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七重跨膜受體GPCR和干細(xì)胞的諾貝爾獎(jiǎng)

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兩篇:

1)一個(gè)可能的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)

2)取其精華去其失誤:析2012年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)和生理獎(jiǎng)

1) 一個(gè)可能的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)

我們知道:諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì),不時(shí)地肯定化學(xué)和生物交叉的工作,比較常見的是生物化學(xué)和生物物理學(xué)的工作,有時(shí)也給分子生物學(xué)。

2003—2009年共7年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),有5年頒給生物學(xué)研究:2003年鉀通道的結(jié)構(gòu)和水通道,2004年蛋白質(zhì)降解,2006年基因轉(zhuǎn)錄的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究,2008年綠色熒光蛋白,2009年合成蛋白質(zhì)的核糖體結(jié)構(gòu)。

其中,結(jié)構(gòu)生物學(xué)占了很大比重(2003年、2006年和2009年)。

我們也知道:諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)經(jīng)常犯錯(cuò)誤,不該給的他們給了,該給的他們沒給,兩種錯(cuò)誤都犯過。

2003年,不應(yīng)該獎(jiǎng)水通道的發(fā)現(xiàn),因?yàn)椴⒉蛔銐蛲怀觯翰皇堑谝粋€(gè)通道(是第幾十個(gè)通道),也無特殊性。

2006年,化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)里的化學(xué)家只重視自己懂的,而忽略了同一科學(xué)領(lǐng)域中偏生物但更重要的工作。在基因轉(zhuǎn)錄領(lǐng)域,有兩項(xiàng)工作的重要性毫無疑問高于解出轉(zhuǎn)錄因子的X射線晶體結(jié)構(gòu):Mark Ptashne發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子;Robert Roeder發(fā)現(xiàn)了RNA多聚酶。但諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)過分強(qiáng)調(diào)結(jié)構(gòu)而忽略了轉(zhuǎn)錄領(lǐng)域中更重要的生物學(xué)工作。

基本可以放心:化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)一如既往地跨界出現(xiàn)錯(cuò)誤,既不是第一次,也不會(huì)是最后一次。

不過,化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)繼續(xù)給結(jié)構(gòu)生物學(xué)發(fā)獎(jiǎng)時(shí),如果做到一個(gè)中等偏上的研究生的水平(比如本文就是給研究生上課過程中兩句帶過,也是中上研究生可以寫出來的),就可以公平地獎(jiǎng)勵(lì)一個(gè)大家都會(huì)公認(rèn)的工作。談不上將功補(bǔ)過,可以證明他們不都經(jīng)常膚淺。

可以獎(jiǎng)對于G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究。

GPCR是細(xì)胞膜的跨膜蛋白,一般來說,它的作用是將細(xì)胞外的信號轉(zhuǎn)入細(xì)胞內(nèi)。

GPCR的發(fā)現(xiàn)歷史很長。第一個(gè)GPCR是在19世紀(jì)發(fā)現(xiàn)于眼睛視網(wǎng)膜上。1851年,H. Müller發(fā)現(xiàn)視網(wǎng)膜紅紫色,認(rèn)為是血紅蛋白造成的。年輕的德國醫(yī)生博爾F. B?ll (1849—1879)用實(shí)驗(yàn)證明視網(wǎng)膜漂白,并提出其物質(zhì)基礎(chǔ)是“紅紫物質(zhì)”,這種物質(zhì)存在于視桿細(xì)胞中,可進(jìn)行光化學(xué)反應(yīng)。不幸他因肺結(jié)核而英年早逝。B?ll這篇論文在1877年發(fā)表后不久,德國醫(yī)生W. Kühne 很快繼續(xù)這項(xiàng)研究,投入大量時(shí)間和精力,在1878—1882年發(fā)表了22篇論文。他將紅紫物質(zhì)稱為“視紫”(visual purple),還發(fā)現(xiàn)了光化學(xué)還原,并用膽鹽提取了視紫,也就是后來大家所謂的“視紫蛋白”(rhodopsin)。屈內(nèi)提出,光解構(gòu)視紫蛋白,解構(gòu)的光化學(xué)反應(yīng)產(chǎn)物刺激視神經(jīng)。

以后的實(shí)驗(yàn)證明,視紫蛋白確實(shí)對視覺非常重要。

從生物化學(xué)和生物物理學(xué)角度來說,這是第一個(gè)細(xì)胞膜蛋白。不僅對于理解視覺有推動(dòng),而且有助于以后研究和理解其他一些膜蛋白。在很長一段時(shí)間里,這是唯一被較多人研究的膜蛋白。

視紫蛋白不僅存在于有視覺的高等動(dòng)物中,也存在于細(xì)菌中。在細(xì)菌中,雖然不能形成視覺,但視紫蛋白可以用于感光。

哺乳類的視紫蛋白由約350個(gè)氨基酸連接組成。到1970年,美國加州大學(xué)洛杉磯分校的研究者獲得其9個(gè)氨基酸的順序,1977年美國的P. A. Hargrave獲得其16個(gè)氨基酸的順序。1983年,借助于分子生物學(xué)技術(shù),哈格雷夫等和前蘇聯(lián)的奧夫奇尼科夫Y. A. Ovchinnikov等分別推出牛視紫蛋白的全部氨基酸序列。

20世紀(jì)60—80年代,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)G蛋白調(diào)節(jié)很多遞質(zhì)和激素的受體,這些受體就都稱為GPCR,其氨基酸順序類似于視紫蛋白的。因?yàn)榘l(fā)現(xiàn)G調(diào)節(jié)蛋白和提出GPCR概念,美國的A. Gilman和M. Rodbell獲1994年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。

這樣,研究視紫蛋白和研究一般GPCR實(shí)質(zhì)是同一類研究,差別只在于視紫蛋白參與細(xì)胞對光的反應(yīng),其他GPCR一般參與細(xì)胞對細(xì)胞外化學(xué)分子的反應(yīng),2011年3月,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)果蠅視紫蛋白可能參與對溫度的反應(yīng)。

用X射線晶體衍射研究蛋白質(zhì)的空間三維結(jié)構(gòu),是人們理解蛋白質(zhì)功能的一條重要途徑。人們可以在分子和原子水平上理解生物分子如何起作用,并通過結(jié)構(gòu)分析提出合理的方法來設(shè)計(jì)新的藥物,所以這一直是生物與化學(xué)、物理交叉的重要領(lǐng)域。不僅如上文提到的2003年以后諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)多次授予結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域,以前也較多,如1962年佩魯茨(Max Perutz)和肯德魯(John Kendrew),1964年霍奇金(Dorothy Hodgkin),1982年Aaron Klug,1988年Johann Deisenhofer、Robert Huber和Hartmut Michel,1997年John Walker,等等。當(dāng)然,這些獎(jiǎng)也并非個(gè)個(gè)沒有爭議,但1962年和1964年的是大家公認(rèn)的重要工作。

對于視紫蛋白/GPCR的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究,幾乎肯定會(huì)獲得諾貝爾獎(jiǎng)。

1997年,日本的木村(Yoshiaki Kimura)等解析了細(xì)菌的視紫蛋白結(jié)構(gòu)。2000年,美國的K. Palczewski等解析出牛視紫蛋白的結(jié)構(gòu)。2007年,美國斯坦福大學(xué)的Brian Kobilka和斯克里普斯研究所的Raymond Stevens解析出也屬于GPCR類的β-腎上腺素受體的結(jié)構(gòu)。其后他們和一些實(shí)驗(yàn)室不斷解析出新的GPCR的結(jié)構(gòu),以及GPCR結(jié)合了激動(dòng)劑或抑制劑的結(jié)構(gòu)。此后相當(dāng)一段時(shí)間,解析GPCR的文章在《自然》《科學(xué)》上發(fā)表如雨后春筍。

從工作重要性來說,早期的里程碑非常清晰,之后的每次解析并非都是一個(gè)人的工作,但相對來說可以看到有些貢獻(xiàn)比較突出。例如,在獲得視紫蛋白的氨基酸序列中,貢獻(xiàn)最大是美國的Hargrave,最初解析細(xì)菌視紫蛋白結(jié)構(gòu)的是日本大阪生物分子工程研究所的木村,第一個(gè)解析動(dòng)物視紫蛋白結(jié)構(gòu)的是Palczewski,第一個(gè)解析非視紫蛋白的GPCR結(jié)構(gòu)的是Kobilka。

實(shí)際上,如果諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)水平稍微提高一點(diǎn),1997年解出細(xì)菌視紫蛋白的木村應(yīng)于2003年獲獎(jiǎng)。那一年,曾在1998年第一個(gè)解析出鉀通道蛋白的麥金農(nóng)Roderick MacKinnon獲獎(jiǎng)。2003年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)應(yīng)該同時(shí)頒給MacKinnon和木村,而不應(yīng)該頒給做水通道的工作(實(shí)際上沒有給木村),因?yàn)镸acKinnon和木村分別解析出兩個(gè)非常重要的膜蛋白結(jié)構(gòu)。當(dāng)然,化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)水平有限,只知道跟蹤生物的熱點(diǎn);鉀通道的結(jié)構(gòu)被解析后,立即受到大家重視,化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)就了解到這種重視,而視紫蛋白那時(shí)沒有熱起來,所以化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)就不知道自己做功課了。

最近幾年,因?yàn)閷PCR結(jié)構(gòu)的研究非常熱門,所以,水平如化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)的人也會(huì)知道,所以肯定會(huì)得獎(jiǎng)。

不過,縱觀其歷史失誤率,也可以猜想它還很可能犯錯(cuò)誤。例如,忽略生物學(xué)領(lǐng)域中哈格雷夫做的重要的一步,或再度忽略木村的工作,而只把獎(jiǎng)?lì)C給做牛視紫蛋白和后面GPCR的科學(xué)家,甚至只頒給做GPCR的科學(xué)家。

無論這個(gè)委員會(huì)怎么犯錯(cuò)誤,對于稍花點(diǎn)時(shí)間了解這個(gè)領(lǐng)域的人來說,發(fā)現(xiàn)這個(gè)領(lǐng)域中已經(jīng)做出的重要工作并非難事。

在視紫蛋白是冷門的時(shí)候,沒有幾個(gè)實(shí)驗(yàn)室競爭研究其結(jié)構(gòu)。在沒有一個(gè)GPCR被解析出的時(shí)候,競爭也不多。當(dāng)現(xiàn)在成為熱點(diǎn),解析出一個(gè)GPCR的結(jié)構(gòu),就發(fā)一篇文章,吸引一批讀者和引用的時(shí)候,真正具有突破性的,還是以前的幾項(xiàng)主要工作。

從生物學(xué)機(jī)理理解的需要來看,結(jié)構(gòu)生物學(xué)將在可以預(yù)見的將來繼續(xù)發(fā)揮很大作用,其中經(jīng)典的X射線衍射結(jié)構(gòu)分析,也會(huì)繼續(xù)很有用。如果今后能夠做大分子活體結(jié)構(gòu)、動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu),在生物體系中觀察結(jié)構(gòu)變化,而不局限于結(jié)晶的分子、水中的小分子,那么廣義的結(jié)構(gòu)生物學(xué)將起更大作用。

2011年4月發(fā)表于《北大校刊》,2012年,美國的 Brian Kobilka和Robert Lefkowitz因GPCR研究獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。

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2)取其精華去其失誤:析2012年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)和生理獎(jiǎng)

在諾貝爾獎(jiǎng)公布后,討論相關(guān)的科學(xué)研究,有助于公眾了解科學(xué)、科學(xué)界重溫研究歷程、學(xué)生學(xué)習(xí)和理解科學(xué)工作。

2.1)2012年化學(xué)獎(jiǎng)的問題

諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)近9年來6次發(fā)給生物方面工作,雖然委員會(huì)有生物成員,仍經(jīng)常出問題,今年的化學(xué)獎(jiǎng)也不例外。

與今年化學(xué)獎(jiǎng)相關(guān)的,有兩位科學(xué)家的工作很重要:日本的Kimura和美國的Hargrave。雖然他們被委員會(huì)忽略,他們的工作重要性不亞于今年得獎(jiǎng)的Lefkowitz。

雖然Lefkowitz研究GPCR(G蛋白偶聯(lián)受體)很有苦勞(做了很多好的工作),但功勞(單項(xiàng)突出工作)卻不夠突出。化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)稱Lefkowitz和同事“made a seminal contribution when they cloned and sequenced the first receptor for epinephrine, βAR (33)”(克隆和測序腎上腺素能受體),這個(gè)說法有4個(gè)問題。

首先,1980年代很多人克隆多種受體的基因,這些受體的重要性并不低于GPCR,工作最突出為日本的Shosaku Numa,其次是當(dāng)時(shí)在美國的德國科學(xué)家Axel Ullrich,他們克隆了多個(gè)重要蛋白質(zhì)的基因,包括受體、離子通道等。化學(xué)獎(jiǎng)介紹了Lefkowitz在克隆基因前期的標(biāo)記和純化GPCR蛋白質(zhì)的工作,確是同期重要的工作,但總體上Lefkowitz不如Numa突出。

其次,眼睛的視桿蛋白(rhodopsin)也是GPCR,而其基因在Lefkowitz工作以前好幾年就成功了。1977年美國的Hargrave獲得視桿蛋白氨基端部分序列,其后Hargrave(1982,1983)和俄國的Ovchinnikov(1982、1983)獲得視桿蛋白基因確定其編碼蛋白質(zhì)的全長序列。美國的Jeremy Nathans(1983)也克隆視桿蛋白的基因,并在1984到1986年一系列工作,確定眼睛4個(gè)GPCRs,并通過漂亮的遺傳學(xué)方法證明三個(gè)色覺相應(yīng)的GPCRs。而Lefkowitz參與的克隆腎上腺素能受體基因的工作發(fā)表于1986年(Dixon et al.,1986),比視桿蛋白的三個(gè)工作都要晚好幾年。雖然視桿蛋白是由光子激活的GPCR、而腎上腺素能受體是被化學(xué)分子激活的GPCR,他們的序列高度相似。1986年腎上腺素能受體基因克隆的論文,其標(biāo)題也強(qiáng)調(diào)與視桿蛋白的相似性。

第三,化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)引用的論文33,是1986年克隆腎上腺素能受體基因的工作。但這篇文章(Dixon et al., 1986)中,Lefkowitz既不是第一作者,也不是通訊的最后作者,Lefkowitz實(shí)驗(yàn)室非此工作的主力,第一和最后作者在Merck Sharp and Dohme公司(今稱默沙東)的研究部門工作。如果按化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)認(rèn)為這項(xiàng)工作是化學(xué)分子激活GPCR的代表性工作,那么最大功勞就不是Lefkowitz。諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)在引用和講述這篇文章的時(shí)候,把主要的人變成了名字可以忽略的“同事”,而不是文章最主要的作者,出現(xiàn)的就不僅是矛盾,而有點(diǎn)蹊蹺。

第四,大家公認(rèn)Brian Kobilka的結(jié)構(gòu)生物學(xué)工作。他堅(jiān)持多年后,于2007年成功地解析了化學(xué)分子激活的GPCR結(jié)構(gòu)(Rasmussen et al., 2007; Rosenbaum et al., 2007),并有一系列漂亮的后繼工作。如果按解析GPCR蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的工作來評價(jià),此前還有視桿蛋白的結(jié)構(gòu)已經(jīng)被解析:1997年,日本科學(xué)家Yoshiaki Kimura等解析細(xì)菌的視桿蛋白、2000年美國的Palczewski解析動(dòng)物的視桿蛋白。

所以,無論如何組合,Lefkowitz都難以進(jìn)入前三。可惜化學(xué)獎(jiǎng)委員會(huì)繼續(xù)不如一個(gè)用功的研究生,再次忽略了很容易看到的工作。

2.2)2012年生理獎(jiǎng)的背景

2012年的諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng),肯定了發(fā)育生物學(xué)基本問題的研究。

這是發(fā)育生物學(xué)第四次獲諾貝爾獎(jiǎng)。第一次是1935年德國的Hans Spemann (1869-1941)(因?yàn)樗l(fā)現(xiàn)胚胎誘導(dǎo)現(xiàn)象)、第二次是1986年意大利女科學(xué)家Rita Levi-Montalcini(1909-)(因?yàn)樗l(fā)現(xiàn)神經(jīng)生長因子)、第三次是1995年德國的女科學(xué)家Christiane Nüsslein-Volhard、美國的Eric Wieschaus和Edward Lewis(因?yàn)樗麄冄芯抗壈l(fā)育的基因)。百年來,發(fā)育的獎(jiǎng)一半給了德國,是因?yàn)榈聡谑攀兰o(jì)創(chuàng)立了近代發(fā)育生物學(xué),并多年領(lǐng)先。

我們每個(gè)人都是始于一個(gè)細(xì)胞(受精卵)。這一個(gè)細(xì)胞分成兩個(gè)細(xì)胞,再分成四、八、十六、三十二、六十四個(gè)細(xì)胞,如此直至很多很多細(xì)胞,而這些細(xì)胞的形態(tài)和功能都不一樣。也就是說,最初的一個(gè)細(xì)胞,有多種潛能,而最后分化的細(xì)胞,只參與一個(gè)功能,比如長出頭發(fā)的細(xì)胞、組成眼睛的細(xì)胞,不同于腦中、肝臟和腎臟的主要細(xì)胞。

從發(fā)育生物學(xué)來說,一個(gè)多潛能的細(xì)胞,如何變成分化的細(xì)胞,這個(gè)過程發(fā)生了什么變化、是否可逆?

從再生醫(yī)學(xué)希望人造器官來說,粗略可以分成兩步:第一步把已分化的細(xì)胞(如皮膚的細(xì)胞)退回多潛能狀態(tài)的細(xì)胞(多能干細(xì)胞);第二步把多能干細(xì)胞變成我們需要的細(xì)胞(比如腎臟的細(xì)胞)?如果可以這樣,也許當(dāng)我們失去眼睛、腎臟、胳膊的時(shí)候,我們用自己無關(guān)緊要的細(xì)胞(如皮膚上刮下一點(diǎn)),重新制造我們失去的細(xì)胞、組織、器官,在應(yīng)用上有著誘人的前景,可惜目前還做不到。

Gurdon和山中伸彌的工作與第一步有關(guān):Gurdon研究是否分化的細(xì)胞能退回多能細(xì)胞,而山中伸彌研究用什么分子可以將分化的細(xì)胞退回多能干細(xì)胞。有很多人在做第二步(將多能干細(xì)胞變成我們希望的分化細(xì)胞),但尚需確定高效的、公認(rèn)的、無副作用的方法。

Gurdon和山中伸彌的工作在目前來說做得相當(dāng)好,所以得了諾貝爾獎(jiǎng)。但這類工作有其他里程碑,另外并未終結(jié)此領(lǐng)域的研究,現(xiàn)在也不是非常清楚山中伸彌的成果最后應(yīng)用意義有多大。

他們的工作本身有很長的歷史背景,可以推到十九世紀(jì)德國的近代實(shí)驗(yàn)胚胎學(xué)創(chuàng)始人Wilhelm Roux (1850-1924)。但簡單的是推到1952年,美國費(fèi)城的科學(xué)家Robert Briggs和Thomas King。他們于1952年發(fā)表一篇論文,將原來只在單細(xì)胞生物阿米巴做過的核移植技術(shù)(nuclear transfer),成功地建立于多細(xì)胞生物。他們把蛙的細(xì)胞核轉(zhuǎn)移到另外一個(gè)去除細(xì)胞核的細(xì)胞里面,讓后者發(fā)育生長。他們想檢驗(yàn)細(xì)胞核在發(fā)育過程中是否潛能有所改變。當(dāng)時(shí),他們只檢查了胚胎發(fā)育比較早的幾個(gè)時(shí)期細(xì)胞核,發(fā)現(xiàn)越早成功率越高。

1996年英國愛丁堡Roslin研究所Wilmut團(tuán)隊(duì)把羊胚胎的細(xì)胞到體外培養(yǎng)后,取其細(xì)胞核移植到早期卵母細(xì)胞,可以長成羊(Campbell et al., 1996)。1997年,Wilmut等從成年羊的乳腺中獲得細(xì)胞,取細(xì)胞核移植到卵母細(xì)胞,可以獲得羊(Wilmut et al., 1997)。1997年克隆羊的實(shí)驗(yàn),證明哺乳類動(dòng)物分化的細(xì)胞,其細(xì)胞核可以重新變成具有全能性的胚胎干細(xì)胞。


所以,核移植與細(xì)胞核全能性的工作,突出的是Briggs和King、Gurdon、Wilmut。不過,Briggs于1983年去世、King于2000年去世。

Gurdon本人為很多人尊敬,有很多人希望他得獎(jiǎng)。他是一個(gè)非常聰明的人(最近我才聽說中學(xué)老師認(rèn)為他生物學(xué)很差,不過這不是后來科學(xué)家對他的評價(jià),他在1990年代的研究,與我當(dāng)時(shí)的研究是同一領(lǐng)域,我們常感嘆他的研究聰明,也曾推薦學(xué)生上課要讀他1990年代的文章)。在英國有一批科學(xué)家,他們做工作很有趣,做科學(xué)不是為了吃飯,是為了好玩。美國也許從來沒有過紳士科學(xué)家,現(xiàn)在英國這樣的科學(xué)家也不多了,Gurdon是紳士科學(xué)家。

日本科學(xué)家今年得獎(jiǎng)的工作有兩個(gè)基礎(chǔ),一是核移植顯示分化細(xì)胞的核未喪失全能性,另一是分子生物學(xué)研究細(xì)胞命運(yùn)。研究細(xì)胞命運(yùn)的基因,最重要的工作是德國的Christiane Nüsslein-Volhard、美國的Eric Wieschaus和Edward Lewis,他們發(fā)現(xiàn)了很多控制果蠅胚胎發(fā)育的基因,于1995年獲諾貝爾獎(jiǎng)。他們研究的主要方式是讓單個(gè)基因突變以后,看胚胎的表型,從而推論某個(gè)基因?qū)δ硞€(gè)發(fā)育過程是必需的。1987年美國西雅圖Fred Hutchison癌癥研究中心Harold Weintraub實(shí)驗(yàn)室做了一個(gè)很漂亮的實(shí)驗(yàn)。他帶領(lǐng)研究生Robert Davis和博士后Andrew Lassar,用分子生物學(xué)的方法研究一個(gè)基因?qū)?xì)胞命運(yùn)是否起到充分的作用。有一種成纖維細(xì)胞(稱C3H10T1/2),在一種藥物處理下,不知為什么,會(huì)變成肌肉細(xì)胞。Weintraub實(shí)驗(yàn)室比較成纖維細(xì)胞和肌肉細(xì)胞之間表達(dá)哪些不同的基因,找到三個(gè)差異表達(dá)的基因。他們將每一個(gè)基因單獨(dú)轉(zhuǎn)入成纖維細(xì)胞,結(jié)果其中一個(gè)可以將成纖維細(xì)胞變成肌肉細(xì)胞,他們稱這一基因?yàn)镸yoD(肌肉決定)(Davis et al., 1987)。其后,他們和多個(gè)實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn),MyoD可以將好些不同細(xì)胞變成肌肉細(xì)胞,這是通過單個(gè)基因改變細(xì)胞命運(yùn)的里程碑。2012年Lasker獲得者Tom Maniatis稱Weinbraub是他認(rèn)識的最聰明的生物學(xué)家,可惜Weintraub患腦瘤去世了。

1995瑞士巴塞爾生物中心的Walter Gehring帶領(lǐng)實(shí)驗(yàn)室發(fā)表一篇論文,發(fā)現(xiàn)在果蠅中,用一個(gè)基因可以誘導(dǎo)眼睛產(chǎn)生,果蠅的這個(gè)基因稱為eyeless、它在脊椎類動(dòng)物的類似基因稱為Pax6。還在摩爾根時(shí)代就知道:沒有這個(gè)基因,眼睛減小很多。Gehring實(shí)驗(yàn)室克隆到這個(gè)基因后,發(fā)現(xiàn)它平時(shí)表達(dá)在早期眼睛里,而通過轉(zhuǎn)基因?qū)⑺磉_(dá)到身體其他部分,可以在多個(gè)部位長出眼睛,如翅膀上、腿上(Halder,Callaerts and Gehring 1995)。這表明,通過單個(gè)基因可以改變一些細(xì)胞的命運(yùn)導(dǎo)致一個(gè)器官的形成,至少在果蠅如此。

可惜的是,在脊椎動(dòng)物、哺乳動(dòng)物,還沒有找到用單個(gè)、或多個(gè)基因制造組織、器官的方法,人造生物器官的夢想還需要努力。

多能干細(xì)胞也是一種細(xì)胞命運(yùn)。1990年,日本的Okamoto等、德國的Scholer等分別獨(dú)立發(fā)現(xiàn)多能干細(xì)胞特異表達(dá)的Oct4基因。2003年,山中伸彌實(shí)驗(yàn)室和英國的Chambers等獨(dú)立發(fā)現(xiàn)另一個(gè)對維持多能干細(xì)胞重要的基因Nanog(Mitsui et al., 2003;Chambers et al., 2003)。Oct4和Nanog可以使少數(shù)種類的細(xì)胞變成干細(xì)胞,但一般來說,它們單獨(dú)不能將分化的細(xì)胞變成干細(xì)胞,還需要其他因素。

在這些基礎(chǔ)上,有了山中伸彌的工作。

山中伸彌原來的科學(xué)背景較弱,在美國進(jìn)修時(shí)實(shí)驗(yàn)室也不是很好,回到日本時(shí)的研究條件也不很好。但他堅(jiān)持不懈,一步一步,沿著自己原來的研究經(jīng)常問問題,最后做了很好的工作。2003年,他實(shí)驗(yàn)室作為發(fā)現(xiàn)Nanog的兩個(gè)實(shí)驗(yàn)室之一(Mitsui et al., 2003;Chambers et al., 2003),首次為較多科學(xué)家注意。進(jìn)一步,他實(shí)驗(yàn)室的Takahashi和他選擇了多能干細(xì)胞與一般細(xì)胞不同的基因,他們估計(jì)了24個(gè)基因,然后把24個(gè)基因同時(shí)導(dǎo)入分化的細(xì)胞,結(jié)果能夠?qū)⒑笳咿D(zhuǎn)化為多能干細(xì)胞,他們逐步做減法,減去某一個(gè),最后發(fā)現(xiàn)只需要4個(gè)基因(Myc,Oct4,Sox2和Klf4)就足以將分化的細(xì)胞變成多能干細(xì)胞(Takahashi and Yamanaka,2006)。他們將由此得到的干細(xì)胞稱為誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPS)。這一工作立即引起廣泛的矚目。

他們2006年的工作是用老鼠細(xì)胞做的。2007年,他實(shí)驗(yàn)室(Takahashi et al.,2007)、以及美國迪斯康斯大學(xué)湯姆森實(shí)驗(yàn)室的俞鈞瑛等(Yu et al., 2007),獨(dú)立報(bào)道4個(gè)基因也可以使人的細(xì)胞轉(zhuǎn)化為多能干細(xì)胞,兩個(gè)實(shí)驗(yàn)室用的具體4個(gè)基因有2個(gè)不同。

iPS立即為很多實(shí)驗(yàn)室使用,并認(rèn)為有很多應(yīng)用潛能。不過,iPS的應(yīng)用還有尚未完全解決的問題。最后用于再生醫(yī)學(xué)的途徑和方法,迄今未知,所以,如果最后需要制造干細(xì)胞,而且制造干細(xì)胞的方法是通過用基因誘導(dǎo)干細(xì)胞,那么今年獎(jiǎng)山中伸彌是對的。不過,也還有可能:最后應(yīng)用的方法不用制造干細(xì)胞,直接從一種分化的細(xì)胞變成另外一種分化的細(xì)胞,省略干細(xì)胞一步,那么方法就完全是Weintraub等1987年發(fā)明的;也可能最后制造應(yīng)用的方法是目前大家想不到、完全不同于山中伸彌的方法和途徑。所以,雖然大家對iPS還在興奮期間,但工作尚未完成、意義未經(jīng)長期檢驗(yàn)。

很多人推崇已經(jīng)79歲的Gurdon,把他和山中伸彌合在一起,可能也是山中伸彌2006年工作出來時(shí)間不久就獲獎(jiǎng)的原因之一。


2018年3月25日劍橋大學(xué)2012年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)獲得者John Bertrand Gurdon與饒毅教授

1.3) 結(jié)語

對各種評價(jià)/評審共識度是否高,取決于:1)領(lǐng)域是否有共同價(jià)值觀,2)評審者的專業(yè)水平,3)評審者的公正性,以及4)評審者花一定的精力做足功課。文學(xué)獎(jiǎng)與和平獎(jiǎng)難以獲得大家共識,主要是第一種原因,討論起來很快就變成價(jià)值和立場的爭論。而諾貝爾自然科學(xué)獎(jiǎng),雖然一般在科學(xué)界有相當(dāng)大的共識,但也會(huì)出現(xiàn)不同意見、出現(xiàn)錯(cuò)誤,常是第四種原因。在國內(nèi)評審中,可能第三種情況多一些。

如果將諾貝爾獎(jiǎng)奉為神明,不直接讀原始文獻(xiàn),講課、寫教科書按諾貝爾獎(jiǎng)的描述,就可能夸大一些工作、忽略一些真正重要的工作,不了解科學(xué)事實(shí)和研究的歷史進(jìn)程,有時(shí)誤導(dǎo)學(xué)生和其他后來者。

如果誤以為發(fā)了諾貝爾獎(jiǎng)就是定論,就可能因?yàn)橹Z貝爾獎(jiǎng)的寫法而誤以為某項(xiàng)工作已經(jīng)達(dá)到頂峰。實(shí)際上,有時(shí)不是這樣。我們在肯定獲獎(jiǎng)工作正確部分的同時(shí),無需崇拜、不應(yīng)該被迷惑,有時(shí)意識到還有可能另辟蹊徑,走不同的道路、做不同的研究,才更有意義。

文獻(xiàn):

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Chambers I, Colby D, Robertson M, Nichols J, Lee S, Tweedie S, Smith A (2003). Functional expression cloning of Nanog, a pluripotency sustaining factor in embryonic stem cells. Cell 113:643-655.

Davis RL, Weintraub H, Lassar AB (1987) Expression of a single transfected cDNA converts fibroblasts to myoblasts. Cell 51:987-1000.

Dixon RAF, Kobilka BK, Strader DJ, Benovic JL, Dohlman HG, Frielle T, Bolanowski MA, Bennett CD, Rands E, Diehl RE, Mumford RA, Slater EE, Sigal IS, Caron MG, Lefkowitz RJ and Strader CD (1986). Cloning of the gene and cDNA for mammalian b-adrenergic receptor and homology with rhodopsin. Nature 321:75-79.

Gurdon JB, Elsdale TR, Fischberg M (1958). Sexually Mature Individuals of Xenopus laevis from the Transplantation of Single Somatic Nuclei. Nature 182:64–65.

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Kimura, Y., Vassylyev, D.G., Miyazawa, A., Kidera, A., Matsushima, M., Mitsuoka, K., Murate, K., Hirai, T. & Fujiyoshi, Y. (1997). Surface of bacteriorhodopsin revealed by high-resolution electron crystallography. Nature 389:206-211.

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Takahashi K, Tanabe K, Ohnuki M, Narita M, Ichisaka T, Tomoda K, Yamanaka S (2007). Induction of pluripotent stem cells from adult human fibroblasts by Defined Factors. Cell 131:861–872.

Wilmut I, Schnieke AE, McWhir J, Kind AJ and Campbell KHS (1997). Viable offspring derived from fetal and adult mammalian cells. Nature 385:810-813.

Yu J, Vodyanik MA, Smuga-Otto K, Antosiewicz-Bourget J, Frane JL, Tian S, Nie J, Jonsdottir GA, Ruotti V, Stewart R, Slukvin II, Thomson JA (2007) Induced pluripotent stem cell lines derived from human somatic cells. Science 318:1917-1920.

(饒毅2012年發(fā)表于《科學(xué)通報(bào)》第32期)

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