上海
撰文丨王聰
編輯丨王多魚
排版丨水成文
以連接組和空間轉錄組為代表的多組學研究已進入單細胞分辨率時代，這需要具備單細胞水平空間定位能力的參考腦圖譜。然而，現有的腦圖譜都沒能做到單細胞可見的空間定位。
2025 年 7 月 2 日，海南大學/華中科技大學駱清銘院士、龔輝教授及加州大學洛杉磯分校董紅衛教授團隊（豐釗為第一作者）合作，在國際頂尖學術期刊Nature上發表了題為：A mouse brain stereotaxic topographic atlas with isotropic 1 μm resolution 的研究論文。
該研究以 1 微米的各向同性分辨率繪制了小鼠三維腦區和立體定位圖譜，該圖譜可為大型腦圖譜項目提供數據分析和可視化支持，有望成為一種多功能腦科學工具，用于在單細胞水平上研究整個大腦。
在這項最新研究中，研究團隊通過連續微光學切片斷層成像技術，以各向同性 1 微米的分辨率呈現了一套基于尼氏染色的小鼠全腦細胞結構數據集。
通過整合多模態圖像，研究團隊構建了小鼠大腦三維參考圖譜——STAM，提供了 916 個結構的三維形貌，并能夠生成任意角度的 1 微米分辨率切片圖像。研究團隊進一步開發了一個基于信息學的平臺，用于可視化和共享圖譜圖像，提供諸如腦切片配準、神經元回路繪制和智能立體定向手術規劃等服務。該圖譜可與廣泛使用的立體定位圖譜兼容，支持在二維空間中對相應冠狀面進行跨圖譜導航，并在三維空間中實現圖譜空間的跨圖譜空間映射。
通過為大型腦圖譜項目提供數據分析和可視化支持，該研究開發的 STAM圖譜有望成為一種多功能的腦科學工具，用于在單細胞水平上研究整個大腦。
論文鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09211-8
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