模式生物基因文庫如何加速科研進程？

• 基因功能篩選：依托全基因組或基因家族文庫，批量鑒定關鍵基因和關鍵通路。

• 功能互補：通過cDNA產品拯救突變表型，驗證基因功能。

• 前沿應用領域：非哺乳類模式生物文庫近些年廣泛應用于衰老、細胞穩態、腸道菌群研究、感染與免疫、合成生物學等前沿領域。

Dharmacon的基因文庫已助力多項CNS論文發表！

直播預告：解鎖模式生物的無限可能！

直播主題：非哺乳類基因文庫助力模式生物前沿科學發現

直播時間：5月28日19:00—20:00

直播大綱：

• 經典模式生物線蟲、酵母、大腸桿菌中基因文庫篩選的實戰應用

• Dharmacon經典模式生物文庫詳情

講師介紹：

李想博士，瑞孚迪Revvity Dharmacon 產品線產品經理，博士畢業于北京生命科學研究所（NIBS），擁有十年以上基因文庫篩選、藥物研發、表觀遺傳學研究經驗。在瑞孚迪先后負責高內涵成像、多功能酶標和基因文庫產品線技術工作。

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模式生物明星產品及其科研“高光領域”

一、秀麗線蟲RNAi 文庫（C. elegans RNAi Collection）

來源于Marc Vidal實驗室，也被稱為Vidal RNAi Collection，是專為elegans的RNAi篩選而開發，該文庫以elegansORFeome文庫v1.1為基礎，將ORF克隆載體轉化至pL4440-Dest-RNAi喂養載體上，然后轉入大腸桿菌飼養菌株HT115（D3）。直接給線蟲喂食飼養株即可完成RNAi，該克隆純化的質粒也可直接作為體外合成雙鏈RNA的模板，通過浸泡或注射的方式對線蟲進行RNAi。具體信息參考：https://wormbase.org/-34-5。

【產品特點】

• 該文庫提供11511個RNAi克隆，每個克隆靶向一個單獨的基因；

• 直接給線蟲喂食飼養株即可完成RNAi，該克隆純化的質粒也可直接作為體外合成雙鏈RNA的模板，通過浸泡或注射的方式對線蟲進行RNAi；

• 產品形式：大腸桿菌HT115（D3）甘油菌。

【經典案例】

Dev Cell. 2023 Dec 4;58（23）:2718-2731.e7. doi: 10.1016/j.devcel.2023.08.019. Epub 2023 Sep 13.

Mitochondrial GTP metabolism controls reproductive aging in C. elegans

DharmaconTM的C.elegans siRNA文庫用于線粒體GTP衰老調控機制篩選，發現線粒體 GTP（mtGTP）代謝通過線粒體動力學因子調控生殖衰老。

二、酵母基因敲除株及文庫（YKO，Yeast Knockout collection）

經典的酵母基因敲除collection，由酵母基因組缺失項目（Saccharomyces Genome Deletion Project）開發，覆蓋酵母基因組96%的基因敲除酵母株。

【產品特點】

• 在四種背景菌株（MATa和MATalpha的單倍體、雜合子二倍體和純合子二倍體）中敲除了6000多個基因，從而產生了20000多個不同的基因敲除菌株；

• 通過分子條形碼可對基因功能進行平行分析；

• 突變酵母菌株也可通過測序或使用全基因組方法進行單獨分析；

• 產品形式：酵母株甘油儲存液。

【經典案例】

Nat Commun. 2023 Nov 27;14（1）:7719. doi: 10.1038/s41467-023-43233-y.

Sis2 regulates yeast replicative lifespan in a dose-dependent manner

DharmaconTM的Yeast KO文庫用于微流控衰老篩選，開發了一個基于微流控的酵母壽命測量技術，并篩選到酵母長壽的關鍵基因SIS2。

三、大腸桿菌Keio 基因敲除文庫（E. coli Keio Knockouts Collection）

Keio敲除文庫是經典的大腸桿菌基因文庫，包含大腸桿菌K-12中所有非必需基因的單基因敲除突變體。Keio敲除文庫由日本Keio大學先進生物科學研究所、日本奈良科學技術研究所和普渡大學合作開發。它不僅是系統功能基因組學的重要資源，也可作為許多反向遺傳學方法的工具。

【產品特點】

• 該庫涵蓋3985個基因，每個基因提供2個獨立的缺失菌株，共7970個克隆；

• 每個刪除的基因均被卡那霉素抗性基因取代，側翼帶有的FRT位點可被FLP重組酶識別并切除；

• 背景菌株：E.coli K-12 BW25113，常用的大腸桿菌基因敲除背景原型株

【經典案例】

Nucleic Acids Res. 2020 Jul 27;48（13）:7005-7017. doi: 10.1093/nar/gkaa346.

Escherichia coli YcaQ is a DNA glycosylase that unhooks DNA interstrand crosslinks

DharmaconTM的E.Coli Keio 菌株用于DNA損傷修復機制研究，發現大腸桿菌蛋白 YcaQ 是一種ICL （鏈間 DNA 交聯）修復糖基化酶， 其介導的 BER （堿基切除修復）是另一種 ICL 修復途徑。

Dharmacon?試劑品牌為DNA、RNA和蛋白質水平的研究人員提供廣泛的功能基因組工具，包括業界領先的基因調控和基因編輯解決方案，以幫助闡明基因功能研究的復雜生物網絡。Dharmacon?試劑品牌為您提供從單基因實驗到全基因組篩選的全套基因組解決方案，促進基因研究和治療發現的進步。作為合成寡核苷酸的主要供應商，Dharmacon?試劑已有近30年的歷史，是首家為RNAi提供算法設計合成siRNA的公司，也是首家為CRISPR-Cas9基因編輯應用提供引導RNA的公司。

北京達科為生物技術有限公司由深圳達科為公司于2008年投資創立。公司專注于生命科學科研試劑、儀器、耗材等科研用品的銷售。代理自主品牌（達優）和國際知名生物技術品牌140余家（獨家代理30余家，一級代理90余家），產品線涉及免疫學、細胞生物學、分子生物學試劑與耗材，在北京、上海，廣州，深圳等一線城市以及省會城市都設立了運營中心和分公司，達科為生物一直堅持“至臻品質 至善服務”的經營理念，是國內領先的生物試劑及儀器供應商。