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隨著歐洲十字軍東征，法蒂瑪帝國與塞爾柱帝國被趕出了巴勒斯坦地區，并于1099年建立耶路撒冷王國。這時巴勒斯坦地區成了伊斯蘭教與基督教爭奪的圣地。公元1291年，埃及馬木留克王朝的穆斯林軍隊消滅了耶路撒冷王國及所有的十字軍，徹底占領了巴勒斯坦。1516年奧斯曼土耳其帝國征服了埃及馬木留克王朝。從1516年直到第一次世界大戰末，巴勒斯坦地區一直是奧斯曼土耳其帝國的一部分。

第一次世界大戰結束后，奧斯曼土耳其帝國崩潰，英國占領了巴勒斯坦。1920年巴勒斯坦地區正式成為英國的保護地區。

經過1700多年的世界流浪，分居在世界各地的猶太人倍受各國的歧視、羞辱、迫害，因此猶太復國運動方興未艾。自19世紀末錫安主義興起后，猶太復國推動者積極尋求各國的支持。1917年，英國政府發布《貝爾福宣言》宣布支持猶太復國運動。同時在巴勒斯坦地區推動多次邀請猶太人回歸故土的運動，使得巴勒斯坦地區猶太人的比率不斷升高。到1917年，猶太人約占巴勒斯坦地區人口的9%，持有的土地占巴勒斯坦地區土地總面積的2.5%。

然而從公元638年以來，巴勒斯坦地區就被阿拉伯人視為傳統的領土。此時猶太人的大規模回歸故土運動對當地阿拉伯居民造成嚴重傷害，他們認為猶太人侵占了他們居住1000多年的土地。因而以阿沖突事件隨之升高。然而猶太復國運動已成不可阻擋的趨勢，加上英國等西方國家的表態支持，以及第二次世界大戰期間猶太人被屠殺600萬人，使得美國也支持以色列建國，以更好地保護多災多難的猶太人。

1947年在聯合國的建議下，在巴勒斯坦地區將分別建立一個猶太國家和一個阿拉伯國家。1948年5月14日以色列國正式成立，這導致了第一次中東戰爭的爆發。盡管新成立的以色列國十分孱弱，但是在世界各地的猶太人的支援下，特別是在蘇聯的暗中支持下，以色列取得了第一次中東戰爭的勝利，以色列的建國之戰以勝利告終。

由于阿拉伯各國不認同聯合國對巴勒斯坦地區土地的劃分比例，巴勒斯坦國并未同時建立。但是，巴勒斯坦解放組織成立后，阿拉伯國家聯盟和聯合國都將它視為巴勒斯坦人的合法的、唯一的代表。1988年11月15日，在阿爾及利亞首都阿爾及爾舉行的巴勒斯坦全國委員會第19次特別會議通過《獨立宣言》，宣布在巴勒斯坦土地上建立一個位于約旦河西岸及加沙地帶、首都為耶路撒冷的巴勒斯坦國。巴勒斯坦國至今已與世界上100多個國家建立外交關系。1993年9月13日，巴勒斯坦解放組織和以色列相互承認各自的國家地位。

2007年6月12日至14日，巴勒斯坦解放組織法塔赫與哈馬斯之間爆發沖突，造成巴勒斯坦國被分裂成兩個政權——哈馬斯控制加沙地區；巴勒斯坦解放組織法塔赫控制約旦河西岸地區。

2023年10月7日控制加沙地區的哈馬斯約1500名武裝人員突襲以色列，造成以色列大量無辜平民傷亡。隨后，以色列對加沙地區的哈馬斯進行了慘烈地、徹底地清除戰爭，哈馬斯與以色列的戰爭到今天為止仍在進行中。