單細(xì)胞測序技術(shù)深刻地改變了科研模式。2024年單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序文章已達(dá)到9154篇,但是其中的數(shù)據(jù)并沒有得到充分的利用。因此,從海量的單細(xì)胞數(shù)據(jù)中挖掘出有用的信息仍然是一個巨大的難題。歸納經(jīng)典文獻(xiàn),我們總結(jié)了單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘的五大策略,①鑒定新的細(xì)胞類群;②找到組間有差異的細(xì)胞類群;③組間特定細(xì)胞類群的差異基因;④從轉(zhuǎn)錄因子入手和⑤有差異的細(xì)胞通訊關(guān)系。
2025年3月,Nature雜志發(fā)表題為Characterization of single neurons reprogrammed by pancreatic cancer的論文。該研究聚焦于胰腺導(dǎo)管腺癌PDAC如何通過外周神經(jīng)系統(tǒng)(PNS)的神經(jīng)元浸潤,調(diào)控腫瘤微環(huán)境,并開發(fā)名為Trace-n-Seq的新技術(shù)。該研究首次在單細(xì)胞分辨率下解析PDAC浸潤神經(jīng)元的分子特征,并揭示神經(jīng)元在PDAC中的關(guān)鍵作用,提出去神經(jīng)支配(denervation)聯(lián)合治療的潛在新策略。
該研究創(chuàng)造性地通過逆向示蹤技術(shù)(Fast Blue標(biāo)記)結(jié)合單細(xì)胞RNA測序,首次實(shí)現(xiàn)了對遠(yuǎn)離腫瘤的神經(jīng)元胞體(如背根神經(jīng)節(jié)DRG、腹腔神經(jīng)節(jié)CG)的分子分析,填補(bǔ)了傳統(tǒng)測序數(shù)據(jù)中神經(jīng)元信息的缺失(Trace-n-Seq技術(shù),像流式分選+單細(xì)胞測序合體)。
該研究發(fā)現(xiàn)PDAC誘導(dǎo)神經(jīng)元轉(zhuǎn)錄組改變(如代謝重編程、軸突導(dǎo)向因子上調(diào)),并定義胰腺癌神經(jīng)特征(PCN signature),包含45個上調(diào)基因(如Robo1、Lin28b)和46個下調(diào)基因(如Gal、Mif)。胰腺癌神經(jīng)特征(PCN signature)本質(zhì)是差異基因!
PDAC優(yōu)先吸引NEFM型感覺神經(jīng)元(高表達(dá)Slit2),而減少肽能神經(jīng)元(PEP)浸潤。通過單細(xì)胞互作分析,發(fā)現(xiàn)癌癥相關(guān)成纖維細(xì)胞(CAFs)是神經(jīng)元的主要互作伙伴,且PDAC中神經(jīng)元-CAFs的信號通路(如Ephrin-Eph、Gas6-Tyro3)顯著增強(qiáng)。
從臨床意義上看,手術(shù)或化療(6-OHDA)去除交感神經(jīng)使腫瘤體積減少3倍,且抑制局部復(fù)發(fā)。去神經(jīng)支配后,CAFs的干擾素響應(yīng)通路激活,CD45+免疫細(xì)胞浸潤增加,激活促炎性CAFs,增強(qiáng)免疫檢查點(diǎn)抑制劑(如nivolumab)療效。
聯(lián)合治療(紫杉醇+6-OHDA)使腫瘤體積減少16.5倍。紫杉醇nab-paclitaxel通過選擇性破壞感覺神經(jīng)元軸突運(yùn)輸抑制腫瘤生長,與去神經(jīng)支配聯(lián)用具有協(xié)同效應(yīng),而奧沙利鉑無此作用。從而揭示了神經(jīng)元在PDAC中的主動調(diào)控角色,超越了傳統(tǒng)“被動浸潤”觀點(diǎn)。
芒果之見:腫瘤不僅劫持血管和免疫系統(tǒng),還重塑神經(jīng)系統(tǒng)以支持其生長。干預(yù)腫瘤神經(jīng)互作可能成為癌癥治療新范式。
特別聲明:以上內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))為自媒體平臺“網(wǎng)易號”用戶上傳并發(fā)布,本平臺僅提供信息存儲服務(wù)。
Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.