本文轉載自微信公眾號:江農研之聲,作者江小儂
免疫熒光技術又稱熒光抗體技術,該技術主要通過抗原-抗體反應以檢測或定位各種抗原,可實現特異標志物的可視化。目前,隨著各類期刊要求的不斷提高,在免疫熒光實驗中,許多期刊都要求提供免疫熒光圖片的熒光強度定量圖。但在小伙伴們的日常數據處理中,常常只能一張一張地處理圖片,這對數據的處理效率大打折扣,接下面將詳細介紹免疫熒光圖片的批量處理方法,需要的小伙伴們快打開電腦一起學起來吧!
所需軟件:ImageJ
軟件下載網址:https://imagej.net/software/imagej
前期準備:將所有需要分析的免疫熒光圖片放到一個文件夾中,文件夾命名input;再另建一個空的文件夾,命名output。具體步驟如下:
打開ImageJ軟件——點擊File→Open——導入一張免疫熒光圖片
Step.2
點擊軟件工具欄中的Plugins→Macros→Record
此時會彈出Recorder頁面,此頁面是用于記錄后續圖片處理整個流程的代碼區,記得處理過程中不要關閉該頁面,這是后續實現批量處理的關鍵!!!
Step.3
點擊Image→Type→8-bit(圖片變成黑白色)→點擊Image→Adjust→Threshold
此時彈出Threshold頁面,且可以發現圖片中熒光部分被特異識別了出來,在該頁面中,可以手動調節閾值以改變其識別熒光區域;但為減小因人為調整閾值而引起的誤差,通常會點擊左下角的Auto,讓軟件自動識別熒光區域。
Step.4
點擊Analyze→Set Measurements
此時彈出Set Measurements頁面,大家可自行選擇需要測定的項目。通常,作者會選擇Area、Mean gray value、Integrated density、Display label和Limit to threshold,然后點擊ok即可。
Step.5
點擊Analyze→Measure
此時彈出Results頁面,可以發現,剛才在Set Measurements頁面所選中的測定項目都已得出相應的結果。此時,一張免疫圖片的分析工作就到此結束。
Step.6
復制recorder頁面代碼→點擊Process→Batch→Macro
此時會彈出Batch Process頁面,點擊input,選中input文件夾,點擊output,選中output文件夾;output format中可自行選擇輸出的文件格式,然后將Recorder頁面中的代碼復制到Batch Process頁面下方的空白區域中,點擊process即可。然后,會彈出Results頁面,input文件夾中所有熒光圖片均已得到相應結果。
Step.7
點擊Results頁面右上角File→Save as
可對測定結果進行保存,其中Mean即為所需的平均熒光強度。
轉自:江農研之聲,僅作學術分享使用;侵刪
2023年4月1日 | 第2035期
稿件來源 | 食品院研究生分會
作 者 | 張文凱
編 輯 | 翟鈺艷 蔣詩音 張嘯宇
責任編輯 | 丁晶
審 核 | 譚會樂 席步鑫
終 審 | 黃小珊
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