通路靠的是「借刀殺人」—— 讓腫瘤分泌的 cGAMP 被樹突狀細胞攝取,而非直接刺激 T 細胞,避免了傳統 STING 激動劑的誤傷。

在小鼠模型中,ISM5939 口服給藥后,腫瘤里的 cGAMP 和 IFN-β 水平顯著升高,對應的腫瘤微環境里促炎的 M1 型巨噬細胞增多,CD8+ T 細胞分泌更多穿孔素和干擾素。



圖 3:ISM5939 保護腫瘤分泌的 cGAMP,并在 APC 中協調非細胞自主的 STING 激活。

這些要素與 PD-1 抑制劑聯用時,在 MC38 結直腸癌模型中實現了 1+1>2 的效果,腫瘤抑制率比單藥高 40% 以上。對化療耐藥的三陰性乳腺癌模型,ISM5939 聯合順鉑也能讓 cGAMP 水平翻倍,腫瘤生長速度減半。

對比傳統 STING 激動劑 diABZI 和 MSA-2,它不會誘導血漿中 IFN-β、IL-6 等炎癥因子飆升,也不會殺死 T 細胞。在大鼠和犬的 28 天毒性實驗中,即使高劑量給藥,也沒有嚴重副作用,肝腎指標基本正常——這對臨床轉化至關重要。

別出心裁的探索方式

實體瘤治療歷來是硬骨頭,尤其是對免疫檢查點抑制劑耐藥的病癥,患者往往面臨無藥可用的困境。

ISM5939 的出現,不僅提供了口服 STING 調節劑的全新治療方式,,更展現了 AI 在藥物研發中的獨特價值:從靶點發現到分子優化,它能快速整合多維度數據,極大幅度地降低傳統研發的試錯成本。

當然,AI 不是萬能的。論文也坦言,如何預測患者對 ENPP1 抑制劑的響應,如何應對腫瘤微環境的異質性,仍是未來需要攻克的難題。

但至少從靶點驗證到藥物優化,AI 展現了它高效整合數據和預測分子特性的能力,而 ISM5939 在多種小鼠模型中的優異表現,更預示著其臨床轉化的潛力。

未來,隨著生物標志物研究的深入,ENPP1 抑制劑有望與現有療法聯合,為「免疫冷腫瘤」患者打開新的治療窗口 —— 這既是 AI 驅動藥物研發的里程碑,也是人類對抗癌癥的重要一步。

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