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大發現!Nature揭示男性腫瘤患者預后差的免疫機制!腫瘤+免疫更易發頂刊!

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當我們談論癌癥時,一個顯著的現象是:許多類型癌癥中,男性死亡率往往高于女性。例如,肝癌、頭頸癌等常見癌癥,男性患者的預后通常更差。究竟是什么導致了這種性別差異?2025年6月,Nature雜志發題為Concurrent loss of the Y chromosome in cancer and T cells impacts outcome 的研究論文,揭開關鍵線索:男性特有的 Y 染色體丟失(Loss of Y chromosome, LOY)可在腫瘤微環境中形成免疫陷阱,削弱關鍵的免疫細胞功能,加速癌癥進展。這項由美國 Cedars-Sinai 醫學中心團隊完成的研究,通過泛癌分析和小鼠模型實驗,首次系統性揭示了 LOY 在腫瘤細胞與免疫細胞間的 "聯動效應"。


Y 染色體丟失:男性體細胞中最常見的基因悲劇

LOY 并非罕見現象 —— 它是男性外周血單個核細胞(PBMC)中最常見的體細胞突變。隨著年齡增長,約 40% 的老年男性 PBMC 中會出現 LOY。此前研究已發現,PBMC 中的 LOY 與上皮癌死亡率升高相關,但機制尚不清楚。研究者首先構建 "Y 染色體轉錄特征"(YchrS),通過 9 個穩定表達的 Y 染色體基因(如 DDX3Y、KDM5D),精準預測腫瘤組織的 LOY 狀態。分析涵蓋 29 種人類腫瘤的 4127 個樣本后,他們發現:(1)LOY在惡性上皮細胞中高度普遍:且其發生率與患者年齡增長呈負相關,并存在顯著的種族差異(非裔美國患者腫瘤中的 LOY 水平最低)。(2)LOY是獨立的不良預后標志物:與保留完整Y染色體(WTY)的患者相比,LOY腫瘤患者的總生存期(OS)和疾病特異性生存期(DSS)顯著縮短,風險比(HR)分別高達 1.51 和 1.43 倍(圖1h)。這表明,LOY 不僅僅是衰老的伴隨現象,更是與腫瘤侵襲性直接相關。


為探究 LOY 驅動腫瘤進展的機制,研究者對 LOY 腫瘤細胞進行了單細胞測序和功能實驗。結果描繪出LOY如何為癌細胞“賦能”的圖景:(1)基因組不穩定性加劇:LOY 腫瘤表現出更高的腫瘤突變負荷(TMB) 和 腫瘤新抗原負荷(TNB),DNA 損傷修復相關通路(如同源重組修復HRD)異常激活,導致染色體不穩定性(CIN) 顯著增加(Extended Data Fig. 3)。(2)代謝重編程:LOY 上皮細胞表現出典型的 “瓦博格效應”(Warburg effect) 特征——上調糖酵解和缺氧相關通路,下調有氧呼吸和線粒體功能,為快速增殖的腫瘤細胞提供能量和生物合成前體(圖2e, f)。(3)免疫逃逸能力增強:LOY 細胞下調MHC-I類和II類分子的表達(圖2g),這使得它們能更有效地逃避 T 細胞的識別(“隱身”)。同時,它們還激活血管生成,上調多種免疫檢查點分子(如 PD-1, CTLA-4, LAG3, TIGIT) 表達,共同營造一個高度免疫抑制的腫瘤微環境(TME)(Extended Data Fig. 3h)。

在小鼠模型中,利用 CRISPR-Cas9 技術特異性敲除 Y 染色體關鍵基因產生的腫瘤細胞(Y-KO),表現出更強的增殖能力、干細胞特性和顯著的基因組變異,進一步在功能水平驗證了 LOY 對腫瘤惡性表型的直接促進作用。


這項研究最關鍵的發現在于揭示了 LOY 在腫瘤微環境(TME) 中的廣泛存在和細胞間的關聯:LOY 并非僅限于癌細胞本身,在腫瘤浸潤的免疫細胞,尤其是 CD4? 和 CD8? T 細胞中也廣泛存在 LOY,且其發生率與癌細胞中的 LOY 高度正相關(圖3)。

研究者分析 17 種上皮癌的單細胞數據后發現:(1) 非惡性細胞普遍存在LOY:包括免疫細胞(T細胞、B細胞、髓系細胞等)和基質細胞(成纖維細胞、內皮細胞)。(2) 惡性-良性細胞的LOY關聯:當腫瘤上皮細胞存在 LOY 時,其周圍的非惡性細胞(包括 T 細胞)也更有可能發生 LOY(圖3b)。這種關聯在人類數據和小鼠模型(BBN誘導的膀胱癌、皮下移植瘤模型)中均得到證實。(3) 直接證據:在人類膀胱癌組織樣本中,通過結合熒光原位雜交(FISH) 檢測 Y 染色體和 CD45 免疫組化(IHC) 標記免疫細胞,研究者直接在組織原位觀察到 CD45? 免疫細胞(圖3c)和 CD45? 非免疫細胞中都存在 LOY 的細胞核。(4) LOY 重編程 T 細胞。

LOY 對 T 細胞的功能產生了深遠而負面的影響(圖5):①CD4? T 細胞:LOY CD4? T 細胞高表達 免疫檢查點分子(如 PD-1, CTLA-4, LAG3, TIGIT) 和 共刺激分子(如 ICOS, TNFRSF9),其轉錄組特征強烈富集于 T 細胞耗竭(exhaustion) 和 調節性 T 細胞(Treg) 表型(圖5b,c),成為釋放抑制信號的“幫兇”。②CD8? T 細胞“失能”:與預期相反,LOY CD8? T 細胞下調了包括 PD-1、CTLA-4 在內的多個免疫檢查點分子、細胞毒性相關基因以及 T 細胞受體(TCR)信號通路基因的表達(圖5d,e),呈現出一種類似naive或功能失調的狀態,喪失了對腫瘤細胞的殺傷能力,無法有效執行抗腫瘤免疫反應。

這種在同一個腫瘤內發生的“腫瘤細胞 - T 細胞 LOY 聯動”,形成了一個惡性循環:癌細胞可能通過某種機制(如分泌因子或外囊泡)促進 LOY 免疫細胞浸潤,或者誘導浸潤的 Y? 免疫細胞發生 LOY;而功能嚴重受損的 LOY T 細胞(耗竭的 CD4? T 和無能的 CD8? T 細胞)又無力清除 LOY 癌細胞,最終導致免疫監視徹底崩潰,腫瘤進展失控,患者預后急劇惡化。


基于上述發現,研究者構建了一個整合上皮細胞、CD4 + 和 CD8+ T 細胞 LOY 狀態的預后模型。結果極具臨床價值:(1)獨立預后因素:LOYS?? 上皮細胞、CD4? T 細胞和 CD8? T 細胞特征均能獨立預測患者不良預后(OS風險比分別為 1.33, 1.66, 1.65),而對應的 WTYs?? 特征則具有保護作用。(2)協同惡化效應:當腫瘤同時存在上皮細胞 LOY 和 T 細胞(CD4? 或 CD8?)LOY 時,患者預后最差(圖5g)。例如,與僅上皮細胞高 LOY 的患者相比,上皮細胞和 CD8? T 細胞均高 LOY 的患者生存期顯著縮短。(3)預測工具(Nomogram):研究者開發了一個結合患者年齡以及上述三種 LOYS?? 特征評分的 列線圖(Nomogram)(圖5h)。該工具能較準確地量化預測患者 2 年、5 年和 8 年的死亡風險,為個體化預后評估和臨床決策提供了新的理論工具(其校準曲線顯示預測與觀察值吻合度良好)。


這一發現對癌癥免疫治療具有重大啟示:T 細胞中的 LOY 及其導致的深度功能抑制,可能是部分男性患者對 PD-1/PD-L1 抑制劑等免疫檢查點阻斷(ICB)療法響應率較低的潛在原因之一。未來,在治療前篩查患者腫瘤組織和/或外周血中的 LOY 狀態,可能成為優化男性癌癥患者(尤其是那些上皮細胞高LOY 的患者)治療方案(如選擇更積極的聯合治療或探索克服 T 細胞功能障礙的新策略)的關鍵步驟。此外,基于 LOY 狀態篩選或改造用于 TIL 療法或 CAR-T 療法的T 細胞也值得探索。


Loss of chromosome Y in primary tumors

LOY 是如何在腫瘤細胞與免疫細胞(特別是 T 細胞)之間傳遞的,是通過腫瘤源性外泌體,還是特定的細胞因子介導的 LOY 免疫細胞募集,還是細胞間接觸誘導,這是個有趣的問題。

另:作者將原始數據和代碼均已上傳,大家可以學習哦!

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