衰老是生物體多系統功能減退的復雜過程,其分子機制研究一直是生物學領域的核心挑戰。
環狀RNA(circRNA)作為近年來生命科學研究的熱點,被證實與神經退行性疾病、心血管疾病、癌癥等多種衰老相關疾病的發生發展密切關聯。
針對衰老相關circRNA研究資源缺乏的現狀,中國科學院昆明動物研究所構建了CircAge數據庫(www.circage.org),聚焦解析circRNA在衰老進程中的動態表達特征、潛在生物學功能及其調控機制,為衰老機制的深入研究和轉化應用奠定堅實的資源基礎。
▲CircAge數據庫主要內容與功能
01
跨物種多維解析
CircAge數據庫專注于circRNA在衰老過程中的表達變化,采用“大數據+多物種”策略,整合了人類、獼猴、小鼠、大鼠、果蠅、線蟲及斑馬魚等7個物種、24種組織、涵蓋多個關鍵時間點的803個公共樣本數據。
通過嚴格的質控與標準化處理,數據庫系統整合了超過52萬個circRNA,構建了目前最全面的衰老相關circRNA跨物種表達圖譜。
數據庫提供多維度的功能注釋信息,支持科研人員從多個角度深入解析circRNA的潛在生物學作用,包括:
時序表達趨勢分析:追蹤衰老進程中的動態變化
調控網絡預測:識別miRNA及RNA結合蛋白(RBP)作用靶點
跨物種保守性分析:分析核心circRNA的演化規律
編碼潛能評估:挖掘功能性多肽的翻譯潛力
基于上述多維注釋信息,數據庫構建了circRNA-調控因子(miRNA/RBP)交互網絡,為深入理解其調控機制提供關鍵線索。
▲CircAge數據處理流程
02
推動衰老生物學持續發展
CircAge數據庫提供了可視化界面與高效搜索功能,支持用戶按物種、組織、基因等多種條件檢索相關circRNA信息。
同時提供調控網絡圖、功能預測結果及表達分布圖等豐富的數據資源,方便研究者獲取與分析研究結果,有助于推動circRNA在衰老生物學與相關疾病研究中的應用。
作為首個專注于衰老相關circRNA的專業數據庫,CircAge數據庫為衰老調控機制研究、生物標志物發現及治療靶點篩選提供了重要支撐。
未來,研究團隊將持續更新數據庫內容,整合更多物種和組織數據,不斷完善功能模塊,推動circRNA在衰老生物學和臨床研究中的轉化應用。
來源:中國科學院昆明動物研究所
責任編輯:王穎
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