有這樣一種“超級(jí)細(xì)菌”,它可能潛藏在醫(yī)院、學(xué)校、軍營(yíng)等人類密集場(chǎng)所,也可能含于肉類、奶制品等食物,對(duì)人類健康構(gòu)成威脅,但常用抗生素卻對(duì)它“無(wú)可奈何”。這種“超級(jí)細(xì)菌”就是——耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)。
MRSA細(xì)菌的形態(tài)示意圖
(圖片來(lái)源:Biology網(wǎng))
世界衛(wèi)生組織數(shù)據(jù)顯示,MRSA每年致使全球超12萬(wàn)人死亡,院內(nèi)感染死亡率達(dá)20%-30%,社區(qū)感染死亡率約5%-10%。因此,MRSA的快速檢測(cè)尤為關(guān)鍵,能夠第一時(shí)間鎖定傳染源,為隔離治療、環(huán)境消殺爭(zhēng)取黃金時(shí)間,有效阻斷傳播鏈,極大降低感染擴(kuò)散風(fēng)險(xiǎn)。
近期,中國(guó)科學(xué)院蘇州生物醫(yī)學(xué)工程技術(shù)研究所的宋一之團(tuán)隊(duì)在MRSA檢測(cè)技術(shù)上取得重要突破,為防控MRSA、守護(hù)公眾健康筑起一道重要防線。
僅靠表面接觸即可傳播“超級(jí)細(xì)菌”
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)是一種對(duì)多種抗生素(尤其是β-內(nèi)酰胺類抗生素,如甲氧西林、青霉素、頭孢菌素等)具有耐藥性的金黃色葡萄球菌。因其具備多重耐藥特性與強(qiáng)致病性,已被世界衛(wèi)生組織(WHO)列為重點(diǎn)關(guān)注的“超級(jí)細(xì)菌”之一。
MRSA主要通過(guò)皮膚接觸、共用物品及接觸污染表面?zhèn)鞑?,易在醫(yī)院引發(fā)院內(nèi)感染,在學(xué)校、軍營(yíng)等密集場(chǎng)所導(dǎo)致社區(qū)感染暴發(fā)。其易感人群包括免疫力低下者(如HIV患者、化療患者)、慢性病患者、接受侵入性治療的住院病人,以及運(yùn)動(dòng)員、軍人等密切接觸群體。
在食品安全方面,MRSA也不容忽視。它可能污染各類食物,如肉類、奶制品等。人們?nèi)羰秤帽籑RSA污染的食品,細(xì)菌在腸道內(nèi)定殖,可能引發(fā)食物中毒癥狀,如嘔吐、腹瀉、發(fā)熱等,對(duì)公眾健康構(gòu)成潛在威脅。
傳統(tǒng)檢測(cè)手段繁瑣而又昂貴
傳統(tǒng)檢測(cè)MRSA方法中,培養(yǎng)法需48-72小時(shí)培養(yǎng)菌落,耗時(shí)長(zhǎng)且易錯(cuò)過(guò)最佳治療期;藥敏試驗(yàn)依賴培養(yǎng)結(jié)果,無(wú)法快速給出耐藥性判斷;分子生物學(xué)方法如PCR等,雖特異性強(qiáng),但設(shè)備昂貴、操作復(fù)雜且需專業(yè)人員;乳膠凝集試驗(yàn)10-15分鐘可出結(jié)果,卻因靈敏度低,對(duì)低載量菌液易漏檢,且易受雜菌干擾出現(xiàn)假陰性。這些方法或耗時(shí)、或成本高、或準(zhǔn)確性不足,難以滿足臨床快速診斷需求。
因此,開(kāi)發(fā)一種更簡(jiǎn)便、特異性強(qiáng)且成本較低的MRSA檢測(cè)方法十分迫切,以實(shí)現(xiàn)通過(guò)早發(fā)現(xiàn)、早診斷,并進(jìn)一步展開(kāi)針對(duì)性的規(guī)范化治療,及時(shí)控制MRSA引發(fā)的細(xì)菌感染。
借助分子診斷技術(shù),可實(shí)現(xiàn)MRSA的直接檢測(cè)!
CRISPR-Cas12a技術(shù)是一種新興的分子診斷技術(shù)。當(dāng)目標(biāo)DNA存在時(shí),Cas12a蛋白會(huì)降解單鏈DNA報(bào)告分子,產(chǎn)生可檢測(cè)的信號(hào)變化。CRISPR-Cas12a技術(shù)憑借其極高的特異性,在分子診斷領(lǐng)域應(yīng)用非常廣泛。
然而,目前基于CRISPR-Cas12a技術(shù)的MRSA等病原菌檢測(cè)方法仍存在一定局限——需要先提取病原菌的基因組DNA,再對(duì)其進(jìn)行檢測(cè)。這種操作流程不僅步驟繁瑣,而且過(guò)程中容易產(chǎn)生氣溶膠污染,進(jìn)而影響檢測(cè)結(jié)果的可靠性。
對(duì)此,我們團(tuán)隊(duì)(中國(guó)科學(xué)院蘇州生物醫(yī)學(xué)工程技術(shù)研究所宋一之團(tuán)隊(duì))創(chuàng)新性地提出一種整合方案:將病原菌的裂解步驟直接整合至RPA-CRISPR一步法反應(yīng)體系內(nèi),實(shí)現(xiàn)在同一反應(yīng)體系內(nèi)同步完成病原菌的裂解和檢測(cè)。
但是,常用的革蘭氏陽(yáng)性菌裂解酶—溶菌酶在RPA-CRISPR一步法反應(yīng)體系內(nèi)裂解活性大大降低。我們利用了一種源自噬菌體的金黃色葡萄球菌特異性的裂解酶—葡萄球菌裂解酶(ClyH),發(fā)現(xiàn)其可以在RPA-CRISPR一步法反應(yīng)體系內(nèi)保持對(duì)MRSA的高裂解活性(參考文獻(xiàn)[1]),從而開(kāi)發(fā)了細(xì)菌裂解、核酸RPA擴(kuò)增和CRISPR-Cas12a特異性檢測(cè)一體化反應(yīng)體系,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)MRSA的直接檢測(cè)。
不同裂解酶在不同緩沖體系內(nèi)對(duì)MRSA的裂解效果
(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)[1])
為了讓檢測(cè)結(jié)果裸眼可見(jiàn),我們提出了新的思路
我們開(kāi)發(fā)的MRSA直接檢測(cè)方法依靠輸出的熒光信號(hào)將結(jié)果可視化,這需要專業(yè)的熒光檢測(cè)儀器,給實(shí)際檢測(cè)帶來(lái)了不便,降低了其在現(xiàn)場(chǎng)監(jiān)測(cè)中的應(yīng)用。而免疫層析試紙條攜帶方便,操作簡(jiǎn)單,檢測(cè)結(jié)果裸眼可視,不需要任何設(shè)備,因此在核酸檢測(cè)中得到了廣泛的應(yīng)用。目前已有一些商業(yè)化的CRISPR試紙條產(chǎn)品,我們首先想到的就是利用這種試紙條對(duì)我們的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行可視化呈現(xiàn)。然而,由于我們是直接檢測(cè)牛奶等復(fù)雜樣品中的MRSA,其中的蛋白質(zhì)等成分嚴(yán)重干擾了商業(yè)化CRISPR試紙條對(duì)檢測(cè)結(jié)果的可視化呈現(xiàn)。
為了克服這一問(wèn)題,我們制備了基于膠體金標(biāo)記親和素(SA-AuNP)的側(cè)向?qū)游鲈嚰垪l。在我們的方法中,先將CRISPR反應(yīng)產(chǎn)物加到上樣區(qū),再加SA-AuNP復(fù)合物,就能避免復(fù)雜樣品對(duì)膠體金的影響。該試紙條對(duì)牛奶等復(fù)雜樣品的耐受性比較好,可以對(duì)MRSA的直接檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行可視化呈現(xiàn)。
不同CRISPR試紙條對(duì)不同樣品的檢測(cè)結(jié)果
(圖片來(lái)源:研究團(tuán)隊(duì)提供)
新的檢測(cè)方法更加便捷高效,正待逐步試點(diǎn)推廣
我們將細(xì)菌裂解、核酸等溫?cái)U(kuò)增、CRISPR/Cas12a檢測(cè)、試紙條信號(hào)輸出相結(jié)合,建立了便捷的檢測(cè)方法—RPA-Cas12a-LFS檢測(cè)系統(tǒng)。該系統(tǒng)具有以下特點(diǎn):
- 免提核酸:創(chuàng)立細(xì)菌裂解、核酸RPA擴(kuò)增和CRISPR特異性檢測(cè)一體化反應(yīng)體系,省去傳統(tǒng)核酸提取步驟,杜絕氣溶膠污染風(fēng)險(xiǎn);
- 裸眼判讀:搭載膠體金側(cè)向流層析試紙條(SA-AuNP LFS),檢測(cè)結(jié)果可通過(guò)試紙條顯色直接判定,無(wú)需專業(yè)設(shè)備;
- 極速高敏:全部反應(yīng)在37℃環(huán)境中進(jìn)行,可在50分鐘內(nèi)檢測(cè)出奶制品、果汁等樣品中低至10 CFU/mL(每毫升樣本所含菌落數(shù)量)的MRSA。靈敏性達(dá)到93.75%,特異性達(dá)到100%。
RPA-Cas12a-LFS方法可檢測(cè)牛奶、羊奶、豆奶、椰奶和桃汁等飲品中的MRSA
(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)[1])
這一研究成果可應(yīng)用于乳制品和飲品等食品的病原菌篩查、臨床樣本的快速診斷以及養(yǎng)老院、學(xué)?;蚣彝サ淖灾鳈z測(cè)。
團(tuán)隊(duì)正在開(kāi)發(fā)配套便攜式試劑盒,計(jì)劃在基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)、乳品企業(yè)生產(chǎn)線及海關(guān)檢疫場(chǎng)景開(kāi)展試點(diǎn)。這一技術(shù)的成功試點(diǎn)與推廣將通過(guò)縮短確診時(shí)間為危重癥患者搶占治療先機(jī),更能以早期精準(zhǔn)篩查阻斷耐藥菌院內(nèi)傳播鏈,對(duì)遏制抗生素濫用、構(gòu)建耐藥菌防控屏障具有不可替代的公共衛(wèi)生戰(zhàn)略意義。
參考文獻(xiàn):
[1]Sun, Y., Zhang, L., Wu, H., Chen, H., Hu, H., Zhang, C., Li, X., Li, Y., Wang, Y., Luo, L., & Song, Y. (2025). Direct visual detection for methicillin-resistant Staphylococcus aureus in milk based on the RPA-Cas12a-LFS method. Food Control, 173, 111209.
出品:科普中國(guó)
作者:宋一之,孫義祥(中國(guó)科學(xué)院蘇州生物醫(yī)學(xué)工程技術(shù)研究所)
監(jiān)制:中國(guó)科普博覽
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