CD8+T細(xì)胞豐度不足以評(píng)估抗腫瘤免疫，在預(yù)測(cè)乳腺癌預(yù)后和免疫治療反應(yīng)方面表現(xiàn)不佳，可能是由于CD8+T細(xì)胞功能的復(fù)雜性。雖然單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）可以剖析CD8+T細(xì)胞的多方面功能，以更好地評(píng)估其免疫功能，但其臨床應(yīng)用受到限制。

　　2024年12月23日，中山大學(xué)宋爾衛(wèi)及陳凱等團(tuán)隊(duì)合作在Cancer Immunology Research在線發(fā)表題為“Profiling Multiple CD8+T-Cell Functional Dimensions Enhances Breast Cancer Immune Assessment”的研究論文，該研究通過(guò)對(duì)scRNA-seq和匹配的整體RNA-seq數(shù)據(jù)的綜合分析，開(kāi)發(fā)了基于整體RNA-seq的FuncDimen模型，從5個(gè)方面評(píng)估CD8+T細(xì)胞的功能：腫瘤反應(yīng)性、細(xì)胞毒性、IFN-γ分泌、增殖和凋亡。

　　利用免疫熒光和成像細(xì)胞計(jì)數(shù)技術(shù)在乳腺癌隊(duì)列和外部數(shù)據(jù)庫(kù)中驗(yàn)證了量化CD8+T細(xì)胞不同功能維度的FuncDimen模型。研究人員通過(guò)對(duì)所有5個(gè)FuncDimen模型的加權(quán)聚合來(lái)計(jì)算FuncAggre評(píng)分，以概括整體抗腫瘤免疫。在乳腺癌隊(duì)列和外部數(shù)據(jù)庫(kù)中，F(xiàn)uncAggre評(píng)分在乳腺癌預(yù)后（曲線下時(shí)間依賴面積[AUC]: 0.56-0.70）和免疫治療反應(yīng)（AUC: 0.71-0.83）方面表現(xiàn)出優(yōu)于其他免疫生物標(biāo)志物的預(yù)測(cè)性能，無(wú)論乳腺癌分子亞型如何。總之，F(xiàn)uncDimen模型在臨床中提供了CD8+T細(xì)胞介導(dǎo)的抗腫瘤免疫的精細(xì)評(píng)估，增強(qiáng)了乳腺癌的預(yù)后預(yù)測(cè)和幫助個(gè)性化免疫治療。

　　另外，2024年12月25日，iNature總結(jié)了2024年中山大學(xué)宋爾衛(wèi)團(tuán)隊(duì)在Nature，PNAS及Cell子刊等發(fā)表了10篇文章。

　　CD8+T細(xì)胞在腫瘤免疫中的關(guān)鍵作用，提示了評(píng)估CD8+T細(xì)胞豐度的潛在臨床價(jià)值。然而，CD8+T細(xì)胞豐度在乳腺癌預(yù)后和免疫治療反應(yīng)中的預(yù)測(cè)價(jià)值在不同的研究中有所不同，表明僅豐度不足以評(píng)估CD8+T細(xì)胞介導(dǎo)的抗腫瘤免疫。每個(gè)CD8+T細(xì)胞在關(guān)鍵功能維度上表現(xiàn)出不同的活性，如細(xì)胞毒性、IFN-γ分泌、腫瘤反應(yīng)性、增殖和凋亡，共同促進(jìn)抗腫瘤免疫。因此，定量、全面地分析CD8+T細(xì)胞的多個(gè)功能維度可能更直接、更好地評(píng)價(jià)抗腫瘤免疫。

　　單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）已成為分析CD8+T細(xì)胞多個(gè)功能維度的有前途的工具。然而，由于scRNA-seq的成本高、樣品處理復(fù)雜，其臨床應(yīng)用受到限制。在臨床環(huán)境中，Bulk RNA-seq具有更多的優(yōu)勢(shì)和應(yīng)用。然而，目前尚不清楚BulkRNA-seq是否可以用于量化CD8+T細(xì)胞的多個(gè)功能維度，以更好地進(jìn)行免疫評(píng)估。

　　研究設(shè)計(jì)概述（圖源自Cancer Immunology Research）

　　該研究開(kāi)發(fā)了基于RNA序列的大量模型，稱之為FuncDimen模型，以描述CD8+T細(xì)胞的多個(gè)功能維度，包括腫瘤反應(yīng)性、細(xì)胞毒性、IFN-γ分泌、增殖和凋亡。該研究證明了所有5種FuncDimen模型的加權(quán)聚集（FuncAggre評(píng)分）可以更好地評(píng)估CD8+T細(xì)胞介導(dǎo)抗腫瘤免疫的整體能力，并更好地預(yù)測(cè)乳腺癌預(yù)后和免疫治療反應(yīng)。

　　該研究還使用FuncDimen模型來(lái)探索不同藥物的免疫調(diào)節(jié)作用，并預(yù)測(cè)潛在的免疫誘導(dǎo)策略以增強(qiáng)免疫治療反應(yīng)。總的來(lái)說(shuō)，該研究已經(jīng)建立了基于RNA序列的FuncDimen模型可以在臨床中識(shí)別免疫治療應(yīng)答者，并有助于個(gè)性化免疫治療。