1968年，上級調任擔任軍長的吳忠擔任北京衛(wèi)戍區(qū)第一副司令，成為副兵團職。

僅僅2年后，就提拔為衛(wèi)戍區(qū)司令，雖然只是正兵團職，比起大軍區(qū)、軍兵種副職來說職務低了一點，實際上職權可與大軍區(qū)、軍兵種主官比肩。

自1966年，北京衛(wèi)戍區(qū)擴編為兵團級單位，擔負的使命越來越重，列席重要會議都有衛(wèi)戍區(qū)主官的身影。衛(wèi)戍部隊直接由中央軍委以及總參下達任務，其他單位無權調動。即便是隸屬北京軍區(qū)也不行。

衛(wèi)戍區(qū)是保護在京老干部，擔負中央首長以及中央機關單位守衛(wèi)任務，還有首都的穩(wěn)定。

對于吳忠來說，直接接觸上層工作，各方面機密，尤其在特殊時期處理的更多。過去傅崇碧擔任衛(wèi)戍區(qū)司令兼北京軍區(qū)副司令，溫玉成擔任衛(wèi)戍區(qū)司令兼副總長。吳忠擔任不兼副總長，也不兼軍區(qū)副司令，只是正兵團職。

上級為何要這樣呢？

在傅崇碧去職時，被扣上山頭主義的帽子；溫玉成去職時，也因一些原因。這樣就形成一種情況，衛(wèi)戍部隊主官不要與其他有工作上的牽連，專注于警衛(wèi)工作。不讓兼任北京軍區(qū)副司令，或許不希望衛(wèi)戍區(qū)與軍區(qū)發(fā)生工作上的聯(lián)系，要保證衛(wèi)戍區(qū)在中央的直接領導下，

在吳忠擔任衛(wèi)戍司令7年里，做很多工作。這個職務不僅僅要有軍事頭腦，更要有政治頭腦，在紛繁復雜中，理清思路，如何保證正確方向并不容易。傅崇碧、溫玉成去職，也使得他在各方面工作上更機警。

也在特殊時候，做了一些不合適的工作。比如在1976年清明節(jié)發(fā)生的事件中，執(zhí)行了一些命令，對后來造成不小影響。1977年，隨著揭查批受到上級批評，并將其調離，派傅崇碧、吳烈進行整頓。

老戰(zhàn)友曾經遇到他，知道他身居要職，也提醒過不要被人利用。對此，他個人也是清楚的，有些在當時沒辦法拒絕。讓他去抓人，而且是被下達死命令，只能是執(zhí)行。吳忠是抵制的，但吳德也沒有辦法：這樣不行，你說該怎么辦？

如果廣場的人有幾十萬，如果都追查，打擊面太大，吳忠難以回避這項工作，必須具體指導這項工作，讓他陷入兩難境地。當四人幫被粉碎，他的問題也被提起來，最終被調去廣州軍區(qū)工作。1980年，對他下達命令免去職務，被審查8年，最終給予公正結論，是執(zhí)行問題。為他55年軍旅生涯畫上句號。