抗戰勝利后，冀熱遼軍區下達進軍東北的命令，李運昌部兵分三路，曾克林率領的中路四千多人率先抵達東北進入沈陽。在與蘇軍交涉下，開始擴編部隊。

從1945年9月進入沈陽以后，曾克林以12團為基礎，在沈陽、本溪進行擴編，組建三個團，改編為十六軍分區21旅，下轄1.3萬人 ；在錦州，以18團為基礎，擴建6個團以及五個直屬營，成立十六分區22旅，下轄1.5萬人。后來22旅一分為二，調出三個團組建30旅。

在鞍山，在遼陽，在營口，在四平、昌圖、康平，各組建一個團；在綏中、梅河口一帶，發展4個團，組建24旅，1.4萬人，截止1945年底，李運昌三路部隊發展12個旅2個支隊，十幾個獨立團，11萬多人，其中16分區將近8萬人。

李運昌部隊入關前三路部隊不過萬余人，僅僅四個月左右，就擴編10倍。我們知道抗戰結束后，上級調山東軍區主力，新四軍3師，以及南下支隊還有延安的干部等進入東北，干部2萬，兵力才11萬人。

如此輕而易舉擴編的部隊，實際上成分復雜，有過去日偽時期憲、軍、警等。盡管部隊進行整編，但進入東北的工作很多，思想整頓、改造等一時無暇顧及。當國民黨軍運兵抵達東北后，占領山海關、錦州，以及我軍撤出大中城市等情況，就出現成建制的倒戈，叛變，使得部隊受到損失。此后的擴軍方式進行改編，不招兵買馬，不成建制改造，更多是發動群眾，翻身農民參軍，保障隊伍的純潔度。不過，這些都是后話了。

在1946年1月，東北部隊劃分四個二級軍區，東滿、西滿、南滿、北滿。曾克林擴編的8萬人，一部編入3縱，其他部隊編入4縱等其他部隊一些。對于曾克林率先抵達東北的貢獻，上級給予肯定，在職務上得到提拔，擔任南滿軍區副司令。

南滿軍區下轄3縱、4縱，以及三個省軍區，他這個職務并不低。

隨著作戰形式發生變化，1946年10月上級改組遼東軍區（南滿軍區），蕭勁光擔任司令，陳云為政委，肖華為副司令兼副政委，程世才不兼3縱司令，專職擔任遼東軍區副司令，曾克林改降3縱司令。程世才不擔任縱隊司令，或許因四平保衛戰，一個縱隊沒有擋住敵人一個團的沖擊有關。

曾克林領導3縱經歷四保臨江作戰，可在師長徐國夫的回憶中，曾克林在四次作戰中的作用不大，前2次保衛戰由蕭勁光直接指揮，第三次各師各自為戰，第四次雖然名義上是總指揮，實際上是韓先楚指揮，因為作戰方案是韓提出來的。

四保臨江后，部隊進入從防御到進攻的狀態，1947年秋，他被調離3縱，韓先楚接替司令。他去了哪里呢，回憶錄寫到：1948年3月離開3縱去了遼南軍區擔任司令。也就是說在1948年3月之前，就沒有離開過3縱，這顯然與韓先楚調任3縱司令相沖突。（估計是記錯離開時間）

在遼南軍區幾個月，上級調他到7縱擔任副司令，回憶說：上級本來讓他擔任司令，讓鄧華提拔為兵團司令，可計劃落空，自己無故從縱隊級正職改降為副職。

在擔任副司令時，經歷遼沈戰役、平津戰役。天津攻堅戰結束后，上級讓他改為戰車師師長，軍職待遇，職務又無故降低一級。本來要南下作戰， 考慮南方水網不利于機械化作戰，就留下。

從職務來說，大多數將領職務隨著戰績越來越高，他恰恰相反，越來越低。

不過，在1952年的評級中，并沒有受到影響，評為正軍級。一般情況下，像他這樣的資歷，授予中將不為過，或許因為資歷有了，戰績不突出的緣故。

東野首長用人特點是，能打者上，不能打者下。幾個縱隊中，不僅是他從縱隊被換下來過，萬毅、段蘇權等也有這樣的經歷。

解放后的他，做了一件事是很多開國將領沒有的，進入航空學校完成軍事理論，以及駕駛飛機升空考核。成為將領中少有會開飛機的，長期在海軍航空兵任職。