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《自然》子刊:針對癌細胞致命弱點,創新小分子有望克服癌癥耐藥性難題

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▎藥明康德內容團隊編輯

編者按:染色體不穩定性(CIN)是癌細胞的一個普遍特征,這一特性不僅驅動了腫瘤的異質性和進化,也成為了其特有的弱點。然而,盡管這一特性在癌癥生物學中具有重要意義,其在臨床治療中的應用潛力尚未得到充分開發。近期,來自Volastra Therapeutics的研究團隊在《自然-通訊》(

Nature Communications
)發表研究論文,開發了一種靶向小分子抑制劑VLS-1272,為針對CIN的新型抗癌策略提供了重要的理論依據和治療工具。在該論文中, 藥明康德為研究團隊提供了體內藥理分析服務。


KIF18A:癌癥治療潛在靶點

在細胞分裂過程中,遺傳物質的精確分離對生物體的生存至關重要。然而,染色體分離錯誤會導致遺傳物質分配不均,這種現象被稱為染色體不穩定性(CIN)。CIN在大多數人類癌癥中普遍存在,與多種實體瘤和血液腫瘤的發生發展密切相關。具體而言,CIN不僅增加了腫瘤的異質性,還可能導致腫瘤對標準治療藥物產生耐藥性,并促進癌癥的轉移進程。因此,開發針對CIN的治療策略具有重要的臨床意義,不僅有望延長患者的生存期,還可能通過克服藥物耐藥性為癌癥治療帶來廣泛的益處。

在這項研究中,研究人員利用癌癥依賴性圖譜(DEPMAP)數據庫,對細胞系的CIN進行量化并分級。基于這一分析,研究團隊發現,KIF18A在高CIN細胞中表現出更高的必需性。結合本研究的數據以及既往發表的機制研究和實驗證據,KIF18A被確立為CIN相關癌癥的潛在治療靶點。

為了評估CIN細胞對KIF18A的依賴性,研究人員構建了CIN細胞系模型,并且敲除了KIF18A。實驗結果顯示,KIF18A缺失顯著抑制了高CIN細胞的增殖,且這種抑制作用在高CIN細胞中更為明顯。這一結果與DEPMAP數據庫的分析一致,進一步證實了高CIN細胞對KIF18A缺失的高度敏感性。

為了驗證這一發現的普適性,研究人員在乳腺癌細胞系中進行了進一步實驗。結果表明,在不同CIN水平的乳腺癌細胞中,降低KIF18A表達均能抑制細胞增殖,且抑制程度與細胞的CIN基線水平呈正相關。在高CIN水平的乳腺癌細胞中,KIF18A敲低不僅顯著抑制細胞增殖,還導致G2/M期細胞比例增加。這些數據表明,細胞通過在有絲分裂期停滯來響應KIF18A的缺失。


圖片來源: 123RF

為了進一步評估KIF18A在腫瘤生長中的作用,研究人員將表達對照質粒或KIF18A shRNA質粒的腫瘤細胞植入免疫缺陷小鼠體內,這些腫瘤細胞分別接受或不接受強力霉素(Dox)處理。實驗結果顯示,與植入轉染對照質粒的細胞或未接受Dox處理的小鼠相比,經Dox處理且KIF18A shRNA誘導的腫瘤細胞的生長顯著延遲。此外,對腫瘤樣本的分析證實了KIF18A的有效敲低。這些體內實驗結果表明,CIN腫瘤細胞在體內生長過程中高度依賴KIF18A,進一步支持了KIF18A作為CIN相關癌癥治療靶點的潛力。

VLS-1272:新型KIF18A靶向抑制劑

為了進一步評估KIF18A作為治療靶點的潛力,研究人員開發并運行了一個高通量篩選平臺,旨在尋找能夠抑制KIF18A的ATP酶活性的小分子化合物。通過對一個包含5萬種類先導化合物的庫進行篩選,研究人員重點針對KIF18A馬達結構域(氨基酸1-374)的微管依賴性ATP酶活性進行抑制劑的篩選。經過多輪藥效學和藥代動力學性質的優化,最終獲得了候選化合物VLS-1272。


VLS-1272的分子結構(圖片來源:參考資料[1])

VLS-1272具有一系列優異的特性,包括口服生物利用度高、效力強、非ATP競爭性、微管依賴性以及對KIF18A的高度選擇性(相較于其他驅動蛋白)。該化合物能夠強效抑制KIF18A的ATP酶活性,并阻止KIF18A在有絲分裂紡錘體上的轉移,從而導致染色體集合缺陷、誘導有絲分裂停滯與細胞死亡。這些作用機制表明,VLS-1272是一種具有潛力的KIF18A靶向抑制劑,為CIN相關癌癥的治療提供了新的方向。

基于在100多種癌細胞系中對VLS-1272的分析結果,VLS-1272展現出對CIN癌細胞的特異性抑制作用,這一特性顯著區別于其他處于臨床開發階段的抗有絲分裂藥物。在腫瘤異種移植模型中,VLS-1272治療誘發了顯著的有絲分裂缺陷,并以劑量依賴的方式抑制了腫瘤生長。研究人員進一步證明,無論是通過遺傳學手段敲低KIF18A,還是通過藥物抑制其活性,均能有效抑制腫瘤生長。這些數據共同揭示了KIF18A抑制劑在臨床治療中的潛在價值。

綜上所述,本研究揭示了KIF18A抑制劑通過靶向CIN來抑制腫瘤生長的新策略。作為一種廣泛存在于惡性腫瘤中的特征,CIN通過克隆異質性驅動癌癥轉移并加速耐藥突變演化。靶向抑制KIF18A能夠選擇性清除具有高水平CIN的腫瘤細胞,破壞其適應性生存優勢,從而延緩耐藥表型產生。作為一款新型KIF18A抑制劑,VLS-1272在臨床前模型中展示出了顯著的抗癌效力。其獨特優勢在于不影響T細胞增殖,這為其與免疫檢查點抑制劑的聯合應用提供了可能。展望未來,研究人員將進一步探索KIF18A抑制的臨床潛力,為CIN相關癌癥的治療開辟新的方向。

參考資料:

[1] Phillips, A.F., Zhang, R., Jaffe, M. et al. Targeting chromosomally unstable tumors with a selective KIF18A inhibitor.

Nat Commun
16, 307 (2025). https://doi.org/10.1038/s41467-024-55300-z

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