大家每年都會體檢,測測血脂血糖,看看代謝是不是健康,再測測腫瘤標志物,看看有沒有患腫瘤的風險,但有沒有想過,基因才是生命本源,大多數(shù)的腫瘤和老年病由基因突變累積造成。但為啥我們對自己的基因健康狀況一無所知?又為啥體檢里沒有這一項?
這是因為基因突變本身太過復雜、檢測手段還不夠“高明”嗎?確有這方面的原因,比如一些傳統(tǒng)檢測只能給基因“拍個照”,告訴我們當時的基因突變情況,但卻無法解釋它們是昨天剛出現(xiàn)的,還是幾十年來緩慢積累的。
對此,最近新發(fā)表的一項國外研究給基因檢測領(lǐng)域狠狠長了臉,該研究首次利用先進的長讀長測序技術(shù)揭示了體細胞突變在時間維度上的動態(tài)變化軌跡。什么!基因突變可能發(fā)生在幾個月內(nèi)?還可能是自己“作”出來的?你不知道的都在這里了[1]!
與以往更多聚焦于表觀遺傳變化(如DNA甲基化)的研究不同,本研究將注意力轉(zhuǎn)向了體細胞突變。
體細胞突變是指我們體內(nèi)的非生殖細胞在生命周期中不斷分裂復制時,其基因組DNA序列發(fā)生的永久性變化。這類突變不影響生殖細胞,因此不會遺傳給后代,但可能在個體生命周期內(nèi)積累并產(chǎn)生深遠的影響。
圖注:體細胞突變和生殖系突變
體細胞突變類型包括單核苷酸變異(SNVs,表征本研究中的體細胞突變)、小片段插入/缺失和結(jié)構(gòu)變異等。這些突變可能是細胞自然老化的結(jié)果,也可能受外部環(huán)境、生活方式、以及個體DNA修復能力等因素的影響。
體細胞突變與衰老密切相關(guān)。
多項研究證實,衰老相關(guān)jb如老年癡呆、心血管病等早在其臨床癥狀出現(xiàn)前數(shù)年乃至數(shù)十年,相關(guān)的體細胞突變就已開始出現(xiàn)并積累。此外,加州大學圣地亞哥分校研究表示,表觀遺傳時鐘所反映的可能并不是衰老的直接機制,而是體細胞突變所引發(fā)的后果[2]。
因此,觀察體細胞突變的積累及其變化軌跡,是理解衰老時值得關(guān)注且不可忽視的重要維度。
103位健康人和ai癥患者參與了本次研究,研究通過縱向收集(研究期間對參與者多次采集,間隔因參與者而異,每次不超過10毫升)他們的血液樣本,用于全基因組測序分析,以監(jiān)測體細胞突變的動態(tài)變化。
然后,研究者報告了此次研究的結(jié)果:
NO.1 每年新增2.6個基因突變
研究人員先證實,體細胞單核苷酸變異(sSNVs)的數(shù)量的確會隨著人的一生而增加。他們測量了277個血液樣本中的sSNVs數(shù)量,并將這些數(shù)據(jù)與每個人的年齡進行了對比。
結(jié)果發(fā)現(xiàn)了一個明顯的規(guī)律:隨著年齡的增長,在外周血樣本中測到的所有體細胞DNA中可識別出的sSNVs總數(shù),平均每年比上一年多2.6個,且這與個體有沒有jb沒有關(guān)系。
圖注:體細胞單核苷酸變異(sSNVs)的數(shù)量與個體年齡之間的關(guān)系
這和另一項43000人的血液基因組分析結(jié)果相似,該研究發(fā)現(xiàn),隨著年齡增長,年紀越大的人的血液中某些基因位點反復出現(xiàn)錯誤的次數(shù)更多[3]。
NO.2 不同功能區(qū),突變頻率不同
在整個基因組中,由于不同的壓力,不同功能區(qū)域可能會以不同的頻率積累突變。
研究發(fā)現(xiàn),在基因組的功能關(guān)鍵區(qū)域(如蛋白質(zhì)編碼區(qū))體細胞突變頻率最低,因為細胞有更強的機制去避免這些區(qū)域出錯。而在功能相對“寬松”的區(qū)域如內(nèi)含子和基因間區(qū),突變則更常見。
具體到sSNVs的類型,對細胞影響較小的沉默突變(不改變蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的變異)頻率較高,而對細胞可能有害的錯義突變(改變蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu))的頻率在不同個體之間差異顯著,提示其更易受到個體DNA修復能力等因素的影響。
圖注:體細胞單核苷酸變異在基因組不同功能區(qū)域中的中位數(shù)等位基因頻率
NO.3 個別突變類型,快到按“月”可見
過去,人們普遍認為,基因?qū)用娴淖兓ㄈ缤蛔儯┦且浴澳辍鄙踔痢皵?shù)十年”為單位緩慢累積的過程。但研究人員發(fā)現(xiàn),體細胞中的不同突變類型,其出現(xiàn)速度并不相同,而是各有“節(jié)奏”。
比如,兩類與衰老密切相關(guān)的突變類型——SBS5和SBS1,它們的數(shù)量在短短幾個月內(nèi)就可以明顯增加,且能被清晰地追蹤到。其中,SBS5是一類會隨年齡穩(wěn)定增長的突變類型,SBS1則是由DNA自發(fā)脫氨基引起的一種突變類型,也隨年齡增長而逐漸積累。
圖注:特定突變特征隨時間的變化
這表明,由于基因本身的突變積累,以及攜帶突變的細胞克隆擴增,某些特定突變類型(如SBS5和SBS1)的變化也可能和血壓和血糖一樣,成為一個波動的動態(tài)指標。
NO.4 突變類型,反映“衰老元兇”
最后,研究提示,sSNVs的不同突變類型,還能幫助溯源!通過分析基因里的突變類型,他們發(fā)現(xiàn)某些突變類型可能揭示了最初驅(qū)動衰老的“壓力來源”。
例如,一些樣本中檢測到的SBS7a/7b/7c突變類型,SBS6、SBS30和SBS44突變類型,以及SBS4和SBS92突變類型,它們分別與紫外線暴露、DNA修復機制的缺陷和吸yan相關(guān)。
圖注:在不同樣本中檢測到的COSMIC單堿基替換特征(如SBS1、SBS5、SBS7a/7b/7c等)的分布情況
這告訴我們,對體細胞基因突變了解的越全面,我們就越有能力去區(qū)分哪些基因損傷是不可避免的“自然折舊”,又有多少是自己“作”出來的,從而更好地應對衰老。
盡管目前,先進技術(shù)引領(lǐng)人類對自身基因健康的掌握還有很長的路要走,本研究也只是拉動了一小丟丟進度條。但假如,未來真能普及個體的基因檢測服務,我們的生活會發(fā)生哪些變化呢?
NO.1 更牛X的體檢報告長這樣
除了目前常規(guī)的報告項,未來的體檢報告上可能還會多出這樣幾項:
- 基因組損傷指數(shù):您體細胞基因的整體穩(wěn)定性可打80分,總體較穩(wěn)定,繼續(xù)保持;
- 基因突變增加率:您過去6個月突變了240個位點,高于同齡人均值,建議留心;
- 基因損傷來源分析:基于該餅圖,您基因損傷的自然衰老原因占40%,生活方式占…;
- 基因修復效率評分:您的細胞發(fā)生突變后,DNA修復系統(tǒng)較弱,建議……;
NO.2 即時的基因組層面反饋
如果能持續(xù)掌握基因突變的動態(tài)變化,衰老將是一個可以實時干預和評估的過程。
一方面,它可以幫助我們評估生活方式干預是否“落實到分子層面”,比如堅持地中海飲食后,某些與yan癥或代謝相關(guān)的突變是否減少了?戒yan了,SBS4和SBS92突變速率是否放緩了?
另一方面,它也可能成為抗衰產(chǎn)品的“照妖鏡”。抗衰補劑實踐結(jié)合來自身體基因?qū)用娴姆答仯蛟S能幫我們找到最佳的那款抗衰產(chǎn)品,不再交“智商稅”。
當然,不是所有有效的抗衰干預都必然在“基因突變層面”產(chǎn)生顯著變化,但這會是我們未來可能會用到的一種手段。
NO.3 重大病癥,提前知曉
當大多數(shù)老年病還只在幾個不聽話的細胞階段準備搞事情時,B超、CT根本看不見。
但如果你的體細胞基因突變頻率在沒有明顯原因的情況下持續(xù)異常飆升,這可能第一時間提示我們潛在的衰老風險,這種“基因級別的提早預警”,能讓我們在病癥尚未成形前就及時干預,真正做到“防老于未然”。
圖注:衰老相關(guān)病
理想是豐滿的,現(xiàn)實當然也“挺骨干”的。現(xiàn)在要把這類檢測做到常規(guī)體檢中,還有不少難題沒解:成本高、標準不一、怎么解讀說清楚也挺難……
但在科技加速、多個“老化指標”不斷被提出、驗證、融合的背景下,我們已經(jīng)看到了突破的可能。“基因健康體檢”的門雖然還沒敞開,但已經(jīng)撬開一條縫了,接下來就是時間的問題。
—— TIMEPIE ——
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參考文獻:
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