朱棣稱帝后，小舅子徐輝祖拒絕臣服，將自己關在祠堂，跪在父親徐達牌位前哭泣。朱棣大怒，對皇后徐氏說：“我是真想殺了你弟弟。”話雖如此，可朱棣還是手下留情了。
“皇上，我提議誅殺朱高煦，以絕后患，斷絕燕王反叛的心思。”
徐輝祖毫不猶豫的舉報了自己親外甥，哪怕朱高煦是自己親妹妹生的，他也要大義滅親，為人臣子，為人下屬，他要為建文帝考慮。
朱高煦背后驚出冷汗，他們怎么也沒想到，親舅舅說要殺他，好在建文帝依舊念及兄弟情誼，并未對朱高煦痛下殺手，燕王三子倉皇逃竄。
建文帝削藩，削的不只是明朝的藩王，也是在掘自己的根，順帶著跟建文帝站在一起的勛貴文臣武將對自己的手足同胞均毫不留情，沒有人看好燕王，更沒人覺得有人能動搖建文帝的根基。
徐輝祖并不覺得自己殺外甥有什么錯，唯一的錯誤就怪朱棣太過能打，倘若不能對朱棣下手，那就對朱棣的身邊人下手，一點點減除朱棣的幫手，倘若成功了 ，或者建文帝成功削藩了還好，可要是燕王靖難成功，徐輝祖此舉就是將會給自己引來殺身之禍。
在忍無可忍之下，朱棣迫不得已攻破了應天門，朱元璋把勛貴都留給了皇孫，給朱棣留下的太少，這也導致朱棣身邊沒有什么出彩的人物，每次打仗事必躬行，好在身邊有朱高煦幫襯著，不至于三軍之帥既當帥又當將又當兵。
當朱棣稱帝時，徐輝祖孤單一人呆在家中，隨后被抓了起來，朱棣父子幾人滿身都是鮮血，齊怔怔的看著徐輝祖，朱棣的大舅哥，朱高煦的舅舅，都說朱允炆狠辣，可徐輝祖比建文帝也好不到那里去。
人人都知道漢王雖然作戰勇猛，但漢王也是牙眥必報之人，誰敢對他動手，他就敢對別人動刀子，可面對徐輝祖，沒人敢下手，哪怕是朱高煦也不敢，這是他母親的哥哥，他得考慮母親的情緒。
朱棣還是心軟了，現階段最重要平穩時局，朱棣此時對侄子的老臣是懷柔的心態，只要簽訂認罪書，就能免于處罰，像徐輝祖這樣的二代將軍，他家的親戚，更是不需要受到多少懲罰。
但徐輝祖態度強硬，他并不認為自己有問題，放在朱允炆那看來，卻是如此，他又不是跟朱棣坐一桌吃飯的，身為朱元璋為皇孫安排的顧命大臣，不為皇帝考慮難道要為朱棣考慮嗎？
朱棣也為他的這番執拗感到無奈，他跟徐輝祖共事過一段時間，，比上不足比下有余，唯一的特點就是忠誠還有固執，穩重不奪權。
朱棣只將徐輝祖禁足，好聲好氣的照片帶，不甘于絲毫的不禮貌，然而即便是這樣的行為，也差點讓朱棣跟徐皇后之間的關系鬧掰，夾雜在中間的朱棣毫無辦法。
朱棣雖不想殺他，但但爵位還是給他削去了，給讓大家看到朱棣的態度，只要是認罪，就能從輕處罰，他暫時不會動刀。
對朱棣的這番好意，徐輝祖并不接受，一方面他有當皇后的妹妹，另一方面他有朱元璋賜下的免死令，怎么樣朱棣也不應該對他動手，朱棣確實不會對徐輝祖動手，但絕不會是因為免死金牌，所有人都清楚免死金牌只有在用不到的時候才有用，倘若真的有用，李善長就不會死了。
徐輝祖的脾氣執拗，但他的壽命卻沒有他想象的那般堅挺，就在朱棣登基沒多長時間，徐輝祖就因為重病匆匆離去，讓所有人都未反應過來，對這個結果，漢王相比會很看新，因為就因為徐輝祖這個舅舅要殺他，導致另一個舅舅被建文帝波及。
但徐皇后顯然接受不了這個事實，兩兄妹接連去世，年歲不過40 ，放在那個年代，算是早逝了。
信息來源：徐輝祖——百度百科