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Journal of Virology|Nucleolin-RNA相互作用調(diào)節(jié)輪狀病毒復(fù)制

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“Nucleolin–RNA interaction modulates rotavirus replication”于2024年2月發(fā)表在《Journal of Virology》期刊,該研究顯示輪狀病毒的復(fù)制受到核仁素的負(fù)調(diào)控,其調(diào)控方式是通過(guò)核仁素與病毒 RNA 上 G4 結(jié)構(gòu)的序列直接相互作用來(lái)實(shí)現(xiàn)的。


病毒依賴細(xì)胞蛋白來(lái)完成其復(fù)制周期。就輪狀病毒而言,在其復(fù)制周期中細(xì)胞 RNA 結(jié)合蛋白所起的作用,是一個(gè)尚未得到充分研究的領(lǐng)域。在這項(xiàng)研究中,作者首次證實(shí)了核仁素與恒河猴輪狀病毒(RRV)的病毒 RNA 之間存在相互作用。核仁素是一種細(xì)胞蛋白,它在核糖體 rRNA 的代謝和核糖體生物發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮作用,而它似乎對(duì)恒河猴輪狀病毒(RRV)的病毒顆粒數(shù)量和病毒 RNA 拷貝數(shù)具有調(diào)控作用。作者的研究為當(dāng)前的輪狀病毒復(fù)制模型增添了一個(gè)新的要素,即細(xì)胞蛋白可以對(duì)輪狀病毒的復(fù)制起到負(fù)調(diào)控作用。輪狀病毒引發(fā)的腸胃炎給全球健康帶來(lái)了沉重負(fù)擔(dān),尤其是對(duì) 5 歲以下的兒童影響很大。輪狀病毒是呼腸孤病毒科(Sedoreoviridae)的成員,屬于無(wú)包膜病毒,其特征是擁有一個(gè)三層的蛋白質(zhì)衣殼。它們的基因組由 11 個(gè)雙鏈 RNA(dsRNA)片段組成,這些片段編碼六種病毒結(jié)構(gòu)蛋白(VP1、VP2、VP3、VP4、VP6 和 VP7)以及六種非結(jié)構(gòu)蛋白(NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5 和 NSP6)。在感染過(guò)程中,輪狀病毒采用復(fù)雜的策略,通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞環(huán)境并劫持宿主蛋白來(lái)翻譯病毒蛋白和復(fù)制其基因組。

核仁素(Ncl)是一種真核生物的磷蛋白,主要存在于細(xì)胞核中,其中心區(qū)域具有一個(gè) RNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域包含四個(gè) RNA 識(shí)別基序,能夠與 RNA 分子相互作用。這種蛋白在核糖體組裝、rDNA 轉(zhuǎn)錄以及前體 rRNA 的修飾和加工過(guò)程中發(fā)揮著多種作用。據(jù)報(bào)道,核仁素參與了幾種 RNA 病毒與細(xì)胞的結(jié)合和進(jìn)入過(guò)程,從而影響了這些病毒的初始感染過(guò)程此外,它還與杯狀病毒的病毒復(fù)制和翻譯以及登革熱病毒顆粒的組裝有關(guān)。

為了進(jìn)一步明確具有 RNA 結(jié)合能力的細(xì)胞蛋白在輪狀病毒復(fù)制過(guò)程中所起的作用,作者評(píng)估了核仁素(一種已知能與多種 RNA 病毒相互作用的 RNA 結(jié)合蛋白)在輪狀病毒復(fù)制周期中的作用。為此,作者評(píng)估了通過(guò) RNA 干擾(RNAi)技術(shù)沉默核仁素表達(dá),對(duì)單個(gè)復(fù)制周期內(nèi)有感染性的輪狀病毒子代產(chǎn)量的影響。在這些實(shí)驗(yàn)中,將接種在 48 孔板中的 MA104 細(xì)胞用一組特異性靶向核仁素的 siRNA 進(jìn)行轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染 72 小時(shí)后,用四種不同的輪狀病毒毒株感染這些細(xì)胞,分別是恒河猴輪狀病毒(RRV)、猿猴輪狀病毒 SA11(SA11)、牛輪狀病毒(UK)和 人輪狀病毒毒株(Wa),感染復(fù)數(shù)(MOI)為 3。在感染后 15 小時(shí)(hpi),收獲被感染的細(xì)胞,并通過(guò)噬斑形成試驗(yàn)測(cè)定在這些條件下產(chǎn)生的病毒的病毒滴度(圖1A)。

作者發(fā)現(xiàn),與轉(zhuǎn)染了非靶向?qū)φ眨∟T)siRNA 的細(xì)胞相比,從核仁素被沉默的細(xì)胞中獲得的四種輪狀病毒毒株的病毒滴度均有所增加。每種毒株的增加倍數(shù)分別為:恒河猴輪狀病毒(RRV)6.3 倍,猿猴輪狀病毒 SA11(SA11)4.8 倍,牛輪狀病毒(UK)3.3 倍,Wa 輪狀病毒毒株(Wa)2.4 倍(圖1A)。這一觀察結(jié)果表明,核仁素對(duì)這四種不同毒株的輪狀病毒感染均起到負(fù)調(diào)控作用。通過(guò)用抗核仁素抗體進(jìn)行蛋白質(zhì)免疫印跡,并使用抗波形蛋白抗體(波形蛋白)對(duì)上樣對(duì)照進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化后,通過(guò)光密度測(cè)定法評(píng)估得出,核仁素的敲低效率為 91%(圖1B)。在所研究的條件下,通過(guò)乳酸脫氫酶(LDH)釋放試驗(yàn)測(cè)定,用靶向核仁素的 siRNA 處理的細(xì)胞中未檢測(cè)到明顯的細(xì)胞活力變化(圖1C)。


圖1 核仁素表達(dá)的敲低促使RRV、SA11、UK 和 Wa 株輪狀病毒的滴度增加。(A)在 48 孔板中培養(yǎng)的 MA104 細(xì)胞,用非靶向(NT)siRNA 或核仁素 siRNA 進(jìn)行轉(zhuǎn)染。在轉(zhuǎn)染后 72 小時(shí)(hpt),細(xì)胞以感染復(fù)數(shù)(MOI)為 3 的 RRV、SA11、UK 和 Wa 型輪狀病毒進(jìn)行感染,并在感染后 15 小時(shí)收獲細(xì)胞。所示數(shù)據(jù)為三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的算術(shù)平均值 ± 標(biāo)準(zhǔn)差。(B)用指定的 siRNA 轉(zhuǎn)染的細(xì)胞在轉(zhuǎn)染后 72 小時(shí)收獲,通過(guò)免疫印跡分析檢測(cè)蛋白質(zhì),使用針對(duì)核仁素(Ncl)的抗體,并以波形蛋白(Vim)抗體作為上樣對(duì)照。使用 ImageJ 軟件對(duì)蛋白質(zhì)免疫印跡中 Ncl 和 Vim 條帶進(jìn)行光密度分析。(C)按照制造商的說(shuō)明,使用乳酸脫氫酶(LDH)釋放測(cè)定法評(píng)估細(xì)胞活力。顯示的是三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的算術(shù)平均值 ± 標(biāo)準(zhǔn)差。

為了確定病毒復(fù)制周期中受核仁素敲低影響的階段,作者評(píng)估了病毒復(fù)制的初始階段。為此,用核仁素或非靶向(NT)小干擾RNA(siRNA)預(yù)先處理過(guò)的MA104細(xì)胞,以0.02的感染復(fù)數(shù)(MOI)感染恒河猴輪狀病毒(RRV)。將細(xì)胞固定,然后使用輪狀病毒顆粒的兔多克隆抗體(抗全病毒顆粒抗體,anti-TLPs),通過(guò)空斑形成試驗(yàn)對(duì)感染細(xì)胞的數(shù)量進(jìn)行定量。在核仁素沉默的細(xì)胞和NT對(duì)照細(xì)胞中測(cè)得的病毒滴度在兩組之間沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著差異(圖2A),這表明核仁素的減少不會(huì)影響病毒進(jìn)入細(xì)胞。 為了評(píng)估核仁素對(duì)形成中間衣殼和外衣殼的病毒結(jié)構(gòu)蛋白合成的影響,作者通過(guò)對(duì)敲低核仁素的細(xì)胞裂解液中三種病毒結(jié)構(gòu)蛋白(VP4、VP6和VP7)的豐度進(jìn)行光密度測(cè)定分析,來(lái)分析病毒蛋白的含量。將MA104細(xì)胞轉(zhuǎn)染核仁素siRNA,然后在轉(zhuǎn)染后72小時(shí)以感染復(fù)數(shù)為3的輪狀病毒RRV進(jìn)行感染。在感染后15小時(shí)收獲細(xì)胞,用抗TLP多克隆抗體通過(guò)十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)免疫印跡法分析感染細(xì)胞的裂解液。在對(duì)照NT siRNA處理的細(xì)胞和核仁素沉默的細(xì)胞之間沒(méi)有觀察到統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著差異(圖2B和C)。這些結(jié)果證實(shí),在核仁素表達(dá)降低的情況下,輪狀病毒結(jié)構(gòu)蛋白的表達(dá)量不受影響。


圖2 核仁素低表達(dá)對(duì)輪狀病毒感染性或病毒蛋白合成沒(méi)有影響。(A)如前所述,在96孔板中培養(yǎng)的MA104細(xì)胞用非靶向(NT)或核仁素(Ncl)siRNA進(jìn)行轉(zhuǎn)染。隨后,細(xì)胞以感染復(fù)數(shù)(MOI)為0.02的恒河猴輪狀病毒(RRV)進(jìn)行感染,并按照“材料與方法”部分所述,在感染后15小時(shí)通過(guò)病灶形成試驗(yàn)測(cè)定病毒滴度。將轉(zhuǎn)染了非靶向siRNA的感染細(xì)胞數(shù)量視為100%的感染性。(B)MA104細(xì)胞用非靶向或核仁素siRNA進(jìn)行轉(zhuǎn)染,然后以感染復(fù)數(shù)(MOI)為3的RRV進(jìn)行感染。在感染后15小時(shí),收獲細(xì)胞,并通過(guò)免疫印跡分析檢測(cè)蛋白質(zhì)。該分析使用了一種能識(shí)別輪狀病毒結(jié)構(gòu)蛋白(TLPs)的多克隆抗體、一種用于驗(yàn)證干擾效果的抗核仁素(Ncl)抗體,以及一種波形蛋白(Vim)抗體作為上樣對(duì)照。(C)使用ImageJ軟件對(duì)從(B)中所示的蛋白質(zhì)免疫印跡獲得的三種輪狀病毒結(jié)構(gòu)蛋白(VP4、VP6和VP7)和波形蛋白(Vim)進(jìn)行光密度分析。給出的是三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的算術(shù)平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。

在輪狀病毒感染期間,負(fù)義RNA的合成是衡量基因組復(fù)制的一個(gè)指標(biāo),因?yàn)檫@是合成感染性子代病毒中的基因組雙鏈RNA的一個(gè)必要步驟。為了量化先前用核仁素siRNA處理過(guò)的、被恒河猴輪狀病毒(RRV)感染的細(xì)胞中基因組RNA的合成情況,通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-qPCR)擴(kuò)增輪狀病毒S10基因負(fù)鏈的特定豐度作為一個(gè)指標(biāo)。為此,以感染復(fù)數(shù)(MOI)為3的RRV對(duì)核仁素被敲低的MA104細(xì)胞進(jìn)行感染,并從在感染后0小時(shí)、4小時(shí)、8小時(shí)和12小時(shí)收集的樣本中提取總RNA。數(shù)據(jù)以倍數(shù)增加的形式表示,并且如先前報(bào)道所述,將用非靶向(NT)siRNA轉(zhuǎn)染的細(xì)胞在感染后12小時(shí)產(chǎn)生的RNA量作為倍數(shù)變化的一個(gè)單位。 為了定量S10基因負(fù)鏈和正鏈的數(shù)量,作者使用了一條用于定量PCR分析的標(biāo)準(zhǔn)曲線,該標(biāo)準(zhǔn)曲線基于一個(gè)含有RRV S10基因片段互補(bǔ)DNA(cDNA)的質(zhì)粒構(gòu)建體(見(jiàn)材料與方法)。在核仁素表達(dá)被沉默的條件下,病毒負(fù)鏈的合成從感染后4小時(shí)開(kāi)始增加,一直持續(xù)到感染后12小時(shí),與用非靶向siRNA處理的對(duì)照細(xì)胞中觀察到的RNA合成相比,顯著增加了5.8倍(圖3A)。 作者還測(cè)定了S10基因正鏈的豐度,它代表了雙鏈RNA基因組合成以及從轉(zhuǎn)錄過(guò)程中合成的信使RNA(mRNA)的總和。與作者在S10基因負(fù)鏈中觀察到的情況類似,與對(duì)照沉默細(xì)胞相比,在感染后8小時(shí)觀察到S10 RNA正鏈豐度增加,在感染后12小時(shí)顯著增強(qiáng)了3.5倍(圖3B)。這些發(fā)現(xiàn)支持了這樣一種觀點(diǎn),即在核仁素表達(dá)被沉默的條件下,病毒RNA合成增加,這促成了所觀察到的子代病毒產(chǎn)生量的增加。


圖3 在核仁素沉默的細(xì)胞中,病毒RNA負(fù)鏈和正鏈的合成得到增強(qiáng)(A)S10基因負(fù)鏈水平和(B)S10基因正鏈水平。給出的是三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的算術(shù)平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。

為了證明核仁素與輪狀病毒RNA之間存在潛在的相互作用,作者進(jìn)行了免疫沉淀(IP)實(shí)驗(yàn)。在該實(shí)驗(yàn)中,使用了一種針對(duì)核仁素的單克隆抗體對(duì)受感染或模擬感染(未感染病毒)的細(xì)胞裂解物進(jìn)行免疫沉淀。通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)擴(kuò)增輪狀病毒的1、4和10號(hào)RNA片段,來(lái)檢測(cè)免疫沉淀復(fù)合物中輪狀病毒RNA的存在情況。作為陽(yáng)性對(duì)照,使用了針對(duì)病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NSP3的抗體進(jìn)行免疫沉淀,因?yàn)橐阎@種蛋白能特異性地結(jié)合所有輪狀病毒RNA片段。此外,作為陰性對(duì)照,使用了針對(duì)蛋白磷酸酶1(PP1)的抗體,此前已證明該抗體不與輪狀病毒RNA相互作用。 通過(guò)使用針對(duì)核仁素、NSP3和PP1的特異性抗體對(duì)沉淀物進(jìn)行蛋白質(zhì)免疫印跡(western blot)分析,驗(yàn)證了免疫沉淀實(shí)驗(yàn)的有效性(圖4A)。當(dāng)使用核仁素單克隆抗體對(duì)細(xì)胞裂解物中可能存在的蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物進(jìn)行免疫沉淀時(shí),從受感染細(xì)胞中獲得了一條751堿基對(duì)的RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,該產(chǎn)物對(duì)應(yīng)于輪狀病毒的S10片段(圖4C)。當(dāng)使用針對(duì)NSP3的多克隆抗體進(jìn)行免疫沉淀時(shí),也檢測(cè)到了這條擴(kuò)增產(chǎn)物。重要的是,使用PP1抗體時(shí)未觀察到擴(kuò)增條帶。為了證實(shí)病毒感染期間輪狀病毒的其他片段也能與核仁素結(jié)合,進(jìn)行了額外的免疫沉淀實(shí)驗(yàn)。且使用了多對(duì)引物來(lái)擴(kuò)增恒河猴輪狀病毒(RRV)的三個(gè)不同片段,即1號(hào)片段(S1)、4號(hào)片段(S4)和10號(hào)片段(S10)。使用特異性抗體對(duì)沉淀物中核仁素、NSP3和PP1的存在情況進(jìn)行了驗(yàn)證(圖4B)。通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-qPCR),作者證實(shí)了對(duì)應(yīng)于S1、S4和S10的三個(gè)不同輪狀病毒片段的存在(圖4D)。綜上所述,這些結(jié)果為核仁素與恒河猴輪狀病毒(RRV)mRNA的三個(gè)不同片段之間存在特異性相互作用提供了證據(jù)。


圖4 核仁素在輪狀病毒感染的細(xì)胞中與病毒RNA結(jié)合(A)添加或不添加抗體進(jìn)行免疫沉淀(IP)所檢測(cè)到的蛋白質(zhì)的可視化結(jié)果。(B)input中的蛋白質(zhì)以及用于RNA檢測(cè)的免疫沉淀樣品中所檢測(cè)到的蛋白質(zhì)的可視化結(jié)果。(C)用TRIzol提取每個(gè)免疫沉淀樣品中存在的RNA,并通過(guò)end-point RT-PCR擴(kuò)增恒河猴輪狀病毒(RRV)的第10片段。擴(kuò)增產(chǎn)物在1%的瓊脂糖凝膠中進(jìn)行分離。以輪狀病毒的RNA作為模板作為反應(yīng)的陽(yáng)性對(duì)照(+C),以水作為反應(yīng)的陰性對(duì)照(-C)。(D)使用逆轉(zhuǎn)錄定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-qPCR)鑒定與S1、S4和S10對(duì)應(yīng)的RNA,并描繪出相對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)曲線的RNA拷貝數(shù)。所展示的數(shù)據(jù)為三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的算術(shù)平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。

為了確定核仁素與輪狀病毒S10 RNA的結(jié)合是否是因?yàn)榕c已鑒定的G-四鏈體(G4)結(jié)構(gòu)域的相互作用所介導(dǎo)的,將MA104細(xì)胞轉(zhuǎn)染了陽(yáng)性對(duì)照物AGRO100,這是一種已知能形成G-四鏈體結(jié)構(gòu)并特異性結(jié)合核仁素RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域的寡核苷酸。作為陰性對(duì)照,將細(xì)胞轉(zhuǎn)染了CRO26,這是一種與AGRO100序列相同的寡核苷酸,其中的鳥(niǎo)嘌呤被胞嘧啶所取代。如“材料與方法”部分詳細(xì)所述,在轉(zhuǎn)染前對(duì)這些序列進(jìn)行了體外折疊處理。在這些實(shí)驗(yàn)中,先前已轉(zhuǎn)染了上述任一寡核苷酸的MA104細(xì)胞以感染復(fù)數(shù)(MOI)為3的恒河猴輪狀病毒(RRV)進(jìn)行感染。在感染后15小時(shí),收集被感染的細(xì)胞,并按照先前描述的方法測(cè)定子代病毒的產(chǎn)生情況。作者發(fā)現(xiàn),與轉(zhuǎn)染了CRO26的對(duì)照細(xì)胞相比,轉(zhuǎn)染了AGRO100的細(xì)胞中病毒產(chǎn)量增加了1.5倍(圖5A)。這一發(fā)現(xiàn)表明,核仁素的RNA結(jié)合基序參與了對(duì)輪狀病毒感染性顆粒產(chǎn)生的調(diào)控。為了確定在輪狀病毒基因組中預(yù)測(cè)的G-四鏈體結(jié)構(gòu)是否能模擬AGRO100的作用,作者合成了在RNA S10中鑒定出的三個(gè)G4序列(G4-1、G4-2和G4-3)。對(duì)這些序列進(jìn)行體外折疊處理后,將它們分別轉(zhuǎn)染到MA104細(xì)胞中,以評(píng)估它們對(duì)病毒產(chǎn)量的影響。值得注意的是,與對(duì)照寡核苷酸(CRO26)相比,用寡核苷酸G4-1和G4-3處理的RRV感染細(xì)胞顯示出病毒產(chǎn)量顯著增加,分別增加了1.6倍和2.1倍。相比之下,與對(duì)照組相比,寡核苷酸G4-2對(duì)病毒產(chǎn)量沒(méi)有顯著影響(圖5B)。作為額外的對(duì)照,在體外折疊處理前轉(zhuǎn)染了寡核苷酸G4-3(未折疊的G4-3,UnG4-3)。該實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,與陰性對(duì)照CRO26相比,病毒滴度沒(méi)有變化,這表明G4結(jié)構(gòu)的折疊對(duì)于影響病毒的復(fù)制是必要的(圖5C)。最后,為了排除所觀察到的感染性病毒產(chǎn)量增加可能是由于RRV的G-四鏈體區(qū)域與其他細(xì)胞蛋白的非特異性相互作用所導(dǎo)致的這種可能性,并確定病毒產(chǎn)量增加與RRV的G4序列和核仁素的結(jié)合之間的直接關(guān)聯(lián),通過(guò)RNA干擾(RNAi)使MA104細(xì)胞中核仁素蛋白的表達(dá)沉默。在轉(zhuǎn)染后24小時(shí),隨后將細(xì)胞用折疊后的G4-3寡核苷酸轉(zhuǎn)染48小時(shí)。在這段時(shí)間之后,用RRV感染細(xì)胞,并在37攝氏度下培養(yǎng),于感染后15小時(shí) 。對(duì)感染性子代病毒的定量分析顯示,在核仁素沉默的細(xì)胞中測(cè)得的病毒滴度與另外轉(zhuǎn)染了RRV G4-3的細(xì)胞相比,沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著差異(圖5D)。 這些結(jié)果表明,G-四鏈體結(jié)構(gòu)通過(guò)阻斷核仁素的RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,有利于輪狀病毒RNA的復(fù)制。此外,這些結(jié)果還表明,在RRV的S10中發(fā)現(xiàn)的特定G-四鏈體序列(G4-1和G4-3)可能是核仁素的結(jié)合位點(diǎn),而這種相互作用可能是細(xì)胞的抗病毒反應(yīng)之一。


圖5 具有預(yù)測(cè) G4 結(jié)構(gòu)的寡核苷酸對(duì)輪狀病毒子代產(chǎn)生的影響。(A)CRO26 和 AGRO100。(B)存在于 RRV S10 中的三個(gè)不同的假定 G4 區(qū)域的序列:G4-1(116–132 核苷酸(nt))、G4-2(572–607 核苷酸)和 G4-3(717–737 核苷酸)。(C)CRO26、未折疊的 G4-3 序列(UnG4-3)和折疊后的 G4-3。(D)在 48 孔板中培養(yǎng)的 MA104 細(xì)胞用核仁素 siRNA 使其基因沉默。在沉默 24 小時(shí)后,用輪狀病毒 G4-3 寡核苷酸(Ncl+G4-3)轉(zhuǎn)染細(xì)胞。在轉(zhuǎn)染 48 小時(shí)后,細(xì)胞以感染復(fù)數(shù)(MOI)為 3 的 RRV 進(jìn)行感染。在感染后 15 小時(shí),裂解細(xì)胞,并通過(guò)病灶形成試驗(yàn)測(cè)定細(xì)胞裂解物中的病毒滴度。所展示的數(shù)據(jù)為三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的算術(shù)平均值 ± 標(biāo)準(zhǔn)差。

這項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào)了核仁素在輪狀病毒感染過(guò)程中的重要性,它通過(guò)負(fù)向調(diào)節(jié)病毒RNA的合成以及感染性病毒的產(chǎn)生來(lái)發(fā)揮作用。當(dāng)在 MA104 細(xì)胞中敲低核仁素的表達(dá)時(shí),病毒 RNA(vRNA)的拷貝數(shù)和病毒子代的數(shù)量都會(huì)增加。免疫沉淀實(shí)驗(yàn)表明,核仁素有可能通過(guò)與輪狀病毒 RNA 上的 G -四鏈體 RNA 結(jié)構(gòu)結(jié)合來(lái)與之相互作用。此外,作者使用了預(yù)測(cè)能夠形成 G -四鏈體結(jié)構(gòu)、并且模擬輪狀病毒基因片段 10 中序列的合成序列,證實(shí)了這些區(qū)域會(huì)阻礙核仁素的結(jié)合,從而導(dǎo)致有感染性的病毒顆粒的產(chǎn)生增加。這篇研究對(duì)探索具有RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)在RNA病毒感染中具有重要意義。

原文鏈接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/jvi.01677-23?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub++0pubmed

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