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PNAS丨開發偏向性化學空間重塑方法設計靶向APLNR的特異性小分子偏向性激動劑

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超過一半的心衰患者為 射血分數保留型心力衰竭( HFpEF ),臨床 治療措施極為有限 。 深入探索其發病機制并開發精準干預策略, 是 心血管 疾病 研究領域的迫切需求。 G 蛋白偶聯受體( GPCR )調節人體眾多的生理和病理功能, 如 糖脂代謝穩態、炎癥反應等,是目前最主要的藥物靶標。 Apelin 受體( APLNR )是 A 類 GPCR 家族成員。 上海科技大學徐菲教授團隊 突破性證實 Apelin 受體是 A 類 GPCR 家族中首個通過二聚體形式介導信號傳導的成員,為心血管疾病靶向藥物研發提供了關鍵結構基礎【1】;同 時,徐菲教授團隊也 系統解析 了 Apelin 受體單體與二聚體的結構特征,首次 揭示 G 蛋白偶聯受體二聚化對配體識別及信號傳導的調控機制【2】。 Apelin 是 A PLNR 的內源性配體,可同時激活 APLNR 下游的 G 蛋白和β -arrestin 信號通路,在心血管系統功能調節中發揮著關鍵作用。內源性配體 apelin 誘導的心臟保護效應主要歸因于 APLNR 的 G 蛋白信號,而β -arrestin 信號的激活反而引起有害的心肌肥厚。 2024 年 3 月,浙江大學張巖教授團隊與北京大學 張巖教授 合作在 Cell 期刊 發表研究,通過冷凍電鏡解析 APLNR 與不同配體的復合物結構,首次設計出絕 對 G 蛋白選擇性的多肽激動劑 WN561 ,并在后續動物實驗中發現 相比于已有活性分子, WN561 對心肌肥厚表現出良好治療效果,并且能夠顯著降低潛在不良反應【3】 。 然而值得注意的是,目前全球范圍內尚未報道具有顯著 G 蛋白偏向性的小分子 APLNR 激動劑。 因此, 開發兼具高 G 蛋白偏向性與優化藥代動力學特性的小分子化合物 , 有望 為 HFpEF 提供新的治療措施 。

近日,四川大學歐陽亮李濤郭應強顏微、孫秋研究團隊 在PNAS雜志 在線發表 了 題為Multiscale biased chemical space remodeling for developing APLNR agonists with anti-HFpEF efficacy的研究論文。該研究發了一種偏向性化學空間重塑方法,基于受體分子藥理學機制,設計靶向APLNR的特異性小分子偏向性激動劑其中,新型活性分子AP-7在具備絕對Gi蛋白偏向性功能的同時HFpEF現出良好治療效果,包括改善心肌舒張功能,降低血壓,減少心肌纖維化等,并顯著降低β-arrestin信號相關不良反應,為靶向APLNR的改善心血管疾病的藥物開發提供了全新策略和理論基礎


首先, 為設計 APLNR 新型小分子激動劑, 研究團隊創新性提出了多尺度偏向性化學空間重塑策略,結合分子動力學模擬、 Split-and-Mix 片段基化學信息學策略及多參數優化技術。研究團隊基于已知的 APLNR 激動劑 CMF-019 的骨架結構,通過解析其與 APLNR 形成的復合物高精度結構,并結合分子動力學模擬技術,深入剖析了 CMF-019 與 APLNR 的結合模式及其動態相互作用機制。隨后,利用 Split-and-Mix 策略,對 CMF-019 的分子骨架進行了精細拆分,獲得了多個具有潛在藥效團特征的小片段。通過系統地組合這些片段,并借助計算機輔助藥物設計技術,團隊成功構建了一個結構新穎、多樣性豐富的化合物庫,拓展了藥物分子的化學空間。最后,通過高通量篩選和體外活性測試,成功篩選出具有優異 G 蛋白信號通路激活能力和完全 β-arrestin 信號通路抑制能力的 AP-7 與 AP-16 激動劑。這兩種激動劑不僅展現出了對 APLNR 的高效激活能力,更重要的是,它們表現出完全的 G 蛋白信號通路偏向性,即能夠特異性地激活 G 蛋白信號通路,同時完全抑制 β -arrestin 信號通路的激活。


接著 ,研究團隊在離體細胞水平,對 新研發的 APLNR 偏向性激動劑 AP-7 / AP-16 以及現有的平衡激動劑和部分 G 蛋白偏向性激動劑(如 CMF-019 )進行功能篩選和驗證。實驗數據顯示,在常規培養條件下, Apelin 與 CMF-019 可顯著誘導心肌細胞肥大表型 ,而 AP-7 / AP-16 并不影響其基線狀態 。 進一步,研究團隊通過 巨噬細胞條件培養基( MCM )聯合異丙腎上腺素( ISO ) 模擬在體 HFpEF 模型 ,研究 AP-7 /AP-16 在病理狀態下 的作用。實驗結果顯示, Apelin 與 CMF-019 雖能 改善心肌細胞活性和線粒體功能,降低 心肌損傷標志物水平,但 是會促進 心肌細胞肥大。相比之下, AP-7 /AP-16 不僅 有效改善 心肌 細胞 損傷指標,同時并 不增加 誘發心肌肥大 風險 。 因此, 新型偏向性激動劑 AP-7 /AP-16 在有效 改善 HFpEF 細胞表型的同時, 成功規避了 引發 心肌肥厚 的 不良反應,展現出獨特的保護特性。

進一步, 為了探究 AP-7 /AP-16 對正常飼養小鼠和 HFpEF 小鼠的影響, 研究團隊通過腹腔注射給藥方式,以 20 mg/kg/day 的劑量對小鼠進行為期兩周的處理 。 結果顯示,正常小鼠在接受 Apelin 和 CMF-019 處理后會導致小鼠心肌肥厚,而 AP-7 /AP-16 處理的小鼠無明顯變化。 接著,在 高脂飲食聯合 L-NAME 誘導的 HFpEF 小鼠模型進行驗證, 發現 僅 AP-7 在該模型中表現出多維治療優勢 , 可降低 HFpEF 小鼠血壓、改善運動耐受能力、肺水腫、心臟舒張功能 、心肌肥大 和心肌纖維化 等 , 提示 AP-7 可 作為 HFpEF 新型治療藥物的臨床應用潛力。

綜上所述,該項研究 采用多維度化學空間重塑的設計策略,結合結構 - 功能關系、基于 Split-Mix 策略的虛擬庫的構建和虛擬篩選以及定向化學空間修飾,成功設計并合成新型 APLNR 偏向性激動劑 AP-7 。 并通過 體內外實驗證實 AP-7 可顯著改善 HFpEF 病理表型,揭示 APLNR 作為潛在治療靶點的價值,為開發 HFpEF 創新療法提供依據。

https://doi.org/10.1073/pnas.2423432122

制版人:十一

參考文獻

1. Yue, Y., Liu, L., Wu, L.J., Wu, Y., Wang, L., Li, F., Liu, J., Han, G.W., Chen, B., Lin, X., et al. (2022). Structural insight into apelin receptor-G protein stoichiometry.Nat Struct Mol Biol29 , 688-697. 10.1038/s41594-022-00797-5.

2. Yue, Y., Liu, L., Wu, L., Xu, C., Na, M., Liu, S., Liu, Y., Li, F., Liu, J., Shi, S., et al. (2025). Structural insights into the regulation of monomeric and dimeric apelin receptor.Nat Commun16 , 310. 10.1038/s41467-024-55555-6.

3. Wang, W.W., Ji, S.Y., Zhang, W., Zhang, J., Cai, C., Hu, R., Zang, S.K., Miao, L., Xu, H., Chen, L.N., et al. (2024). Structure-based design of non-hypertrophic apelin receptor modulator.Cell187 , 1460-1475 e1420. 10.1016/j.cell.2024.02.004.

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