日前，中國水產科學研究院黃海水產研究所海水魚蝦流行病學與病害防控創新團隊與上海交通大學等單位合作在RNA病毒進化領域取得重要發現，在病原學領域國際著名期刊《PLoS Pathogens》在線發表了題為"A positive-sense single-stranded RNA virus acquired a negative-sense open reading frame through recombination"的研究論文。

正義單鏈RNA病毒（+ssRNA病毒）與負義單鏈RNA病毒（-ssRNA病毒）是自然界中兩類主要的單鏈RNA病毒，它們在基因組結構、轉錄和復制策略上存在顯著差異，因此長期以來被認為在進化上是相互獨立的。本研究從生存在高鹽生態系統的古老甲殼動物鹵蟲中鑒定出一種新的正義單鏈RNA病毒（brine shrimp virga-like virus 1, BSVV1），其基因組分析顯示該病毒包含三個開放閱讀框（ORFs），其中ORF1來源于+ssRNA病毒，而ORF2與-ssRNA病毒同源（圖1和圖2）。該團隊利用質譜分析技術成功鑒定出了BSVV1的三個ORFs蛋白產物，證實了BSVV1的基因組結構（圖3）。科研人員進一步開發了基于TaqMan探針的實時熒光定量（RT-PCR）檢測方法，證實了該病毒在鹵蟲體內的復制能力。

圖1.BSVV1的基因組結構圖

圖2.BSVV1和相關病毒的基因組結構示意圖

圖3.BSVV1的ORF1、ORF2和ORF3蛋白產物的質譜分析結果

本研究提供了首個正負義單鏈RNA病毒間重組事件的直接證據，為理解RNA病毒基因組多樣性和進化的復雜過程提供了新的見解。

黃海所董宣研究員和碩士研究生張帆為文章的共同第一作者，黃海所黃倢研究員和上海交通大學上海市病毒研究院史衛峰教授為文章的共同通訊作者。該研究得到了悉尼大學Edward C. Holmes教授、比利時根特大學Sorgeloos Patrick教授和Hans Nauwynck教授、天津科技大學亞洲區域鹵蟲參考中心隋麗英教授、中國科學院上海藥物研究所高婧高工和周虎教授、山東第一醫科大學李辭修教授等專家的支持。該研究得到國家重點研發計劃青年科學家項目（2023YFD2402200）、青島市自然科學基金（23-2-1-181-zyyd-jch）、泰山學者計劃、山東省重點研發計劃（2024CXPT071-3）、中國水產科學研究院基本科研業務費（2023TD42）、國家蝦蟹產業技術體系（CARS-48）等項目的資助。

原文鏈 接 ： https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013015

文章來源：黃海水產研究所

本期編輯：可愛晨